More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0627 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0819  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  54.15 
 
 
578 aa  635    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608136  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0675  ABC transporter related protein  61.64 
 
 
584 aa  742    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0627  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  100 
 
 
584 aa  1170    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.746647  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0707  ABC transporter related  90.75 
 
 
584 aa  1079    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0139832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  38.1 
 
 
596 aa  386  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.08 
 
 
573 aa  375  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.87 
 
 
618 aa  370  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  32.45 
 
 
609 aa  342  9e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  33.89 
 
 
611 aa  339  7e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.84 
 
 
627 aa  337  3.9999999999999995e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  34.13 
 
 
592 aa  335  9e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  35.19 
 
 
599 aa  330  3e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  34.83 
 
 
604 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  35.62 
 
 
597 aa  327  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.7 
 
 
576 aa  294  2e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  33.9 
 
 
590 aa  286  5.999999999999999e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  29.67 
 
 
602 aa  285  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.67 
 
 
595 aa  285  2.0000000000000002e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  32.04 
 
 
578 aa  282  1e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  32.04 
 
 
578 aa  282  1e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  30.9 
 
 
590 aa  279  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.25 
 
 
1091 aa  278  2e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.9 
 
 
590 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  31.77 
 
 
619 aa  277  4e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  31.39 
 
 
579 aa  272  1e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  33.14 
 
 
593 aa  269  8e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  31.47 
 
 
593 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  31.38 
 
 
579 aa  265  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.28 
 
 
580 aa  265  2e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.24 
 
 
589 aa  263  6e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  31.09 
 
 
611 aa  262  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  34.66 
 
 
1228 aa  262  1e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  29.17 
 
 
588 aa  261  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  27.96 
 
 
588 aa  260  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.95 
 
 
588 aa  259  7e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.81 
 
 
574 aa  258  1e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  33.14 
 
 
606 aa  259  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  31.94 
 
 
574 aa  258  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.3 
 
 
583 aa  255  1.0000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  30.12 
 
 
587 aa  255  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  30.12 
 
 
587 aa  255  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  29.1 
 
 
677 aa  255  1.0000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.6 
 
 
593 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  28.36 
 
 
584 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  48.39 
 
 
578 aa  254  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.83 
 
 
597 aa  254  4.0000000000000004e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.27 
 
 
577 aa  253  5.000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  37.4 
 
 
577 aa  253  7e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  37.4 
 
 
577 aa  253  7e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  28.13 
 
 
595 aa  253  8.000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  29.37 
 
 
608 aa  253  9.000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  31.54 
 
 
598 aa  251  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  30 
 
 
599 aa  249  1e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  29.84 
 
 
581 aa  248  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  30.04 
 
 
600 aa  247  4.9999999999999997e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  30.57 
 
 
573 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  30.46 
 
 
573 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.28 
 
 
572 aa  244  3.9999999999999997e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  29.02 
 
 
580 aa  243  7e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.8 
 
 
581 aa  243  7.999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  30.29 
 
 
600 aa  243  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  47.15 
 
 
581 aa  241  2e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.98 
 
 
593 aa  241  2.9999999999999997e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1331  ABC transporter related  27.77 
 
 
596 aa  241  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3091  ABC transporter related  32.06 
 
 
624 aa  239  8e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.7 
 
 
582 aa  238  2e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  34.33 
 
 
577 aa  238  2e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.13 
 
 
581 aa  236  8e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  30.62 
 
 
597 aa  236  9e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  31.43 
 
 
575 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  34.22 
 
 
585 aa  235  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0676  ABC transporter related protein  32.33 
 
 
573 aa  234  3e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.22 
 
 
585 aa  234  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  27.31 
 
 
576 aa  234  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  27.5 
 
 
577 aa  234  3e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  29.59 
 
 
606 aa  234  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.29 
 
 
577 aa  233  9e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  29.28 
 
 
609 aa  232  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  27.55 
 
 
587 aa  233  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  27.09 
 
 
607 aa  231  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  30.04 
 
 
581 aa  231  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.56 
 
 
586 aa  231  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.52 
 
 
581 aa  230  6e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  32.01 
 
 
593 aa  230  7e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.52 
 
 
596 aa  229  9e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.57 
 
 
573 aa  229  1e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.13 
 
 
583 aa  229  1e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.97 
 
 
586 aa  229  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  27.82 
 
 
1194 aa  229  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.42 
 
 
603 aa  228  2e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.31 
 
 
579 aa  229  2e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  33.56 
 
 
579 aa  228  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0628  ABC transporter, ATP-binding protein  31.15 
 
 
573 aa  229  2e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.484282  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  31.12 
 
 
608 aa  228  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10871  multidrug ABC transporter  30.93 
 
 
596 aa  227  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  30.8 
 
 
571 aa  227  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  29.62 
 
 
578 aa  226  6e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  30.24 
 
 
565 aa  226  8e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.48 
 
 
612 aa  226  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  27.67 
 
 
605 aa  226  9e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>