More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2128 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  100 
 
 		 578 aa  1175    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  49.91 
 
 		 581 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  49.13 
 
 		 579 aa  591  1e-167  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  45.57 
 
 		 574 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  44.82 
 
 		 581 aa  490  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  43.6 
 
 		 579 aa  486  1e-136  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.03 
 
 		 603 aa  471  1.0000000000000001e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  42.46 
 
 		 1228 aa  463  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  45.97 
 
 		 579 aa  436  1e-121  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.28 
 
 		 580 aa  425  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.46 
 
 		 568 aa  412  1e-113  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.89 
 
 		 573 aa  396  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0628  ABC transporter, ATP-binding protein  40.35 
 
 		 573 aa  390  1e-107  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.484282  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0708  ABC transporter related  39.34 
 
 		 573 aa  387  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153727  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.54 
 
 		 581 aa  378  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  37.61 
 
 		 593 aa  369  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  36.96 
 
 		 588 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.41 
 
 		 577 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  35.76 
 
 		 576 aa  349  9e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  36.63 
 
 		 579 aa  348  1e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  36.74 
 
 		 577 aa  348  1e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  36.74 
 
 		 577 aa  348  1e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.41 
 
 		 588 aa  347  5e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0676  ABC transporter related protein  36.06 
 
 		 573 aa  347  5e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  36.29 
 
 		 587 aa  345  8.999999999999999e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  36.86 
 
 		 581 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.1 
 
 		 579 aa  338  1.9999999999999998e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  35.11 
 
 		 574 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.95 
 
 		 577 aa  335  1e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.01 
 
 		 593 aa  332  1e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  37.19 
 
 		 577 aa  331  3e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  40.33 
 
 		 581 aa  330  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  36.49 
 
 		 605 aa  330  4e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.28 
 
 		 581 aa  329  9e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.83 
 
 		 581 aa  327  3e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  36.1 
 
 		 577 aa  323  4e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  36.5 
 
 		 611 aa  323  6e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  36.2 
 
 		 583 aa  323  7e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.57 
 
 		 574 aa  322  9.000000000000001e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  33.51 
 
 		 578 aa  320  3e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  33.51 
 
 		 578 aa  320  3e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  37.77 
 
 		 604 aa  320  5e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  36.11 
 
 		 581 aa  320  6e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  35.57 
 
 		 597 aa  319  7e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.68 
 
 		 582 aa  319  7e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  36.45 
 
 		 587 aa  319  7.999999999999999e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  36.45 
 
 		 587 aa  319  7.999999999999999e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  35.2 
 
 		 596 aa  318  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  36.9 
 
 		 592 aa  312  9e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  38.52 
 
 		 595 aa  310  2.9999999999999997e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  36.01 
 
 		 607 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.85 
 
 		 589 aa  308  2.0000000000000002e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  38.07 
 
 		 606 aa  308  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  37 
 
 		 571 aa  307  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.97 
 
 		 618 aa  306  7e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  33.61 
 
 		 600 aa  306  1.0000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  34.87 
 
 		 590 aa  302  1e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  35.38 
 
 		 582 aa  302  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  35.57 
 
 		 592 aa  302  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  35.09 
 
 		 593 aa  301  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.6 
 
 		 576 aa  299  9e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.4 
 
 		 580 aa  298  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.73 
 
 		 595 aa  296  6e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.91 
 
 		 572 aa  296  7e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  35.36 
 
 		 619 aa  295  1e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  35.62 
 
 		 611 aa  296  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.53 
 
 		 581 aa  295  2e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  36.94 
 
 		 598 aa  295  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  35.08 
 
 		 585 aa  295  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  35.02 
 
 		 577 aa  294  3e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.88 
 
 		 585 aa  294  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.59 
 
 		 597 aa  294  4e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  36.78 
 
 		 565 aa  294  4e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  36.12 
 
 		 579 aa  293  5e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.41 
 
 		 598 aa  293  5e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  34.52 
 
 		 609 aa  293  7e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  35.15 
 
 		 602 aa  291  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  38.16 
 
 		 578 aa  291  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.7 
 
 		 577 aa  291  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  35.55 
 
 		 616 aa  290  4e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  34.6 
 
 		 611 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.74 
 
 		 581 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  36.08 
 
 		 593 aa  290  6e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.45 
 
 		 574 aa  289  8e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  34.17 
 
 		 584 aa  289  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.39 
 
 		 573 aa  288  2e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  34.22 
 
 		 611 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4444  ABC transporter related  33.67 
 
 		 577 aa  288  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  33.68 
 
 		 580 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  33.22 
 
 		 596 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  34.72 
 
 		 611 aa  287  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.68 
 
 		 585 aa  287  4e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.02 
 
 		 580 aa  286  5e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2008  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.97 
 
 		 585 aa  286  7e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  34.6 
 
 		 608 aa  286  9e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  36.36 
 
 		 571 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.22 
 
 		 1091 aa  285  1.0000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  34.24 
 
 		 600 aa  285  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  34.66 
 
 		 578 aa  285  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  32.51 
 
 		 608 aa  284  3.0000000000000004e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>