More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0244 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  100 
 
 		 574 aa  1174    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.11 
 
 		 572 aa  317  4e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  35.26 
 
 		 611 aa  312  9e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  34.22 
 
 		 581 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  36.25 
 
 		 593 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  37 
 
 		 599 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.47 
 
 		 588 aa  306  7e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  35.88 
 
 		 577 aa  306  8.000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  34.57 
 
 		 576 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  32.54 
 
 		 596 aa  303  6.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.57 
 
 		 589 aa  300  5e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.09 
 
 		 595 aa  298  1e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  36.82 
 
 		 579 aa  298  1e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  34.83 
 
 		 579 aa  297  3e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  36.57 
 
 		 577 aa  297  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  36.57 
 
 		 577 aa  297  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.77 
 
 		 582 aa  295  2e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  33.57 
 
 		 588 aa  295  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.58 
 
 		 577 aa  293  6e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.8 
 
 		 597 aa  293  7e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  30.69 
 
 		 602 aa  292  9e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  33.99 
 
 		 593 aa  292  9e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  35.09 
 
 		 592 aa  292  9e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.96 
 
 		 581 aa  291  2e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  33.81 
 
 		 577 aa  291  2e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  33.21 
 
 		 587 aa  291  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  33.21 
 
 		 587 aa  291  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.02 
 
 		 581 aa  290  4e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  34.01 
 
 		 588 aa  289  9e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  33.15 
 
 		 584 aa  289  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  33.27 
 
 		 587 aa  289  1e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  30.85 
 
 		 607 aa  288  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  32.96 
 
 		 618 aa  287  5e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  33.92 
 
 		 582 aa  286  5e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.69 
 
 		 596 aa  285  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.72 
 
 		 577 aa  286  1.0000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  33.33 
 
 		 565 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0191  ABC transporter related  33.51 
 
 		 579 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.059505  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  31.53 
 
 		 581 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  37.66 
 
 		 581 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34 
 
 		 579 aa  282  1e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  34.67 
 
 		 613 aa  282  1e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  32.57 
 
 		 600 aa  282  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  35.14 
 
 		 575 aa  282  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.23 
 
 		 574 aa  281  2e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  32.52 
 
 		 604 aa  281  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  33.67 
 
 		 598 aa  280  4e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  35.2 
 
 		 592 aa  280  5e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  34.5 
 
 		 574 aa  279  8e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  34.94 
 
 		 580 aa  278  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  33.14 
 
 		 571 aa  278  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  35.41 
 
 		 584 aa  278  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  33.83 
 
 		 584 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  32.88 
 
 		 1194 aa  277  4e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  32.95 
 
 		 597 aa  276  7e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  34.92 
 
 		 595 aa  276  8e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  31.33 
 
 		 583 aa  276  9e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  35.09 
 
 		 578 aa  276  9e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  34.99 
 
 		 616 aa  276  1.0000000000000001e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  33.03 
 
 		 572 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  32.14 
 
 		 606 aa  275  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  34.17 
 
 		 590 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  33.46 
 
 		 578 aa  274  4.0000000000000004e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  33.46 
 
 		 578 aa  274  4.0000000000000004e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  35.06 
 
 		 593 aa  273  5.000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  32.12 
 
 		 605 aa  273  5.000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  34.56 
 
 		 580 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.32 
 
 		 581 aa  273  6e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  32.73 
 
 		 572 aa  273  8.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  34.5 
 
 		 597 aa  273  9e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  33.33 
 
 		 579 aa  272  1e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  34.5 
 
 		 597 aa  272  1e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  34.57 
 
 		 620 aa  272  1e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.89 
 
 		 581 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  33.76 
 
 		 610 aa  271  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  34.42 
 
 		 582 aa  271  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  33.05 
 
 		 581 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  34.66 
 
 		 574 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  36.59 
 
 		 588 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  32.81 
 
 		 600 aa  269  8e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.03 
 
 		 568 aa  269  8.999999999999999e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.15 
 
 		 572 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  32.26 
 
 		 579 aa  269  8.999999999999999e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.03 
 
 		 593 aa  269  1e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  34.6 
 
 		 650 aa  269  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  31.76 
 
 		 601 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  31.18 
 
 		 601 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.11 
 
 		 571 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  34.15 
 
 		 599 aa  267  2.9999999999999995e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 600 aa  267  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.17 
 
 		 576 aa  267  4e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  32.62 
 
 		 575 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.66 
 
 		 603 aa  266  8e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  32.08 
 
 		 590 aa  266  8e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  34.69 
 
 		 628 aa  266  8.999999999999999e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.38 
 
 		 581 aa  265  1e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  31.93 
 
 		 571 aa  266  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.93 
 
 		 571 aa  265  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.93 
 
 		 571 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.93 
 
 		 571 aa  266  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>