More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0675 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0675  ABC transporter related protein  100 
 
 
584 aa  1172    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0627  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  61.64 
 
 
584 aa  742    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.746647  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0707  ABC transporter related  61.64 
 
 
584 aa  743    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0139832  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0819  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  48.01 
 
 
578 aa  579  1e-164  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608136  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  35.52 
 
 
596 aa  371  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.4 
 
 
618 aa  352  1e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.94 
 
 
573 aa  350  5e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  31.83 
 
 
609 aa  326  7e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  35.11 
 
 
604 aa  325  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  35 
 
 
597 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.45 
 
 
627 aa  320  3.9999999999999996e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  34.3 
 
 
611 aa  319  7e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  34.84 
 
 
599 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  35.64 
 
 
592 aa  309  1.0000000000000001e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  40.05 
 
 
578 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  40.05 
 
 
578 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.61 
 
 
1091 aa  283  6.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  33.85 
 
 
590 aa  276  9e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  29.93 
 
 
602 aa  270  4e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.3 
 
 
593 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.51 
 
 
581 aa  268  2e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  31.8 
 
 
598 aa  267  4e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  35.09 
 
 
578 aa  265  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.84 
 
 
576 aa  265  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.34 
 
 
595 aa  263  8e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  34.4 
 
 
588 aa  261  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  30.78 
 
 
593 aa  261  4e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.11 
 
 
590 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  31.68 
 
 
579 aa  258  3e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  28.98 
 
 
588 aa  256  7e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  28.11 
 
 
590 aa  256  8e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.41 
 
 
581 aa  256  1.0000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  29.7 
 
 
611 aa  254  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  30.5 
 
 
619 aa  254  4.0000000000000004e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  30.36 
 
 
593 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.63 
 
 
583 aa  253  5.000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.27 
 
 
583 aa  253  6e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.19 
 
 
588 aa  252  1e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.65 
 
 
577 aa  249  7e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  33.27 
 
 
581 aa  249  9e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  35.39 
 
 
577 aa  249  9e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  35.39 
 
 
577 aa  249  9e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  47.37 
 
 
581 aa  249  1e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.77 
 
 
589 aa  248  2e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  30.63 
 
 
608 aa  247  4e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  27.97 
 
 
584 aa  246  8e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1331  ABC transporter related  28.6 
 
 
596 aa  246  8e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  29.75 
 
 
600 aa  245  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  31.3 
 
 
579 aa  244  3e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  33.19 
 
 
581 aa  244  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  32.63 
 
 
1228 aa  244  3e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.19 
 
 
582 aa  244  3.9999999999999997e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.55 
 
 
574 aa  243  7.999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  30.43 
 
 
587 aa  243  7.999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  30.43 
 
 
587 aa  243  7.999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  31.74 
 
 
577 aa  242  1e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  30.89 
 
 
573 aa  241  2e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  30.98 
 
 
573 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  28.43 
 
 
606 aa  240  5e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  30 
 
 
580 aa  239  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  32.03 
 
 
607 aa  238  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  27.5 
 
 
1138 aa  238  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  28.45 
 
 
579 aa  237  5.0000000000000005e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3091  ABC transporter related  30.3 
 
 
624 aa  236  6e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.15 
 
 
580 aa  235  2.0000000000000002e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  29.62 
 
 
574 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  30.7 
 
 
600 aa  235  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  27.85 
 
 
595 aa  235  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  42.51 
 
 
577 aa  234  5e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.69 
 
 
577 aa  233  7.000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.64 
 
 
582 aa  232  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  29.82 
 
 
576 aa  233  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.78 
 
 
597 aa  231  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.52 
 
 
597 aa  230  5e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.26 
 
 
582 aa  230  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  29.7 
 
 
583 aa  230  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.53 
 
 
572 aa  229  7e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  28.75 
 
 
587 aa  230  7e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0628  ABC transporter, ATP-binding protein  32.3 
 
 
573 aa  229  1e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.484282  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  31.17 
 
 
605 aa  228  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  42.69 
 
 
581 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.52 
 
 
582 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.52 
 
 
582 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.52 
 
 
582 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.52 
 
 
582 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.62 
 
 
593 aa  228  3e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  28.3 
 
 
599 aa  228  3e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.52 
 
 
582 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  26.69 
 
 
677 aa  227  5.0000000000000005e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.58 
 
 
582 aa  226  6e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  29.39 
 
 
608 aa  226  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  42.4 
 
 
579 aa  226  8e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  30.57 
 
 
593 aa  226  8e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0676  ABC transporter related protein  31.48 
 
 
573 aa  225  1e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  30.77 
 
 
597 aa  226  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0708  ABC transporter related  30.2 
 
 
573 aa  225  2e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153727  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.28 
 
 
581 aa  225  2e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.37 
 
 
582 aa  225  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.6 
 
 
582 aa  225  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.03 
 
 
582 aa  224  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>