More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2603 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  100 
 
 		 581 aa  1161    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  38.54 
 
 		 576 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  36.72 
 
 		 579 aa  358  9.999999999999999e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3043  ABC transporter related  37.56 
 
 		 598 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  36.31 
 
 		 581 aa  356  7.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  36.99 
 
 		 587 aa  352  1e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  35.58 
 
 		 579 aa  348  1e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  33.75 
 
 		 578 aa  346  7e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  33.75 
 
 		 578 aa  346  7e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  36.15 
 
 		 611 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.16 
 
 		 581 aa  341  2e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.27 
 
 		 577 aa  341  2e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  34.92 
 
 		 577 aa  340  5e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  40.11 
 
 		 581 aa  339  9e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  32.69 
 
 		 577 aa  339  9e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  32.69 
 
 		 577 aa  339  9e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  33.57 
 
 		 588 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  38.87 
 
 		 565 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  38.49 
 
 		 596 aa  338  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.69 
 
 		 577 aa  335  1e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.06 
 
 		 579 aa  334  3e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  35.97 
 
 		 584 aa  332  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.49 
 
 		 588 aa  331  2e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  37.5 
 
 		 607 aa  331  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  34.49 
 
 		 581 aa  325  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  37.03 
 
 		 592 aa  325  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  39.52 
 
 		 577 aa  325  2e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  36.88 
 
 		 581 aa  322  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.81 
 
 		 581 aa  320  6e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  34.22 
 
 		 581 aa  320  6e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  33.72 
 
 		 592 aa  319  7.999999999999999e-86  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  37.89 
 
 		 578 aa  317  3e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  37.25 
 
 		 578 aa  317  5e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  37.95 
 
 		 1228 aa  316  7e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2008  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.06 
 
 		 585 aa  315  9.999999999999999e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  38.14 
 
 		 593 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  33.11 
 
 		 597 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  33.4 
 
 		 574 aa  311  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  37.39 
 
 		 606 aa  311  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  34.67 
 
 		 579 aa  311  2.9999999999999997e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.28 
 
 		 585 aa  311  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  33.16 
 
 		 585 aa  310  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  37.47 
 
 		 577 aa  310  5.9999999999999995e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.61 
 
 		 568 aa  308  1.0000000000000001e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  31.55 
 
 		 587 aa  307  4.0000000000000004e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  31.55 
 
 		 587 aa  307  4.0000000000000004e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  32.97 
 
 		 583 aa  306  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.72 
 
 		 593 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  35.84 
 
 		 611 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  34.46 
 
 		 588 aa  304  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.89 
 
 		 574 aa  303  4.0000000000000003e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  36.66 
 
 		 574 aa  302  9e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  32.53 
 
 		 599 aa  301  2e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  32.33 
 
 		 604 aa  299  8e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  33.87 
 
 		 590 aa  299  9e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.6 
 
 		 580 aa  297  4e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.62 
 
 		 573 aa  296  6e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.62 
 
 		 582 aa  296  7e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.5 
 
 		 574 aa  295  1e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  36.47 
 
 		 578 aa  296  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  36.47 
 
 		 578 aa  296  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.57 
 
 		 576 aa  295  1e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4512  ABC transporter component  36.38 
 
 		 575 aa  295  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  31.38 
 
 		 593 aa  295  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  36.51 
 
 		 575 aa  294  3e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  33.22 
 
 		 579 aa  294  4e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4419  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.76 
 
 		 581 aa  293  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1331  ABC transporter related  32.68 
 
 		 609 aa  293  6e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134992  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.83 
 
 		 593 aa  293  7e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  36.48 
 
 		 618 aa  292  9e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54970  ABC transporter  36.51 
 
 		 585 aa  292  9e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479716  unclonable  4.5900199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  36.07 
 
 		 578 aa  292  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.41 
 
 		 583 aa  292  1e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.3 
 
 		 618 aa  292  1e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.9 
 
 		 603 aa  291  2e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.92 
 
 		 589 aa  291  2e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3042  ABC transporter related  34.62 
 
 		 611 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  33.27 
 
 		 619 aa  291  3e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  34.27 
 
 		 600 aa  290  6e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31 
 
 		 573 aa  289  7e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  34.46 
 
 		 608 aa  290  7e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  34.27 
 
 		 593 aa  289  8e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0676  ABC transporter related protein  33.07 
 
 		 573 aa  289  9e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2339  ABC transporter component  35.79 
 
 		 582 aa  289  9e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.667532  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  38.84 
 
 		 598 aa  289  1e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  39.79 
 
 		 596 aa  288  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0628  ABC transporter, ATP-binding protein  30.05 
 
 		 573 aa  288  2e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.484282  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  33.63 
 
 		 605 aa  287  2.9999999999999996e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21670  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.23 
 
 		 670 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  35.04 
 
 		 663 aa  287  4e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.65 
 
 		 591 aa  287  4e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.84 
 
 		 597 aa  287  5e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1050  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.67 
 
 		 609 aa  286  5e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.718087  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0708  ABC transporter related  30.22 
 
 		 573 aa  287  5e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153727  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  38.4 
 
 		 603 aa  286  9e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  37 
 
 		 582 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  33.39 
 
 		 612 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  33.77 
 
 		 652 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.06 
 
 		 612 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  32.23 
 
 		 581 aa  284  3.0000000000000004e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>