More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0908 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  100 
 
 		 583 aa  1197    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  41.08 
 
 		 593 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.82 
 
 		 597 aa  421  1e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  39.14 
 
 		 580 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.9 
 
 		 580 aa  406  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.53 
 
 		 576 aa  389  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  37.78 
 
 		 619 aa  390  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  37.17 
 
 		 608 aa  382  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  37.48 
 
 		 609 aa  382  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  38.37 
 
 		 595 aa  377  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  34.74 
 
 		 587 aa  373  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  34.74 
 
 		 587 aa  373  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.88 
 
 		 581 aa  363  6e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.5 
 
 		 589 aa  361  2e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  35.73 
 
 		 597 aa  359  9e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  36.3 
 
 		 611 aa  352  8e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  36.84 
 
 		 606 aa  350  4e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  36.56 
 
 		 604 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.17 
 
 		 1091 aa  344  2e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.97 
 
 		 596 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  34.68 
 
 		 599 aa  341  2e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.58 
 
 		 583 aa  337  2.9999999999999997e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  34.72 
 
 		 573 aa  334  3e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  36.1 
 
 		 592 aa  334  3e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  34.72 
 
 		 573 aa  333  6e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  34.62 
 
 		 584 aa  320  3e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.06 
 
 		 627 aa  319  7e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  35.63 
 
 		 599 aa  318  1e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  34.11 
 
 		 1194 aa  319  1e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  33.1 
 
 		 602 aa  318  3e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  33.57 
 
 		 593 aa  317  4e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 590 aa  314  3.9999999999999997e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.25 
 
 		 573 aa  310  4e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  34.85 
 
 		 618 aa  306  7e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  33.75 
 
 		 598 aa  306  9.000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  38.26 
 
 		 600 aa  306  9.000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.16 
 
 		 618 aa  305  1.0000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  31.95 
 
 		 576 aa  298  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.99 
 
 		 595 aa  292  1e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  35.01 
 
 		 581 aa  292  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  35.32 
 
 		 593 aa  291  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  33.33 
 
 		 579 aa  291  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  34.02 
 
 		 596 aa  291  3e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  35.2 
 
 		 579 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  34.19 
 
 		 609 aa  287  4e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.36 
 
 		 572 aa  286  5e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  32.43 
 
 		 611 aa  285  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  31.32 
 
 		 590 aa  283  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.14 
 
 		 590 aa  282  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  31.4 
 
 		 583 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  32.64 
 
 		 600 aa  280  6e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  32.74 
 
 		 592 aa  276  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  32.62 
 
 		 1228 aa  274  3e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  35.88 
 
 		 608 aa  273  8.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  32.9 
 
 		 581 aa  272  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  32.89 
 
 		 588 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  32.78 
 
 		 660 aa  271  2e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.47 
 
 		 577 aa  271  2e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0881  ABC transporter component  32.33 
 
 		 589 aa  270  4e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  32.21 
 
 		 579 aa  270  5e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.57 
 
 		 568 aa  270  7e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  31.68 
 
 		 575 aa  268  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0354  ABC transporter related  33.27 
 
 		 585 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.667911  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.39 
 
 		 593 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0708  ABC transporter related  33.33 
 
 		 573 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153727  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  32.81 
 
 		 578 aa  268  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0628  ABC transporter, ATP-binding protein  33.14 
 
 		 573 aa  268  2.9999999999999995e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.484282  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.65 
 
 		 588 aa  267  5e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.88 
 
 		 581 aa  267  5e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  30.92 
 
 		 598 aa  264  4e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0189  ABC transporter related  31.67 
 
 		 576 aa  263  6e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.087717  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  31.12 
 
 		 677 aa  263  8e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  31.69 
 
 		 598 aa  262  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  30.44 
 
 		 587 aa  261  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0191  ABC transporter related  36.04 
 
 		 579 aa  262  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.059505  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  31.87 
 
 		 596 aa  259  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  34.1 
 
 		 578 aa  258  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0676  ABC transporter related protein  31.65 
 
 		 573 aa  258  2e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.28 
 
 		 574 aa  256  5e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  29.11 
 
 		 588 aa  256  6e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.69 
 
 		 580 aa  256  8e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  31.59 
 
 		 650 aa  255  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.79 
 
 		 573 aa  254  3e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0675  ABC transporter related protein  31.63 
 
 		 584 aa  254  3e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  31.27 
 
 		 577 aa  254  3e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  30.97 
 
 		 581 aa  254  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.32 
 
 		 579 aa  253  5.000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  29.64 
 
 		 585 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0819  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.94 
 
 		 578 aa  253  6e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608136  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  33.87 
 
 		 574 aa  253  7e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.19 
 
 		 603 aa  253  9.000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2596  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  32.2 
 
 		 597 aa  253  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.588652  normal  0.0388843 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  32.76 
 
 		 586 aa  252  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.54 
 
 		 593 aa  252  1e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0864  ABC transporter, transmembrane region  30.76 
 
 		 603 aa  252  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  30.83 
 
 		 577 aa  252  2e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  31.89 
 
 		 608 aa  251  2e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  33.97 
 
 		 582 aa  251  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.72 
 
 		 577 aa  251  4e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  30.12 
 
 		 1138 aa  250  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.886834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>