More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1825 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5292  ABC transporter related  79.65 
 
 
574 aa  702    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.332078 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0790  putative ABC transporter, permease protein  90.97 
 
 
575 aa  860    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2153  putative ATP-binding component of ABC transporter  90.8 
 
 
575 aa  891    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356236  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0880  putative ABC transporter, permease protein  90.97 
 
 
575 aa  858    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0675  ABC efflux pump, fused inner membrane and ATPase subunits  80.31 
 
 
573 aa  787    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.018058  normal  0.847795 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1825  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  100 
 
 
576 aa  1106    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3372  ABC transporter related  78.78 
 
 
574 aa  705    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0307564  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4995  ABC transporter related  78.78 
 
 
574 aa  705    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.147401  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0843  ABC transporter component  50.69 
 
 
577 aa  487  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00459321  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09300  putative ATP-binding component of ABC transporter  54.43 
 
 
570 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00251993  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0877  ABC transporter ATP-binding protein  53.24 
 
 
570 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0214075  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  39.02 
 
 
588 aa  307  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  37.37 
 
 
606 aa  304  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.46 
 
 
612 aa  296  9e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  37.22 
 
 
611 aa  290  4e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  35.7 
 
 
598 aa  266  5.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2596  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  36.03 
 
 
597 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.588652  normal  0.0388843 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  32.92 
 
 
597 aa  257  3e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  30.69 
 
 
590 aa  248  3e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  35.18 
 
 
578 aa  247  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1035  ABC transporter related protein  36.45 
 
 
619 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00381243  normal  0.0281832 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  37.75 
 
 
603 aa  239  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3091  ABC transporter related  33.44 
 
 
624 aa  231  2e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2102  ABC transporter related  32.44 
 
 
623 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2714  ABC transporter related  32.44 
 
 
623 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2741  ABC transporter related  32.52 
 
 
623 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18087  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  28.92 
 
 
588 aa  225  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  28.47 
 
 
592 aa  226  1e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0391  ABC transporter-related protein  43.17 
 
 
630 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00324467 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2632  ABC transporter related  32.78 
 
 
623 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4420  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.04 
 
 
605 aa  223  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2418  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.48 
 
 
623 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2338  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.48 
 
 
623 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.587388  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2740  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.48 
 
 
623 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0204  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.48 
 
 
623 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2766  ABC transporter related  32.78 
 
 
623 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  31.6 
 
 
636 aa  222  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0702  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.48 
 
 
623 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1736  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  38.15 
 
 
596 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0688  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.48 
 
 
623 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0867  ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  34.48 
 
 
654 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  42.35 
 
 
629 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4027  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  34.34 
 
 
656 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0672  ABC transporter related  34.54 
 
 
629 aa  220  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.798433  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0393  ABC transporter related  34.78 
 
 
631 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.17883 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0572  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.28 
 
 
651 aa  219  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620233  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  31.64 
 
 
652 aa  219  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11378  drug ABC transporter ATP-binding protein  33.8 
 
 
859 aa  218  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  36.67 
 
 
607 aa  218  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  30.18 
 
 
579 aa  217  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.53 
 
 
597 aa  216  5.9999999999999996e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0585  ABC transporter related  32.61 
 
 
623 aa  216  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  31.85 
 
 
575 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  41.45 
 
 
612 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  26.97 
 
 
613 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.66 
 
 
618 aa  215  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0975  ABC transporter related  37.63 
 
 
626 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  32.13 
 
 
572 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  33.47 
 
 
591 aa  214  2.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.24 
 
 
608 aa  214  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  32.77 
 
 
593 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  34.04 
 
 
566 aa  214  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  32.52 
 
 
677 aa  214  4.9999999999999996e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.66 
 
 
581 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6041  ABC transporter, fused ATPase and innermembrane subunits  32.11 
 
 
623 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  35.05 
 
 
607 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  28.88 
 
 
580 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  40.58 
 
 
612 aa  213  9e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1525  multidrug ABC transporter ATPase/permease  29.4 
 
 
607 aa  211  2e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.024438  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  33.6 
 
 
598 aa  212  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  32.04 
 
 
587 aa  212  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  32.14 
 
 
581 aa  212  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  31.12 
 
 
1194 aa  211  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0555  ABC transporter related  37.57 
 
 
628 aa  211  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.41 
 
 
578 aa  211  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  31.27 
 
 
583 aa  211  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  31.86 
 
 
1228 aa  211  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  34.14 
 
 
596 aa  211  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  27.72 
 
 
573 aa  210  5e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0442  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.77 
 
 
628 aa  210  5e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745625  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  28.33 
 
 
586 aa  210  5e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0449  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.77 
 
 
625 aa  210  6e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  31.59 
 
 
572 aa  210  7e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.82 
 
 
596 aa  209  8e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  33.6 
 
 
975 aa  209  8e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.94 
 
 
616 aa  209  9e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  32.99 
 
 
584 aa  209  9e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.42 
 
 
627 aa  209  1e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.27 
 
 
567 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  32.99 
 
 
576 aa  209  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  34.01 
 
 
597 aa  209  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  42.9 
 
 
592 aa  209  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  33.77 
 
 
594 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2015  ABC transporter related  30.41 
 
 
631 aa  208  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.945643  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  28.25 
 
 
597 aa  208  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  32.55 
 
 
726 aa  207  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  28.25 
 
 
597 aa  207  3e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  30.11 
 
 
587 aa  207  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  30.16 
 
 
660 aa  207  3e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  35.59 
 
 
600 aa  207  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>