More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1601 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1601  ATPase  100 
 
 		 583 aa  1193    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  38.04 
 
 		 581 aa  355  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  35.43 
 
 		 579 aa  353  4e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  34.53 
 
 		 579 aa  343  5e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  35.47 
 
 		 581 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  34.49 
 
 		 579 aa  330  4e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.94 
 
 		 568 aa  325  1e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.73 
 
 		 580 aa  323  4e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  35.93 
 
 		 574 aa  323  5e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.66 
 
 		 603 aa  323  6e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  36.51 
 
 		 1228 aa  320  6e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  32.31 
 
 		 576 aa  319  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.89 
 
 		 581 aa  318  2e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  34.98 
 
 		 593 aa  318  2e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  35.56 
 
 		 588 aa  317  3e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  34.12 
 
 		 577 aa  315  9.999999999999999e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.69 
 
 		 585 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  33.87 
 
 		 585 aa  312  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.01 
 
 		 581 aa  311  2e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  35.69 
 
 		 565 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.72 
 
 		 576 aa  308  3e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  36.2 
 
 		 578 aa  306  6e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  37.04 
 
 		 607 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.69 
 
 		 589 aa  304  3.0000000000000004e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  34.57 
 
 		 618 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  30.96 
 
 		 578 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  30.96 
 
 		 578 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.27 
 
 		 577 aa  302  1e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.27 
 
 		 593 aa  301  2e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  32.94 
 
 		 597 aa  300  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  32.51 
 
 		 581 aa  300  6e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  30.77 
 
 		 587 aa  300  6e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.91 
 
 		 581 aa  297  3e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31 
 
 		 577 aa  297  3e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 581 aa  296  7e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.45 
 
 		 597 aa  296  9e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  34.82 
 
 		 592 aa  295  1e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  30.59 
 
 		 587 aa  295  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  30.59 
 
 		 587 aa  295  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  33.2 
 
 		 593 aa  295  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  34.63 
 
 		 611 aa  295  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  34.76 
 
 		 598 aa  292  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30 
 
 		 1091 aa  291  2e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  33.74 
 
 		 600 aa  290  5.0000000000000004e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.32 
 
 		 579 aa  289  9e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  32.49 
 
 		 593 aa  287  4e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  31.59 
 
 		 577 aa  286  7e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  31.59 
 
 		 577 aa  286  7e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  31.68 
 
 		 579 aa  285  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  31.55 
 
 		 1194 aa  284  4.0000000000000003e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.42 
 
 		 582 aa  284  4.0000000000000003e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  29.72 
 
 		 577 aa  283  4.0000000000000003e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  33.33 
 
 		 604 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.61 
 
 		 588 aa  282  1e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  32.25 
 
 		 592 aa  280  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.4 
 
 		 583 aa  280  5e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  32.95 
 
 		 619 aa  279  9e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.24 
 
 		 580 aa  278  2e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.34 
 
 		 574 aa  277  5e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  30.09 
 
 		 606 aa  276  8e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.33 
 
 		 574 aa  276  9e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  34.81 
 
 		 571 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  32.58 
 
 		 577 aa  274  3e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  33.94 
 
 		 590 aa  273  5.000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1330  ABC transporter related  30.32 
 
 		 571 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.987639  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  33.06 
 
 		 580 aa  273  8.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3043  ABC transporter related  31.18 
 
 		 598 aa  273  9e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  31.8 
 
 		 608 aa  272  1e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  32.26 
 
 		 574 aa  272  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  33.33 
 
 		 596 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  34.01 
 
 		 584 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1441  ABC transporter related  34.97 
 
 		 606 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  32.24 
 
 		 595 aa  270  5e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.21 
 
 		 572 aa  270  7e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  33.2 
 
 		 581 aa  269  8e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  31.1 
 
 		 581 aa  269  1e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.96 
 
 		 581 aa  268  2e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  32.63 
 
 		 575 aa  268  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  30.47 
 
 		 602 aa  268  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3018  ABC transporter related  37.01 
 
 		 595 aa  267  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  31.12 
 
 		 1138 aa  266  5.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.21 
 
 		 590 aa  266  8.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.09 
 
 		 593 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.23 
 
 		 618 aa  265  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54970  ABC transporter  33.03 
 
 		 585 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479716  unclonable  4.5900199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  30.59 
 
 		 605 aa  265  2e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  35.89 
 
 		 582 aa  264  3e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 571 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.4 
 
 		 595 aa  263  8e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  29.86 
 
 		 590 aa  262  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  33 
 
 		 588 aa  261  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  34.88 
 
 		 590 aa  262  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  33.07 
 
 		 596 aa  261  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0628  ABC transporter, ATP-binding protein  30.84 
 
 		 573 aa  261  3e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.484282  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.97 
 
 		 581 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0708  ABC transporter related  30.84 
 
 		 573 aa  259  8e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153727  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.44 
 
 		 573 aa  259  1e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2824  ABC transporter related protein  32.49 
 
 		 571 aa  259  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  34.26 
 
 		 588 aa  259  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0882  ABC transporter, transmembrane region  33.27 
 
 		 592 aa  258  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>