More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4511 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  77.94 
 
 		 606 aa  910    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  100 
 
 		 612 aa  1190    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  49.03 
 
 		 611 aa  519  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1035  ABC transporter related protein  45.59 
 
 		 619 aa  426  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00381243  normal  0.0281832 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  41.57 
 
 		 598 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4420  ABC transporter permease/ATP-binding protein  46.29 
 
 		 605 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  42.56 
 
 		 578 aa  398  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  43.69 
 
 		 603 aa  393  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  39.19 
 
 		 588 aa  388  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2596  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  42.73 
 
 		 597 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.588652  normal  0.0388843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  48.39 
 
 		 596 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  39.37 
 
 		 597 aa  366  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3091  ABC transporter related  39.21 
 
 		 624 aa  354  2e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  33.16 
 
 		 592 aa  340  5.9999999999999996e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  38.43 
 
 		 600 aa  325  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11378  drug ABC transporter ATP-binding protein  37.87 
 
 		 859 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  34.76 
 
 		 590 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  35.5 
 
 		 593 aa  319  9e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  33.81 
 
 		 597 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  33.16 
 
 		 611 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0843  ABC transporter component  36.97 
 
 		 577 aa  310  5e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00459321  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.09 
 
 		 573 aa  309  1.0000000000000001e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  33.98 
 
 		 580 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  37.8 
 
 		 604 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.4 
 
 		 581 aa  300  3e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  29.5 
 
 		 587 aa  299  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  29.5 
 
 		 587 aa  299  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  36.58 
 
 		 618 aa  298  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.68 
 
 		 589 aa  298  2e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  34.64 
 
 		 584 aa  296  6e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  30.94 
 
 		 599 aa  296  1e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.25 
 
 		 593 aa  294  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  35.85 
 
 		 606 aa  293  5e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  31.87 
 
 		 602 aa  293  8e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  34.43 
 
 		 593 aa  291  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  30.22 
 
 		 573 aa  291  2e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  38.19 
 
 		 596 aa  291  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  29.88 
 
 		 573 aa  288  1e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  32.4 
 
 		 596 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  39.05 
 
 		 598 aa  288  2.9999999999999996e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  33.1 
 
 		 619 aa  287  2.9999999999999996e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.08 
 
 		 618 aa  287  4e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  35.67 
 
 		 595 aa  285  2.0000000000000002e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.34 
 
 		 627 aa  283  9e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  33.27 
 
 		 599 aa  280  4e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  36.02 
 
 		 581 aa  280  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  35.77 
 
 		 608 aa  278  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.71 
 
 		 597 aa  278  3e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  35.56 
 
 		 576 aa  277  4e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  30.26 
 
 		 636 aa  276  5e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  33.16 
 
 		 609 aa  276  6e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.58 
 
 		 590 aa  276  6e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.41 
 
 		 637 aa  276  7e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.54 
 
 		 596 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  34.17 
 
 		 677 aa  273  5.000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.67 
 
 		 598 aa  273  6e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  29.41 
 
 		 590 aa  273  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  37.05 
 
 		 1228 aa  272  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  34.98 
 
 		 600 aa  271  2.9999999999999997e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.24 
 
 		 637 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.13 
 
 		 583 aa  270  5.9999999999999995e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  33.98 
 
 		 608 aa  270  8e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  39.05 
 
 		 581 aa  268  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  33.8 
 
 		 579 aa  268  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  31.68 
 
 		 575 aa  268  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  33.45 
 
 		 572 aa  267  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  31.16 
 
 		 609 aa  267  4e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0675  ABC efflux pump, fused inner membrane and ATPase subunits  38.15 
 
 		 573 aa  267  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.018058  normal  0.847795 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1036  ABC transporter related protein  38 
 
 		 579 aa  266  8e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188433  normal  0.0545959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  35.31 
 
 		 593 aa  265  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  27.22 
 
 		 577 aa  264  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  27.22 
 
 		 577 aa  264  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1825  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  37.46 
 
 		 576 aa  262  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.89 
 
 		 568 aa  261  2e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2153  putative ATP-binding component of ABC transporter  37.85 
 
 		 575 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356236  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  32.89 
 
 		 581 aa  259  8e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  36.11 
 
 		 592 aa  259  8e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.67 
 
 		 595 aa  259  1e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.39 
 
 		 581 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  32.76 
 
 		 612 aa  259  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  32.58 
 
 		 587 aa  258  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  34.71 
 
 		 582 aa  257  4e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  33.86 
 
 		 578 aa  257  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  35.83 
 
 		 578 aa  257  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.81 
 
 		 580 aa  256  8e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.31 
 
 		 588 aa  256  1.0000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  35.42 
 
 		 612 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4419  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.89 
 
 		 581 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  34.39 
 
 		 578 aa  255  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1275  ABC transporter related protein  30.14 
 
 		 576 aa  254  3e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  35.21 
 
 		 612 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  34.66 
 
 		 571 aa  253  6e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  37.19 
 
 		 607 aa  253  7e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.23 
 
 		 574 aa  252  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  31.96 
 
 		 588 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4444  ABC transporter related  32.88 
 
 		 577 aa  251  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  32.72 
 
 		 584 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  30.77 
 
 		 579 aa  251  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  31.29 
 
 		 572 aa  251  3e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2358  ABC transporter related  27.9 
 
 		 619 aa  251  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>