More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1441 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  55.83 
 
 		 600 aa  642    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1441  ABC transporter related  100 
 
 		 606 aa  1218    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2442  ABC transporter related  61.85 
 
 		 634 aa  583  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0403227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3018  ABC transporter related  55.94 
 
 		 595 aa  540  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1572  ABC transporter related protein  43.47 
 
 		 591 aa  464  1e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.722294  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  39.54 
 
 		 596 aa  336  7.999999999999999e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  37.25 
 
 		 581 aa  328  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  38.65 
 
 		 577 aa  327  3e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  35.86 
 
 		 581 aa  317  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  37.84 
 
 		 576 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  32.99 
 
 		 587 aa  306  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  32.99 
 
 		 587 aa  306  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  38.64 
 
 		 607 aa  306  9.000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4444  ABC transporter related  35.66 
 
 		 577 aa  306  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  37.8 
 
 		 593 aa  299  1e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  36.31 
 
 		 593 aa  297  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  36.96 
 
 		 574 aa  297  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4512  ABC transporter component  36.71 
 
 		 575 aa  295  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4045  ABC transporter related  35.06 
 
 		 582 aa  292  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2824  ABC transporter related protein  36.2 
 
 		 571 aa  292  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866997  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.22 
 
 		 597 aa  291  3e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  35.51 
 
 		 581 aa  291  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.54 
 
 		 581 aa  290  4e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  33.27 
 
 		 579 aa  289  1e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  34.97 
 
 		 583 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  34.76 
 
 		 584 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.7 
 
 		 581 aa  282  1e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  33.83 
 
 		 611 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  35.54 
 
 		 619 aa  277  4e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  35.09 
 
 		 578 aa  276  9e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  34.43 
 
 		 579 aa  275  1.0000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.27 
 
 		 577 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.25 
 
 		 581 aa  275  2.0000000000000002e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.63 
 
 		 577 aa  274  3e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.4 
 
 		 589 aa  273  5.000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  35.59 
 
 		 578 aa  273  5.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  35.69 
 
 		 597 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  34.46 
 
 		 587 aa  271  2.9999999999999997e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.59 
 
 		 574 aa  270  4e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  35.73 
 
 		 1228 aa  270  4e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  33.47 
 
 		 579 aa  271  4e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  35.95 
 
 		 618 aa  270  5e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  35.02 
 
 		 604 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.93 
 
 		 573 aa  268  2e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.96 
 
 		 581 aa  268  2e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  35.26 
 
 		 581 aa  267  5e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1036  ABC transporter related protein  33.39 
 
 		 579 aa  266  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188433  normal  0.0545959 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.41 
 
 		 588 aa  264  4e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  36.01 
 
 		 592 aa  263  6.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  35.79 
 
 		 595 aa  263  8e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.88 
 
 		 1091 aa  263  8.999999999999999e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  36.53 
 
 		 565 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2339  ABC transporter component  33.22 
 
 		 582 aa  261  4e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.667532  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  32.17 
 
 		 574 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  34.48 
 
 		 590 aa  260  6e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  33.87 
 
 		 1138 aa  259  8e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.3 
 
 		 568 aa  259  1e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  34.19 
 
 		 577 aa  259  1e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  30.12 
 
 		 578 aa  259  1e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  30.12 
 
 		 578 aa  259  1e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.86 
 
 		 618 aa  258  3e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.01 
 
 		 576 aa  258  3e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  33.65 
 
 		 616 aa  257  4e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1491  ABC transporter related  32.68 
 
 		 584 aa  257  4e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  34.41 
 
 		 596 aa  257  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.48 
 
 		 580 aa  257  5e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  33.26 
 
 		 588 aa  256  8e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  33.13 
 
 		 592 aa  255  1.0000000000000001e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  30.2 
 
 		 577 aa  256  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  30.2 
 
 		 577 aa  256  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.9 
 
 		 590 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  37.04 
 
 		 579 aa  253  9.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  37.3 
 
 		 627 aa  253  9.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0676  ABC transporter related protein  31.42 
 
 		 573 aa  251  2e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1472  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.75 
 
 		 628 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868614  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  35.67 
 
 		 593 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.08 
 
 		 596 aa  252  2e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4419  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.53 
 
 		 581 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  34.75 
 
 		 600 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  33.2 
 
 		 579 aa  252  2e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.92 
 
 		 579 aa  251  3e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  37.1 
 
 		 581 aa  251  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  35.23 
 
 		 600 aa  251  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  31.5 
 
 		 584 aa  251  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.73 
 
 		 595 aa  250  5e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  31.21 
 
 		 590 aa  250  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0882  ABC transporter, transmembrane region  34.68 
 
 		 592 aa  250  5e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3043  ABC transporter related  34.69 
 
 		 598 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54970  ABC transporter  36.36 
 
 		 585 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479716  unclonable  4.5900199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.72 
 
 		 603 aa  248  2e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  33.44 
 
 		 609 aa  248  3e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2216  ABC transporter related  34.64 
 
 		 651 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298218  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3042  ABC transporter related  32.55 
 
 		 611 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.04 
 
 		 573 aa  246  8e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.3 
 
 		 627 aa  246  9.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  33.1 
 
 		 1194 aa  246  9.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  31.36 
 
 		 625 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  34.01 
 
 		 580 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0341  ABC transporter related  32.41 
 
 		 592 aa  244  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  33.47 
 
 		 599 aa  244  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>