More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0708 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0708  ABC transporter related  100 
 
 
573 aa  1146    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153727  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0676  ABC transporter related protein  61.26 
 
 
573 aa  729    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0628  ABC transporter, ATP-binding protein  90.92 
 
 
573 aa  1031    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.484282  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  50.79 
 
 
573 aa  611  9.999999999999999e-175  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.32 
 
 
568 aa  421  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  37.68 
 
 
574 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.5 
 
 
580 aa  396  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  35.64 
 
 
579 aa  377  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  39.33 
 
 
578 aa  376  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  39.77 
 
 
579 aa  373  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  36.52 
 
 
581 aa  371  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.38 
 
 
603 aa  365  1e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  36.11 
 
 
1228 aa  353  7e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  37.15 
 
 
581 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  31.76 
 
 
593 aa  302  1e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  33.96 
 
 
597 aa  297  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  34.03 
 
 
577 aa  295  2e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  29.86 
 
 
588 aa  294  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  33.99 
 
 
579 aa  292  1e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  33.86 
 
 
604 aa  290  7e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.12 
 
 
577 aa  288  2e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  31.12 
 
 
607 aa  288  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  33.39 
 
 
578 aa  287  4e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  33.39 
 
 
578 aa  287  4e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.85 
 
 
593 aa  284  3.0000000000000004e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.53 
 
 
593 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  35.04 
 
 
611 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.8 
 
 
581 aa  283  8.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.74 
 
 
588 aa  279  1e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.58 
 
 
581 aa  277  4e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  35.63 
 
 
576 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  34.21 
 
 
599 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.46 
 
 
583 aa  271  2.9999999999999997e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.77 
 
 
579 aa  270  4e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.66 
 
 
572 aa  270  5e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  31.44 
 
 
575 aa  270  5e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  30.91 
 
 
574 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  33.71 
 
 
592 aa  269  1e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  33.94 
 
 
577 aa  268  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  33.94 
 
 
577 aa  268  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.28 
 
 
1091 aa  268  2.9999999999999995e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  31.64 
 
 
598 aa  268  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.2 
 
 
574 aa  267  4e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  34.04 
 
 
593 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  29.04 
 
 
587 aa  265  2e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  32.21 
 
 
584 aa  264  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  28.75 
 
 
588 aa  263  8e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  30.86 
 
 
583 aa  262  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.33 
 
 
581 aa  260  4e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.09 
 
 
576 aa  261  4e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.1 
 
 
581 aa  260  5.0000000000000005e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.68 
 
 
580 aa  259  8e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.39 
 
 
582 aa  258  1e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  32.3 
 
 
572 aa  259  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.81 
 
 
597 aa  258  2e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1050  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.71 
 
 
609 aa  258  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.718087  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.71 
 
 
591 aa  258  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.72 
 
 
595 aa  257  3e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  31.89 
 
 
572 aa  257  5e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.46 
 
 
589 aa  256  7e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1331  ABC transporter related  31.79 
 
 
609 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134992  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  33.53 
 
 
594 aa  255  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  30.32 
 
 
600 aa  254  3e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.57 
 
 
627 aa  254  4.0000000000000004e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.98 
 
 
585 aa  253  5.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  30 
 
 
605 aa  253  7e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  36.21 
 
 
581 aa  253  9.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  34.06 
 
 
588 aa  252  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.4 
 
 
585 aa  252  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  31.29 
 
 
581 aa  252  1e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  32.47 
 
 
608 aa  252  1e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  32.58 
 
 
571 aa  251  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  33.84 
 
 
586 aa  251  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  29.6 
 
 
585 aa  251  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.9 
 
 
581 aa  251  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  33.95 
 
 
587 aa  250  4e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  32.05 
 
 
617 aa  250  4e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  33.95 
 
 
587 aa  250  4e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.81 
 
 
577 aa  250  4e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  30.43 
 
 
590 aa  249  7e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.92 
 
 
574 aa  249  8e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0157  ABC transporter related  37.21 
 
 
616 aa  249  9e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.542583  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  29.01 
 
 
593 aa  249  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  32.13 
 
 
611 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  31.47 
 
 
632 aa  248  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4442  ABC transporter related  33.96 
 
 
595 aa  248  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.601236 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  32.05 
 
 
584 aa  248  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  30.85 
 
 
616 aa  247  4e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  31.03 
 
 
601 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.47 
 
 
598 aa  247  4.9999999999999997e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1370  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  27.7 
 
 
598 aa  247  4.9999999999999997e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15083  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  31 
 
 
577 aa  247  4.9999999999999997e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.38 
 
 
639 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4128  ABC transporter related  33.96 
 
 
595 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  31.9 
 
 
593 aa  246  8e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  32.51 
 
 
556 aa  246  9e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.14 
 
 
578 aa  246  9.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  30.24 
 
 
581 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  32.12 
 
 
611 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  31.53 
 
 
611 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>