More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1490 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  100 
 
 
597 aa  1208    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  41.98 
 
 
603 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  42.73 
 
 
611 aa  427  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  47.27 
 
 
596 aa  405  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  40.29 
 
 
606 aa  379  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.37 
 
 
612 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  38.62 
 
 
588 aa  368  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  38.89 
 
 
598 aa  364  2e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2596  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  38.09 
 
 
597 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.588652  normal  0.0388843 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3091  ABC transporter related  37.93 
 
 
624 aa  347  5e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1035  ABC transporter related protein  42.18 
 
 
619 aa  336  9e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00381243  normal  0.0281832 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4420  ABC transporter permease/ATP-binding protein  40.4 
 
 
605 aa  320  5e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  35.14 
 
 
593 aa  313  6.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  33.16 
 
 
611 aa  310  6.999999999999999e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  32.98 
 
 
604 aa  306  6e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  32.76 
 
 
592 aa  305  1.0000000000000001e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  34.45 
 
 
578 aa  305  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  33.75 
 
 
619 aa  305  2.0000000000000002e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  35.22 
 
 
597 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11378  drug ABC transporter ATP-binding protein  35.94 
 
 
859 aa  302  1e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.16 
 
 
597 aa  301  2e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.2 
 
 
589 aa  300  4e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  35.38 
 
 
580 aa  299  9e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  33.91 
 
 
590 aa  298  3e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.03 
 
 
581 aa  296  1e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.57 
 
 
618 aa  291  2e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.43 
 
 
627 aa  289  1e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  33.85 
 
 
596 aa  289  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.14 
 
 
593 aa  286  7e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  30.7 
 
 
602 aa  286  9e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  32.52 
 
 
599 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  34.9 
 
 
575 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  35.93 
 
 
596 aa  283  8.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  34.44 
 
 
608 aa  282  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  31.31 
 
 
609 aa  278  2e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  30.32 
 
 
587 aa  277  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  30.32 
 
 
587 aa  277  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  32.32 
 
 
576 aa  276  8e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  31.49 
 
 
1194 aa  275  1.0000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  35.71 
 
 
582 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  36.22 
 
 
595 aa  275  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  34.76 
 
 
1138 aa  273  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  30.43 
 
 
599 aa  271  2e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.08 
 
 
583 aa  270  5e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  34.99 
 
 
600 aa  270  7e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.92 
 
 
580 aa  270  8e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  33.2 
 
 
573 aa  269  1e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  33.2 
 
 
573 aa  269  1e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  33.83 
 
 
593 aa  269  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.06 
 
 
1091 aa  267  5e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  34.38 
 
 
571 aa  265  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.61 
 
 
596 aa  266  1e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.54 
 
 
576 aa  266  1e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.63 
 
 
573 aa  265  2e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0843  ABC transporter component  32.05 
 
 
577 aa  265  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00459321  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  31.14 
 
 
584 aa  263  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  32.97 
 
 
677 aa  262  1e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.94 
 
 
598 aa  261  3e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  34.17 
 
 
618 aa  261  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  33.4 
 
 
598 aa  261  4e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.32 
 
 
595 aa  259  7e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  34.6 
 
 
609 aa  259  1e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  33.22 
 
 
581 aa  258  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  32.63 
 
 
811 aa  257  5e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2311  ABC transporter related  33.83 
 
 
695 aa  257  5e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.28541  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  33.85 
 
 
765 aa  257  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  33.14 
 
 
606 aa  256  7e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  34.15 
 
 
579 aa  256  7e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  32.82 
 
 
581 aa  256  9e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  34.69 
 
 
588 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  32.28 
 
 
600 aa  255  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  34.06 
 
 
607 aa  254  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.59 
 
 
590 aa  253  6e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
663 aa  253  6e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0658  ABC transporter related  34.54 
 
 
750 aa  253  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  37.25 
 
 
578 aa  253  7e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  33.15 
 
 
1228 aa  253  8.000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  30.41 
 
 
590 aa  252  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  34.34 
 
 
770 aa  252  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  31.34 
 
 
586 aa  253  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  35.42 
 
 
611 aa  251  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.16 
 
 
622 aa  250  5e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.72 
 
 
588 aa  250  5e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  31.24 
 
 
577 aa  250  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  31.24 
 
 
577 aa  250  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0189  ABC transporter related  33.85 
 
 
576 aa  250  6e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.087717  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  34.53 
 
 
627 aa  250  6e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  32.41 
 
 
588 aa  249  7e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.12 
 
 
596 aa  249  1e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1316  ABC transporter related  32.7 
 
 
784 aa  249  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512065  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0672  ABC transporter related  34.92 
 
 
777 aa  249  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.264122  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.01 
 
 
593 aa  249  1e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  34.8 
 
 
611 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  31.02 
 
 
587 aa  248  3e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.61 
 
 
581 aa  248  3e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  32.91 
 
 
608 aa  247  4e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  30.21 
 
 
597 aa  247  4e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  32.02 
 
 
579 aa  247  4e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  30.21 
 
 
597 aa  247  4e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4991  ABC transporter related  33.4 
 
 
808 aa  247  4.9999999999999997e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>