More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4995 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0880  putative ABC transporter, permease protein  79.09 
 
 		 575 aa  715    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0790  putative ABC transporter, permease protein  79.09 
 
 		 575 aa  714    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2153  putative ATP-binding component of ABC transporter  78.92 
 
 		 575 aa  740    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356236  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0675  ABC efflux pump, fused inner membrane and ATPase subunits  89.72 
 
 		 573 aa  902    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.018058  normal  0.847795 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1825  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  78.78 
 
 		 576 aa  761    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3372  ABC transporter related  100 
 
 		 574 aa  1101    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0307564  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5292  ABC transporter related  98.43 
 
 		 574 aa  1083    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.332078 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4995  ABC transporter related  100 
 
 		 574 aa  1101    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.147401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0843  ABC transporter component  50.94 
 
 		 577 aa  483  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00459321  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09300  putative ATP-binding component of ABC transporter  54.7 
 
 		 570 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00251993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0877  ABC transporter ATP-binding protein  54.9 
 
 		 570 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0214075  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  38.34 
 
 		 606 aa  307  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.07 
 
 		 612 aa  307  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  37.72 
 
 		 611 aa  295  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 588 aa  287  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  33.63 
 
 		 597 aa  251  3e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  37.57 
 
 		 578 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  35.14 
 
 		 598 aa  248  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2596  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  36.32 
 
 		 597 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.588652  normal  0.0388843 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3091  ABC transporter related  36.01 
 
 		 624 aa  246  9.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1035  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 619 aa  243  9e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00381243  normal  0.0281832 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  37.1 
 
 		 603 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.23 
 
 		 581 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  30.9 
 
 		 590 aa  230  7e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  39.68 
 
 		 596 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  28.74 
 
 		 592 aa  228  3e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4420  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.53 
 
 		 605 aa  228  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  32.02 
 
 		 582 aa  223  6e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  34.41 
 
 		 576 aa  223  9e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  36.07 
 
 		 607 aa  223  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  30.02 
 
 		 580 aa  221  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.38 
 
 		 567 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  29.86 
 
 		 572 aa  218  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1525  multidrug ABC transporter ATPase/permease  29.22 
 
 		 607 aa  218  2e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.024438  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  31.88 
 
 		 660 aa  217  5e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  33.96 
 
 		 618 aa  216  7e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  31.88 
 
 		 583 aa  216  7e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  32.26 
 
 		 610 aa  216  8e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  42.06 
 
 		 629 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  32.26 
 
 		 582 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  28.47 
 
 		 588 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  33.1 
 
 		 566 aa  216  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  33.98 
 
 		 627 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0391  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 		 630 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00324467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  32.48 
 
 		 582 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  33.33 
 
 		 652 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  31.37 
 
 		 636 aa  214  2.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  30.07 
 
 		 572 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  30.64 
 
 		 644 aa  213  5.999999999999999e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  31.51 
 
 		 584 aa  213  7.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0739  ABC transport protein ATPase component  32.88 
 
 		 624 aa  213  9e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.191693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  35.29 
 
 		 578 aa  213  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.88 
 
 		 579 aa  212  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  34.49 
 
 		 596 aa  212  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  35.23 
 
 		 611 aa  212  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.08 
 
 		 571 aa  211  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  28.08 
 
 		 571 aa  211  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  28.08 
 
 		 571 aa  211  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  31.45 
 
 		 587 aa  211  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.08 
 
 		 571 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  30.4 
 
 		 579 aa  211  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  32.66 
 
 		 1228 aa  211  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11378  drug ABC transporter ATP-binding protein  35.57 
 
 		 859 aa  211  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  32.56 
 
 		 567 aa  211  4e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  32.56 
 
 		 567 aa  211  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  31.05 
 
 		 593 aa  210  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  34.15 
 
 		 598 aa  210  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.01 
 
 		 571 aa  210  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  31.83 
 
 		 663 aa  210  7e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.91 
 
 		 571 aa  210  7e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  34.65 
 
 		 581 aa  209  9e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.47 
 
 		 596 aa  209  1e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2741  ABC transporter related  42.22 
 
 		 623 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.59 
 
 		 616 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.67 
 
 		 618 aa  209  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2242  ABC transporter related protein  29.55 
 
 		 658 aa  209  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406073  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  33.13 
 
 		 589 aa  209  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2102  ABC transporter related  42.22 
 
 		 623 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  33.66 
 
 		 582 aa  209  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  27.82 
 
 		 571 aa  209  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2714  ABC transporter related  42.22 
 
 		 623 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  33.73 
 
 		 591 aa  208  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  33.39 
 
 		 581 aa  209  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1432  ABC transporter related protein  34.66 
 
 		 661 aa  207  3e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.590543  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.91 
 
 		 571 aa  208  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  27.44 
 
 		 586 aa  208  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  30 
 
 		 579 aa  208  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.97 
 
 		 578 aa  207  5e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  34.06 
 
 		 614 aa  207  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  27.91 
 
 		 571 aa  206  7e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.91 
 
 		 571 aa  206  7e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  28.81 
 
 		 611 aa  206  7e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  33.47 
 
 		 634 aa  206  9e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  30.44 
 
 		 575 aa  206  9e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  27.74 
 
 		 597 aa  206  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  41.28 
 
 		 612 aa  206  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  41.09 
 
 		 612 aa  206  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  27.74 
 
 		 597 aa  206  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  30.4 
 
 		 576 aa  206  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  32.26 
 
 		 588 aa  206  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>