More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1492 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  100 
 
 		 592 aa  1176    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  40.68 
 
 		 607 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  36.44 
 
 		 611 aa  364  2e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  36.49 
 
 		 581 aa  357  5e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  38.76 
 
 		 581 aa  353  5e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  36.28 
 
 		 576 aa  352  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  32.86 
 
 		 577 aa  347  5e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  32.86 
 
 		 577 aa  347  5e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  34.99 
 
 		 578 aa  346  6e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  34.99 
 
 		 578 aa  346  6e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.79 
 
 		 588 aa  346  7e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.62 
 
 		 597 aa  344  2e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  36.13 
 
 		 590 aa  344  2.9999999999999997e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.49 
 
 		 581 aa  342  8e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  37.71 
 
 		 597 aa  342  9e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  34.1 
 
 		 587 aa  342  1e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  34.1 
 
 		 587 aa  342  1e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  36.07 
 
 		 588 aa  342  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  34.42 
 
 		 587 aa  340  5e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  37.61 
 
 		 593 aa  335  1e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  35.09 
 
 		 581 aa  332  2e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  33.39 
 
 		 577 aa  331  3e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  36.53 
 
 		 604 aa  330  4e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  37.91 
 
 		 593 aa  330  6e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.29 
 
 		 574 aa  328  1.0000000000000001e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  39.96 
 
 		 595 aa  328  2.0000000000000001e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  36.29 
 
 		 592 aa  328  2.0000000000000001e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.88 
 
 		 589 aa  324  3e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.63 
 
 		 581 aa  323  4e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  34.05 
 
 		 579 aa  323  6e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.99 
 
 		 577 aa  322  9.999999999999999e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.53 
 
 		 581 aa  322  1.9999999999999998e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  32.83 
 
 		 599 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  37.45 
 
 		 577 aa  320  3e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  38.01 
 
 		 578 aa  320  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.43 
 
 		 582 aa  318  2e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  41.12 
 
 		 593 aa  317  3e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  32.07 
 
 		 574 aa  317  3e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  37.39 
 
 		 579 aa  317  3e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  36.02 
 
 		 579 aa  317  5e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  33.58 
 
 		 579 aa  315  9.999999999999999e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  35.2 
 
 		 581 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  34.98 
 
 		 1228 aa  313  3.9999999999999997e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  34.23 
 
 		 602 aa  313  3.9999999999999997e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54970  ABC transporter  38.49 
 
 		 585 aa  312  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479716  unclonable  4.5900199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  40.58 
 
 		 606 aa  312  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.01 
 
 		 580 aa  311  2.9999999999999997e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.37 
 
 		 572 aa  310  4e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  39.68 
 
 		 618 aa  310  5.9999999999999995e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  37.23 
 
 		 577 aa  310  6.999999999999999e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.09 
 
 		 573 aa  308  1.0000000000000001e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.27 
 
 		 581 aa  309  1.0000000000000001e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.24 
 
 		 581 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.11 
 
 		 593 aa  308  2.0000000000000002e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  37.78 
 
 		 600 aa  308  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.29 
 
 		 577 aa  308  2.0000000000000002e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  36.58 
 
 		 596 aa  307  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  33.8 
 
 		 588 aa  305  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  32.92 
 
 		 584 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.08 
 
 		 603 aa  302  1e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  35.19 
 
 		 619 aa  302  1e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.33 
 
 		 576 aa  302  1e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  34.93 
 
 		 609 aa  302  1e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  36.32 
 
 		 608 aa  301  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.04 
 
 		 618 aa  301  2e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.56 
 
 		 579 aa  300  4e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  39.46 
 
 		 581 aa  300  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.2 
 
 		 574 aa  300  5e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  35.51 
 
 		 574 aa  300  5e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  37.41 
 
 		 581 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  32.25 
 
 		 583 aa  299  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.31 
 
 		 598 aa  298  1e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  35.21 
 
 		 599 aa  298  3e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.01 
 
 		 595 aa  297  4e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.92 
 
 		 1091 aa  295  2e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  37.84 
 
 		 565 aa  294  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.9 
 
 		 568 aa  294  4e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  33.67 
 
 		 605 aa  292  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  36.09 
 
 		 616 aa  291  3e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.74 
 
 		 583 aa  290  3e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4512  ABC transporter component  38.29 
 
 		 575 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  34.97 
 
 		 580 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  37.71 
 
 		 598 aa  287  5e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  34.03 
 
 		 600 aa  287  5e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  36.57 
 
 		 606 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  38.23 
 
 		 598 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.48 
 
 		 580 aa  282  1e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4045  ABC transporter related  38.73 
 
 		 582 aa  282  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.93 
 
 		 585 aa  282  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  36.38 
 
 		 572 aa  281  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  37.15 
 
 		 598 aa  281  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  33.4 
 
 		 573 aa  281  3e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1572  ABC transporter related protein  39.44 
 
 		 591 aa  280  4e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.722294  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  34.79 
 
 		 600 aa  280  4e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.64 
 
 		 583 aa  280  6e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2339  ABC transporter component  38.41 
 
 		 582 aa  280  6e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.667532  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.78 
 
 		 627 aa  278  2e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  33.2 
 
 		 573 aa  278  2e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  35.11 
 
 		 572 aa  277  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.66 
 
 		 593 aa  276  6e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>