More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1572 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1572  ABC transporter related protein  100 
 
 		 591 aa  1210    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.722294  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1441  ABC transporter related  43.47 
 
 		 606 aa  472  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  44.1 
 
 		 600 aa  474  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3018  ABC transporter related  45.62 
 
 		 595 aa  423  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2442  ABC transporter related  46.67 
 
 		 634 aa  419  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0403227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  35.64 
 
 		 611 aa  320  5e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  34.86 
 
 		 596 aa  319  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  34.94 
 
 		 607 aa  318  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  34.78 
 
 		 581 aa  317  5e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  34.32 
 
 		 577 aa  315  1.9999999999999998e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4512  ABC transporter component  34.72 
 
 		 575 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.76 
 
 		 581 aa  306  6e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  37.1 
 
 		 577 aa  305  2.0000000000000002e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  37.92 
 
 		 593 aa  305  2.0000000000000002e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4045  ABC transporter related  36.27 
 
 		 582 aa  303  6.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4444  ABC transporter related  34.04 
 
 		 577 aa  300  5e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  35.09 
 
 		 579 aa  297  4e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  33.45 
 
 		 576 aa  296  7e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  38.06 
 
 		 584 aa  296  9e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  34.23 
 
 		 587 aa  295  2e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  35.45 
 
 		 579 aa  295  2e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  34.17 
 
 		 581 aa  293  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  33.75 
 
 		 593 aa  292  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  35.61 
 
 		 597 aa  291  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  33.05 
 
 		 592 aa  291  3e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  36.44 
 
 		 578 aa  291  3e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  34.15 
 
 		 588 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2824  ABC transporter related protein  35.28 
 
 		 571 aa  289  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866997  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.42 
 
 		 581 aa  289  1e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  33.46 
 
 		 587 aa  289  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  33.46 
 
 		 587 aa  289  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  38.64 
 
 		 581 aa  289  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  34.57 
 
 		 590 aa  288  2e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.89 
 
 		 588 aa  288  2.9999999999999996e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.69 
 
 		 577 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  35.48 
 
 		 1228 aa  285  2.0000000000000002e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  36.23 
 
 		 619 aa  283  5.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  36.86 
 
 		 577 aa  283  8.000000000000001e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  35.31 
 
 		 600 aa  282  1e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  36.82 
 
 		 592 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  34.81 
 
 		 604 aa  280  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  33 
 
 		 579 aa  280  7e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.09 
 
 		 589 aa  280  7e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.93 
 
 		 581 aa  279  1e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  36.7 
 
 		 578 aa  278  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  33.6 
 
 		 579 aa  276  5e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  35.5 
 
 		 574 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2339  ABC transporter component  32.59 
 
 		 582 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.667532  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.95 
 
 		 579 aa  274  3e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.66 
 
 		 595 aa  272  1e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  32.66 
 
 		 577 aa  271  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.06 
 
 		 572 aa  271  2.9999999999999997e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  32.66 
 
 		 577 aa  271  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  33.73 
 
 		 581 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  33.74 
 
 		 618 aa  270  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3043  ABC transporter related  33.47 
 
 		 598 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.22 
 
 		 1091 aa  270  7e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  34.32 
 
 		 600 aa  270  8e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  33.2 
 
 		 578 aa  268  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.66 
 
 		 574 aa  268  2.9999999999999995e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  32.62 
 
 		 578 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  32.62 
 
 		 578 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.09 
 
 		 597 aa  267  4e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.41 
 
 		 590 aa  267  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.45 
 
 		 580 aa  265  2e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.68 
 
 		 593 aa  265  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.34 
 
 		 581 aa  264  3e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.17 
 
 		 577 aa  264  3e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1036  ABC transporter related protein  31.72 
 
 		 579 aa  264  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188433  normal  0.0545959 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  34.6 
 
 		 595 aa  264  4e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  33.51 
 
 		 1194 aa  263  8e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  35.19 
 
 		 608 aa  262  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  31.24 
 
 		 590 aa  262  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  33.28 
 
 		 609 aa  262  1e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.73 
 
 		 580 aa  261  2e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  34.73 
 
 		 578 aa  260  6e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  34.73 
 
 		 578 aa  260  6e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  35.44 
 
 		 611 aa  259  7e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  35.1 
 
 		 574 aa  259  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0341  ABC transporter related  33.59 
 
 		 592 aa  259  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  37.16 
 
 		 565 aa  259  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.39 
 
 		 603 aa  258  2e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  32.13 
 
 		 583 aa  258  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.84 
 
 		 576 aa  258  3e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.97 
 
 		 577 aa  257  4e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  34.3 
 
 		 1138 aa  257  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.71 
 
 		 593 aa  256  6e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.95 
 
 		 581 aa  256  9e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.63 
 
 		 573 aa  255  1.0000000000000001e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  33.65 
 
 		 581 aa  255  1.0000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  33.45 
 
 		 593 aa  254  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  35.67 
 
 		 616 aa  254  4.0000000000000004e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.02 
 
 		 574 aa  253  7e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  36.58 
 
 		 599 aa  252  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0191  ABC transporter related  32.61 
 
 		 579 aa  251  3e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.059505  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  36.08 
 
 		 606 aa  251  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  33.06 
 
 		 573 aa  250  4e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  34.55 
 
 		 581 aa  250  4e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0189  ABC transporter related  33.83 
 
 		 576 aa  250  4e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.087717  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  33.06 
 
 		 573 aa  250  5e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>