More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0790 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0880  putative ABC transporter, permease protein  99.83 
 
 		 575 aa  1093    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0790  putative ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 575 aa  1095    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2153  putative ATP-binding component of ABC transporter  99.83 
 
 		 575 aa  1094    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356236  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0675  ABC efflux pump, fused inner membrane and ATPase subunits  79.93 
 
 		 573 aa  780    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.018058  normal  0.847795 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1825  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  90.97 
 
 		 576 aa  910    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5292  ABC transporter related  79.96 
 
 		 574 aa  701    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.332078 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3372  ABC transporter related  79.09 
 
 		 574 aa  704    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0307564  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4995  ABC transporter related  79.09 
 
 		 574 aa  704    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.147401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0843  ABC transporter component  51.12 
 
 		 577 aa  479  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00459321  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09300  putative ATP-binding component of ABC transporter  54 
 
 		 570 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00251993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0877  ABC transporter ATP-binding protein  53.41 
 
 		 570 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0214075  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  37.32 
 
 		 606 aa  304  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  39.76 
 
 		 588 aa  303  6.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.49 
 
 		 612 aa  300  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  38.2 
 
 		 611 aa  288  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2596  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  36.1 
 
 		 597 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.588652  normal  0.0388843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  35.02 
 
 		 598 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  37.16 
 
 		 603 aa  248  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  36.63 
 
 		 578 aa  248  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  32.81 
 
 		 597 aa  244  3e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1035  ABC transporter related protein  36.65 
 
 		 619 aa  240  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00381243  normal  0.0281832 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3091  ABC transporter related  34.02 
 
 		 624 aa  238  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  31.03 
 
 		 590 aa  233  7.000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2102  ABC transporter related  32.5 
 
 		 623 aa  230  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2714  ABC transporter related  32.5 
 
 		 623 aa  230  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2741  ABC transporter related  32.58 
 
 		 623 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  28.57 
 
 		 588 aa  227  5.0000000000000005e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0585  ABC transporter related  33 
 
 		 623 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  35.06 
 
 		 607 aa  223  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  37.28 
 
 		 596 aa  223  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2632  ABC transporter related  33.28 
 
 		 623 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  32.66 
 
 		 593 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.04 
 
 		 616 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2766  ABC transporter related  33.28 
 
 		 623 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.01 
 
 		 583 aa  221  3e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  29.17 
 
 		 586 aa  221  3.9999999999999997e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  34.08 
 
 		 576 aa  220  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  31.97 
 
 		 575 aa  219  7e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  29.54 
 
 		 592 aa  219  1e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.07 
 
 		 618 aa  219  1e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4420  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.79 
 
 		 605 aa  219  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 618 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11378  drug ABC transporter ATP-binding protein  34.72 
 
 		 859 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  29.67 
 
 		 580 aa  217  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  29.44 
 
 		 579 aa  216  8e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  31.03 
 
 		 587 aa  216  9e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  31.18 
 
 		 636 aa  215  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0393  ABC transporter related  33.46 
 
 		 631 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.17883 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0672  ABC transporter related  33.33 
 
 		 629 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.798433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4027  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  33.14 
 
 		 656 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  34.91 
 
 		 578 aa  214  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  29.98 
 
 		 660 aa  213  5.999999999999999e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.72 
 
 		 608 aa  213  5.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  33.26 
 
 		 591 aa  213  7e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  33.5 
 
 		 677 aa  213  7e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  32.38 
 
 		 652 aa  213  7.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0204  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.29 
 
 		 623 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2338  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.29 
 
 		 623 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.587388  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2740  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.29 
 
 		 623 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2418  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.29 
 
 		 623 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.41 
 
 		 596 aa  212  1e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0867  ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  32.29 
 
 		 654 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0688  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.29 
 
 		 623 aa  213  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0572  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32 
 
 		 651 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620233  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  33.53 
 
 		 624 aa  213  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  28.08 
 
 		 566 aa  213  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0702  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.29 
 
 		 623 aa  213  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1736  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.45 
 
 		 627 aa  211  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0041  ABC transporter, transmembrane region, type 1  44.3 
 
 		 594 aa  212  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  32.48 
 
 		 581 aa  212  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6041  ABC transporter, fused ATPase and innermembrane subunits  32.28 
 
 		 623 aa  212  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  35.01 
 
 		 566 aa  212  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  33.65 
 
 		 592 aa  212  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  33.33 
 
 		 584 aa  211  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.35 
 
 		 566 aa  211  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  34.6 
 
 		 596 aa  211  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.1 
 
 		 588 aa  210  5e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  34.47 
 
 		 600 aa  210  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  40.59 
 
 		 629 aa  210  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  34.08 
 
 		 597 aa  210  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  33.94 
 
 		 598 aa  210  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  28.35 
 
 		 573 aa  210  6e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.86 
 
 		 581 aa  210  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  26.92 
 
 		 613 aa  210  6e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  28.98 
 
 		 604 aa  209  8e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  32.88 
 
 		 600 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.66 
 
 		 595 aa  208  2e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  29.14 
 
 		 585 aa  208  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  31.97 
 
 		 593 aa  208  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  33.16 
 
 		 594 aa  208  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  32.29 
 
 		 726 aa  209  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  31.47 
 
 		 572 aa  208  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  31.25 
 
 		 1194 aa  208  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  31.26 
 
 		 582 aa  207  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  32.46 
 
 		 651 aa  207  4e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  32.01 
 
 		 627 aa  207  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0739  ABC transport protein ATPase component  33.27 
 
 		 624 aa  207  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.191693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.06 
 
 		 603 aa  207  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.59 
 
 		 585 aa  207  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  30.06 
 
 		 579 aa  207  5e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>