More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0757 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  99.49 
 
 		 590 aa  1206    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  100 
 
 		 590 aa  1214    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  37.58 
 
 		 611 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  36.27 
 
 		 599 aa  372  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  35.39 
 
 		 597 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  35.44 
 
 		 602 aa  374  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  36.59 
 
 		 592 aa  372  1e-101  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  37.93 
 
 		 584 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  35.44 
 
 		 593 aa  364  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  36.24 
 
 		 604 aa  360  4e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  36.82 
 
 		 618 aa  355  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  36.26 
 
 		 593 aa  351  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  35.74 
 
 		 595 aa  347  3e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.97 
 
 		 597 aa  346  6e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.11 
 
 		 589 aa  342  8e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.8 
 
 		 573 aa  338  1.9999999999999998e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  34.49 
 
 		 609 aa  335  1e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  32.87 
 
 		 619 aa  335  2e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  32.82 
 
 		 587 aa  335  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  32.82 
 
 		 587 aa  335  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  33.8 
 
 		 608 aa  332  1e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.52 
 
 		 593 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  34.45 
 
 		 596 aa  326  6e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  32.81 
 
 		 580 aa  325  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  36.74 
 
 		 606 aa  324  3e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  36.71 
 
 		 590 aa  319  1e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  34.29 
 
 		 677 aa  312  9e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  35.11 
 
 		 600 aa  312  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  31.13 
 
 		 573 aa  311  2e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  30.7 
 
 		 573 aa  311  2e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.09 
 
 		 576 aa  311  2.9999999999999997e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.2 
 
 		 595 aa  308  2.0000000000000002e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3042  ABC transporter related  33.5 
 
 		 611 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  32.3 
 
 		 611 aa  306  7e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.61 
 
 		 580 aa  305  1.0000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  31.54 
 
 		 1194 aa  305  1.0000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  33.67 
 
 		 579 aa  302  1e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  32.77 
 
 		 598 aa  301  2e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  35.27 
 
 		 579 aa  301  2e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.5 
 
 		 568 aa  298  2e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.7 
 
 		 581 aa  295  1e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.21 
 
 		 583 aa  295  2e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  31.18 
 
 		 599 aa  295  2e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  33.65 
 
 		 607 aa  292  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.55 
 
 		 1091 aa  292  1e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  35.24 
 
 		 1228 aa  292  1e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  32.32 
 
 		 581 aa  290  4e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0864  ABC transporter, transmembrane region  33.03 
 
 		 603 aa  290  4e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.24 
 
 		 627 aa  290  6e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.8 
 
 		 596 aa  290  7e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.92 
 
 		 618 aa  284  4.0000000000000003e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.32 
 
 		 583 aa  283  9e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  33.81 
 
 		 598 aa  282  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  33.98 
 
 		 608 aa  282  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0707  ABC transporter related  30.47 
 
 		 584 aa  281  3e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0139832  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  34.51 
 
 		 581 aa  280  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  32.33 
 
 		 579 aa  280  5e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  33.08 
 
 		 600 aa  280  6e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0627  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.9 
 
 		 584 aa  279  1e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.746647  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.4 
 
 		 581 aa  273  7e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  31.48 
 
 		 609 aa  273  8.000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  31.36 
 
 		 578 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  30.09 
 
 		 600 aa  269  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0881  ABC transporter component  32.2 
 
 		 589 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.11 
 
 		 580 aa  266  7e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  31.78 
 
 		 603 aa  265  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.17 
 
 		 581 aa  264  3e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  33.39 
 
 		 593 aa  263  4.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  31.3 
 
 		 1138 aa  263  6.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.06 
 
 		 572 aa  262  1e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  30.3 
 
 		 606 aa  262  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  29.86 
 
 		 583 aa  262  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  33.8 
 
 		 578 aa  262  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  29.44 
 
 		 576 aa  259  7e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  33.94 
 
 		 574 aa  259  8e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1331  ABC transporter related  28.75 
 
 		 596 aa  258  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3091  ABC transporter related  29.73 
 
 		 624 aa  258  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54980  poossible ABC-type transporter protein  30.9 
 
 		 584 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875214  unclonable  5.28069e-21 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.32 
 
 		 588 aa  257  5e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0819  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.86 
 
 		 578 aa  257  5e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608136  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1035  ABC transporter related protein  32.63 
 
 		 619 aa  257  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00381243  normal  0.0281832 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.14 
 
 		 603 aa  256  6e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.82 
 
 		 577 aa  256  6e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0675  ABC transporter related protein  28.11 
 
 		 584 aa  256  8e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.41 
 
 		 612 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  33.2 
 
 		 575 aa  254  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 571 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  29.6 
 
 		 588 aa  252  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  29.82 
 
 		 577 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  29.82 
 
 		 577 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  33.47 
 
 		 596 aa  251  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  31.99 
 
 		 581 aa  249  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  30.07 
 
 		 597 aa  247  4e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0676  ABC transporter related protein  29.81 
 
 		 573 aa  246  6e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  27.99 
 
 		 578 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  27.99 
 
 		 578 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  33.01 
 
 		 565 aa  246  9e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.43 
 
 		 573 aa  245  9.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1572  ABC transporter related protein  35.92 
 
 		 591 aa  246  9.999999999999999e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.722294  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.48 
 
 		 581 aa  244  3.9999999999999997e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>