More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0864 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0864  ABC transporter, transmembrane region  100 
 
 		 603 aa  1191    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54980  poossible ABC-type transporter protein  45.82 
 
 		 584 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875214  unclonable  5.28069e-21 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  41.05 
 
 		 593 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  41.73 
 
 		 618 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  34.42 
 
 		 593 aa  346  7e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  34.93 
 
 		 584 aa  327  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.5 
 
 		 590 aa  326  6e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  35.03 
 
 		 604 aa  325  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  33.5 
 
 		 590 aa  325  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  32.98 
 
 		 602 aa  321  1.9999999999999998e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.66 
 
 		 597 aa  311  2.9999999999999997e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  31.99 
 
 		 611 aa  309  9e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  36.53 
 
 		 606 aa  308  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  32.94 
 
 		 619 aa  303  4.0000000000000003e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.75 
 
 		 593 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  32.2 
 
 		 590 aa  303  6.000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.39 
 
 		 1091 aa  302  1e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  29.46 
 
 		 587 aa  301  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  29.46 
 
 		 587 aa  301  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  32.44 
 
 		 599 aa  301  3e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  31.47 
 
 		 597 aa  299  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  36.77 
 
 		 598 aa  298  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  33.4 
 
 		 592 aa  297  4e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  34.75 
 
 		 609 aa  293  9e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  33.07 
 
 		 599 aa  292  1e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  36.62 
 
 		 600 aa  289  1e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  31.61 
 
 		 1194 aa  288  2e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3042  ABC transporter related  32.83 
 
 		 611 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.62 
 
 		 573 aa  285  3.0000000000000004e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  32.16 
 
 		 580 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  35.48 
 
 		 608 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.41 
 
 		 580 aa  283  9e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  32.92 
 
 		 608 aa  281  2e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.18 
 
 		 581 aa  278  2e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  33.39 
 
 		 595 aa  278  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.12 
 
 		 583 aa  277  4e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.97 
 
 		 576 aa  276  6e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  34.59 
 
 		 600 aa  275  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0881  ABC transporter component  35.8 
 
 		 589 aa  274  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  33.76 
 
 		 576 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  32.18 
 
 		 585 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.92 
 
 		 589 aa  273  9e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.65 
 
 		 583 aa  270  5.9999999999999995e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  34.9 
 
 		 1138 aa  269  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  35.08 
 
 		 603 aa  268  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  30.45 
 
 		 575 aa  265  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.13 
 
 		 596 aa  261  2e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  34.27 
 
 		 677 aa  261  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0189  ABC transporter related  33.67 
 
 		 576 aa  261  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.087717  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1331  ABC transporter related  31.6 
 
 		 596 aa  261  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.04 
 
 		 595 aa  259  7e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  31.62 
 
 		 597 aa  258  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.43 
 
 		 572 aa  258  2e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  33.07 
 
 		 597 aa  258  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  34.68 
 
 		 609 aa  257  4e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  32.27 
 
 		 588 aa  257  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  33.57 
 
 		 611 aa  256  6e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  34.43 
 
 		 596 aa  256  6e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  33.93 
 
 		 565 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  30.45 
 
 		 579 aa  254  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  34.08 
 
 		 593 aa  254  3e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.3 
 
 		 627 aa  253  6e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  29.04 
 
 		 573 aa  250  5e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  29.04 
 
 		 573 aa  249  8e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  32.96 
 
 		 581 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  30.51 
 
 		 579 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3091  ABC transporter related  33.16 
 
 		 624 aa  246  6e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0191  ABC transporter related  31.6 
 
 		 579 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.059505  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  33.83 
 
 		 607 aa  246  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  37.8 
 
 		 596 aa  244  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  33.07 
 
 		 608 aa  244  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  33.33 
 
 		 592 aa  244  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  30.31 
 
 		 581 aa  243  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  33.52 
 
 		 1228 aa  242  1e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.38 
 
 		 581 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.05 
 
 		 618 aa  242  2e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  35.88 
 
 		 598 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  32.73 
 
 		 600 aa  241  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  28.6 
 
 		 579 aa  241  2.9999999999999997e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  29.92 
 
 		 638 aa  240  5e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  30.71 
 
 		 596 aa  240  5e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0819  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.74 
 
 		 578 aa  239  8e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608136  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  32.41 
 
 		 650 aa  238  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0341  ABC transporter related  32.39 
 
 		 592 aa  238  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  32.09 
 
 		 614 aa  238  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  33.97 
 
 		 578 aa  238  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  29.09 
 
 		 588 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  31.82 
 
 		 620 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  30.22 
 
 		 607 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10871  multidrug ABC transporter  28 
 
 		 596 aa  234  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0627  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.27 
 
 		 584 aa  233  8.000000000000001e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.746647  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10661  ABC transporter  31.17 
 
 		 578 aa  232  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.480699  normal  0.0347251 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  30.07 
 
 		 613 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3043  ABC transporter related  32.64 
 
 		 598 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  27.6 
 
 		 588 aa  231  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.87 
 
 		 637 aa  229  9e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2441  ABC transporter related  35.3 
 
 		 597 aa  229  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00999176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.09 
 
 		 1019 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  28.68 
 
 		 660 aa  228  2e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11378  drug ABC transporter ATP-binding protein  35.39 
 
 		 859 aa  229  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>