More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3554 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  100 
 
 
596 aa  1153    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4045  ABC transporter related  52.52 
 
 
582 aa  505  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1036  ABC transporter related protein  49.31 
 
 
579 aa  485  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188433  normal  0.0545959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4444  ABC transporter related  49.74 
 
 
577 aa  479  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2339  ABC transporter component  49.65 
 
 
582 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.667532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4512  ABC transporter component  45.47 
 
 
575 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  47.68 
 
 
581 aa  448  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2824  ABC transporter related protein  45.47 
 
 
571 aa  439  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866997  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  44.52 
 
 
577 aa  441  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4419  ABC transporter permease/ATP-binding protein  44.18 
 
 
581 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  45.73 
 
 
578 aa  385  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  38.98 
 
 
576 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  39.83 
 
 
600 aa  362  1e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  38.8 
 
 
588 aa  361  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  38.4 
 
 
587 aa  359  7e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.32 
 
 
577 aa  359  9e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1491  ABC transporter related  39.75 
 
 
584 aa  357  2.9999999999999997e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11379  drug ABC transporter ATP-binding protein  39.73 
 
 
579 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.73648 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  35.75 
 
 
577 aa  357  3.9999999999999996e-97  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2595  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  41.58 
 
 
601 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.398767  normal  0.0147502 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  40.87 
 
 
581 aa  340  5.9999999999999996e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  38.02 
 
 
581 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  36.2 
 
 
579 aa  335  1e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1441  ABC transporter related  40 
 
 
606 aa  335  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  34.49 
 
 
592 aa  333  6e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  32.04 
 
 
579 aa  332  1e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  43.19 
 
 
607 aa  331  3e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  35.73 
 
 
611 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  37.37 
 
 
581 aa  327  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  32.99 
 
 
577 aa  326  7e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  32.99 
 
 
577 aa  326  7e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.36 
 
 
579 aa  325  2e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  37.57 
 
 
593 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  34.97 
 
 
578 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.68 
 
 
577 aa  321  3e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.54 
 
 
574 aa  319  7e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.67 
 
 
618 aa  319  1e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  42.22 
 
 
598 aa  317  3e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.55 
 
 
588 aa  316  8e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  34 
 
 
578 aa  316  8e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  34 
 
 
578 aa  316  8e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  37.72 
 
 
588 aa  315  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  38.65 
 
 
581 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  40.57 
 
 
578 aa  312  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  38.79 
 
 
605 aa  310  4e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  36.12 
 
 
604 aa  310  5.9999999999999995e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1572  ABC transporter related protein  35.08 
 
 
591 aa  310  6.999999999999999e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.722294  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  37.44 
 
 
581 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  39.67 
 
 
579 aa  308  2.0000000000000002e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  41.1 
 
 
595 aa  306  8.000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  40.04 
 
 
574 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  39.75 
 
 
593 aa  305  1.0000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  31.99 
 
 
574 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  37.74 
 
 
600 aa  303  5.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.78 
 
 
581 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  34.19 
 
 
590 aa  302  1e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.82 
 
 
568 aa  301  2e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  35.7 
 
 
619 aa  301  2e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  32.98 
 
 
597 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  38.23 
 
 
592 aa  301  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  33.92 
 
 
580 aa  300  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  36.71 
 
 
618 aa  300  5e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.35 
 
 
573 aa  299  1e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.77 
 
 
581 aa  298  2e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  37.14 
 
 
579 aa  298  2e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  38.72 
 
 
565 aa  298  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.83 
 
 
580 aa  298  2e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.41 
 
 
612 aa  297  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  34.27 
 
 
585 aa  296  9e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  38.11 
 
 
606 aa  296  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54970  ABC transporter  40.64 
 
 
585 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479716  unclonable  4.5900199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  30.63 
 
 
587 aa  295  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.06 
 
 
585 aa  295  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  36.19 
 
 
598 aa  295  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  30.63 
 
 
587 aa  295  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  35.75 
 
 
1228 aa  294  3e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  37.9 
 
 
577 aa  293  5e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.04 
 
 
589 aa  292  2e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.1 
 
 
627 aa  290  5.0000000000000004e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  36.24 
 
 
611 aa  290  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  36.24 
 
 
608 aa  290  6e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  48.53 
 
 
582 aa  290  6e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.55 
 
 
581 aa  288  2e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.2 
 
 
574 aa  288  2.9999999999999996e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  36.93 
 
 
593 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  42.44 
 
 
596 aa  287  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  36 
 
 
597 aa  287  4e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3043  ABC transporter related  36.69 
 
 
598 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  37.37 
 
 
606 aa  286  9e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  38.99 
 
 
609 aa  286  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.33 
 
 
603 aa  285  2.0000000000000002e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  34.23 
 
 
584 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.39 
 
 
1091 aa  284  3.0000000000000004e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3018  ABC transporter related  39.55 
 
 
595 aa  283  6.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  33.33 
 
 
602 aa  283  9e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.95 
 
 
581 aa  282  1e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  33.33 
 
 
583 aa  282  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.89 
 
 
573 aa  281  2e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2008  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.13 
 
 
585 aa  281  3e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  34.9 
 
 
1194 aa  278  2e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>