More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2454 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  100 
 
 
577 aa  1172    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  100 
 
 
577 aa  1172    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  48.71 
 
 
574 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  47.26 
 
 
581 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  42.99 
 
 
588 aa  503  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  41.2 
 
 
605 aa  496  1e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.11 
 
 
588 aa  478  1e-133  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.94 
 
 
574 aa  473  1e-132  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  37.23 
 
 
577 aa  447  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  37.41 
 
 
587 aa  445  1e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  39.93 
 
 
578 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  39.93 
 
 
578 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.8 
 
 
582 aa  438  1e-121  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.12 
 
 
577 aa  437  1e-121  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  38.21 
 
 
579 aa  433  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.7 
 
 
579 aa  431  1e-119  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.17 
 
 
577 aa  411  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  37.31 
 
 
581 aa  402  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2008  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.52 
 
 
585 aa  363  4e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.9 
 
 
581 aa  352  8.999999999999999e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.07 
 
 
581 aa  347  3e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  32.32 
 
 
576 aa  345  1e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  39.02 
 
 
579 aa  343  5.999999999999999e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  34.83 
 
 
581 aa  341  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  35.16 
 
 
593 aa  335  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.82 
 
 
593 aa  332  8e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  36.38 
 
 
578 aa  331  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  32.86 
 
 
592 aa  326  6e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  35.87 
 
 
579 aa  323  7e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  30.98 
 
 
579 aa  315  9.999999999999999e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  32.32 
 
 
598 aa  315  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  33.4 
 
 
577 aa  313  3.9999999999999997e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  32.99 
 
 
596 aa  313  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  33.93 
 
 
581 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  35.4 
 
 
592 aa  312  7.999999999999999e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  32 
 
 
577 aa  313  7.999999999999999e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  33.79 
 
 
631 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36 
 
 
568 aa  308  1.0000000000000001e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  34.81 
 
 
597 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  34.21 
 
 
611 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.99 
 
 
572 aa  305  1.0000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.37 
 
 
597 aa  303  4.0000000000000003e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.94 
 
 
576 aa  300  5e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  34.35 
 
 
604 aa  300  6e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  35.22 
 
 
616 aa  300  6e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  33.6 
 
 
593 aa  299  9e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3043  ABC transporter related  30.96 
 
 
598 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.98 
 
 
596 aa  297  3e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.57 
 
 
574 aa  297  4e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.77 
 
 
573 aa  296  5e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  30.82 
 
 
612 aa  296  6e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  34.46 
 
 
582 aa  296  8e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  32.02 
 
 
619 aa  295  1e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.98 
 
 
581 aa  294  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0676  ABC transporter related protein  35.66 
 
 
573 aa  294  3e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  30.52 
 
 
590 aa  293  7e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  31.87 
 
 
565 aa  293  7e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  36.17 
 
 
599 aa  293  8e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  32.64 
 
 
574 aa  292  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  29.51 
 
 
607 aa  291  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.37 
 
 
1091 aa  291  3e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  32.88 
 
 
596 aa  290  4e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  30.24 
 
 
600 aa  290  4e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  31.38 
 
 
1228 aa  288  1e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  27.95 
 
 
581 aa  288  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1036  ABC transporter related protein  29.05 
 
 
579 aa  288  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188433  normal  0.0545959 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.48 
 
 
618 aa  287  2.9999999999999996e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.78 
 
 
603 aa  287  4e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  29.62 
 
 
571 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  33.73 
 
 
595 aa  286  7e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  31.59 
 
 
583 aa  286  7e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  31.15 
 
 
584 aa  286  8e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.25 
 
 
572 aa  286  9e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.09 
 
 
589 aa  285  1.0000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  34.58 
 
 
575 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0316  ABC transporter related  33.67 
 
 
607 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  33.96 
 
 
613 aa  285  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  33.53 
 
 
608 aa  285  2.0000000000000002e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  34.26 
 
 
606 aa  285  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  34.18 
 
 
590 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.07 
 
 
581 aa  284  3.0000000000000004e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  33.13 
 
 
618 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  31.56 
 
 
566 aa  284  3.0000000000000004e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2510  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.19 
 
 
577 aa  284  4.0000000000000003e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.4 
 
 
573 aa  283  5.000000000000001e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  31.52 
 
 
603 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  33.2 
 
 
581 aa  282  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  32.21 
 
 
613 aa  282  1e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2339  ABC transporter component  32.26 
 
 
582 aa  282  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.667532  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  31.81 
 
 
603 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  32.08 
 
 
588 aa  281  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  29.85 
 
 
608 aa  281  2e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  31.68 
 
 
581 aa  281  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  30.76 
 
 
597 aa  281  3e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  31.56 
 
 
640 aa  281  3e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.43 
 
 
580 aa  281  3e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  35.49 
 
 
573 aa  280  4e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  34.32 
 
 
573 aa  280  5e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  31.23 
 
 
579 aa  280  5e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  34.55 
 
 
587 aa  280  6e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>