More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5292 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0880  putative ABC transporter, permease protein  79.27 
 
 		 575 aa  716    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2153  putative ATP-binding component of ABC transporter  79.09 
 
 		 575 aa  742    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356236  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0675  ABC efflux pump, fused inner membrane and ATPase subunits  89.72 
 
 		 573 aa  904    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.018058  normal  0.847795 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1825  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  78.96 
 
 		 576 aa  764    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3372  ABC transporter related  98.43 
 
 		 574 aa  1083    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0307564  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5292  ABC transporter related  100 
 
 		 574 aa  1098    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.332078 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4995  ABC transporter related  98.43 
 
 		 574 aa  1083    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.147401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0790  putative ABC transporter, permease protein  79.27 
 
 		 575 aa  716    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0843  ABC transporter component  50.94 
 
 		 577 aa  482  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00459321  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09300  putative ATP-binding component of ABC transporter  54.72 
 
 		 570 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00251993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0877  ABC transporter ATP-binding protein  54.78 
 
 		 570 aa  422  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0214075  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.96 
 
 		 612 aa  307  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  38.06 
 
 		 606 aa  304  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  37.72 
 
 		 611 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  37.09 
 
 		 588 aa  282  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  33.63 
 
 		 597 aa  254  4.0000000000000004e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  35.35 
 
 		 598 aa  248  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2596  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  36.24 
 
 		 597 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.588652  normal  0.0388843 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3091  ABC transporter related  35.68 
 
 		 624 aa  247  4.9999999999999997e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  36.82 
 
 		 578 aa  246  6e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1035  ABC transporter related protein  38.01 
 
 		 619 aa  243  7e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00381243  normal  0.0281832 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  36.58 
 
 		 603 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4420  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.61 
 
 		 605 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  30.9 
 
 		 590 aa  228  2e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  39.47 
 
 		 596 aa  229  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  32.44 
 
 		 582 aa  226  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.84 
 
 		 581 aa  226  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  28.55 
 
 		 592 aa  224  2e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  36.07 
 
 		 607 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  35.17 
 
 		 576 aa  221  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  33.96 
 
 		 618 aa  219  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.03 
 
 		 567 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  31.34 
 
 		 572 aa  217  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  29.82 
 
 		 580 aa  216  7e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  32.26 
 
 		 610 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0391  ABC transporter-related protein  41.77 
 
 		 630 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00324467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  32.26 
 
 		 582 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  42.41 
 
 		 629 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0739  ABC transport protein ATPase component  33.05 
 
 		 624 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.191693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  31.11 
 
 		 583 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  35.7 
 
 		 611 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1525  multidrug ABC transporter ATPase/permease  29.03 
 
 		 607 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.024438  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  32.94 
 
 		 566 aa  214  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  31.24 
 
 		 660 aa  214  3.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  35.48 
 
 		 578 aa  213  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  32.48 
 
 		 582 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  33.52 
 
 		 652 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  30.07 
 
 		 579 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  32.73 
 
 		 1228 aa  213  7e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  28.72 
 
 		 588 aa  213  9e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  33.79 
 
 		 627 aa  212  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  31.34 
 
 		 572 aa  212  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  31.34 
 
 		 584 aa  211  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11378  drug ABC transporter ATP-binding protein  35.74 
 
 		 859 aa  210  4e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2242  ABC transporter related protein  29.73 
 
 		 658 aa  210  5e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406073  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  33.65 
 
 		 582 aa  210  6e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  31.18 
 
 		 636 aa  210  6e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.88 
 
 		 579 aa  210  6e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  31.05 
 
 		 593 aa  210  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  31.84 
 
 		 663 aa  209  8e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  33.33 
 
 		 589 aa  209  9e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2741  ABC transporter related  33.88 
 
 		 623 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.4 
 
 		 616 aa  208  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  34.21 
 
 		 596 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  27.62 
 
 		 586 aa  208  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  34.15 
 
 		 598 aa  208  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2102  ABC transporter related  33.88 
 
 		 623 aa  209  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  30.13 
 
 		 644 aa  208  2e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2714  ABC transporter related  33.88 
 
 		 623 aa  209  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  34.06 
 
 		 614 aa  209  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  34.79 
 
 		 581 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.87 
 
 		 577 aa  208  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 581 aa  207  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.55 
 
 		 618 aa  207  4e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  29.94 
 
 		 579 aa  207  5e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  33.85 
 
 		 726 aa  207  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  32.06 
 
 		 581 aa  206  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  28.7 
 
 		 611 aa  206  7e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  40.8 
 
 		 612 aa  206  8e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  30.86 
 
 		 650 aa  206  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  32.38 
 
 		 567 aa  206  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  33.74 
 
 		 591 aa  206  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  32.38 
 
 		 567 aa  206  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1432  ABC transporter related protein  33.84 
 
 		 661 aa  205  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.590543  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.97 
 
 		 578 aa  205  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  29.95 
 
 		 638 aa  205  2e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  32.72 
 
 		 598 aa  205  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  29.24 
 
 		 575 aa  205  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  32 
 
 		 624 aa  204  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.47 
 
 		 571 aa  204  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  32.27 
 
 		 571 aa  204  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  39.94 
 
 		 612 aa  204  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  29.47 
 
 		 571 aa  204  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  29.47 
 
 		 571 aa  204  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.47 
 
 		 571 aa  204  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1304  ABC transporter related  26.69 
 
 		 602 aa  204  4e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  33.59 
 
 		 600 aa  204  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  30.73 
 
 		 576 aa  203  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  33.75 
 
 		 634 aa  204  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  32.44 
 
 		 584 aa  204  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>