More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2510 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2510  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  100 
 
 		 577 aa  1161    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0340  ABC transporter related  39.79 
 
 		 580 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0353  ABC transporter related  40.18 
 
 		 575 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3493  ABC transporter related  34.89 
 
 		 1179 aa  343  7e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1962  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  34.54 
 
 		 1201 aa  342  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4285  ABC transporter related  34.49 
 
 		 1179 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4081  ABC transporter, transmembrane region, type 1  34.49 
 
 		 1179 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3442  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.66 
 
 		 1179 aa  339  7e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.507362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1641  ABC transporter, transmembrane region, type 1  32.71 
 
 		 574 aa  330  4e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0190  ABC transporter related  31.85 
 
 		 608 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0603074  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  36 
 
 		 575 aa  311  2e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0188  ABC transporter related  32.42 
 
 		 611 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.55078  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1312  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  31.52 
 
 		 589 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000743018  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  31.62 
 
 		 598 aa  300  3e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0341  ABC transporter related  33.85 
 
 		 592 aa  298  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  36.65 
 
 		 588 aa  297  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2097  ABC transporter related  30.77 
 
 		 636 aa  296  6e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0698  ABC transporter, transmembrane region, type 1  30.44 
 
 		 579 aa  295  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.717868  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1665  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  31.31 
 
 		 578 aa  295  2e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0230718  normal  0.637803 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0822  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  30.55 
 
 		 579 aa  294  4e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00702953  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  34.4 
 
 		 597 aa  291  3e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  33.72 
 
 		 584 aa  289  8e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1786  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  30.58 
 
 		 580 aa  289  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.540323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.69 
 
 		 577 aa  289  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  31.44 
 
 		 639 aa  288  2e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0215  multidrug resistance protein 1  31.38 
 
 		 575 aa  286  9e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  37.17 
 
 		 586 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0191  ABC transporter related  34.41 
 
 		 579 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.059505  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0216  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.03 
 
 		 575 aa  286  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0040  ABC transporter related  35.23 
 
 		 550 aa  284  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  35.19 
 
 		 577 aa  284  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  35.19 
 
 		 577 aa  284  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1388  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  30.94 
 
 		 577 aa  283  7.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.96198  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1109  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  30.94 
 
 		 585 aa  283  8.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  35.55 
 
 		 590 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  30.65 
 
 		 660 aa  280  4e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  31.58 
 
 		 584 aa  280  5e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  33.27 
 
 		 650 aa  279  8e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1331  ABC transporter related  32.36 
 
 		 609 aa  278  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134992  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  34.51 
 
 		 586 aa  278  1e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  33.81 
 
 		 578 aa  278  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.33 
 
 		 591 aa  278  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  33.81 
 
 		 578 aa  278  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  34.51 
 
 		 575 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  32.74 
 
 		 597 aa  277  4e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  32.74 
 
 		 597 aa  277  4e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.72 
 
 		 586 aa  276  6e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1292  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  30.24 
 
 		 590 aa  276  8e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  35.54 
 
 		 608 aa  276  8e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.43 
 
 		 586 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1050  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.15 
 
 		 609 aa  276  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.718087  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  30.43 
 
 		 586 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  34.29 
 
 		 598 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  32.96 
 
 		 610 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  37.69 
 
 		 468 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.24 
 
 		 572 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  30.26 
 
 		 586 aa  274  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0354  ABC transporter related  32.56 
 
 		 585 aa  274  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.667911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  31.79 
 
 		 572 aa  274  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.26 
 
 		 586 aa  274  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0473  ATPase  29.48 
 
 		 588 aa  274  4.0000000000000004e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  35.6 
 
 		 550 aa  273  4.0000000000000004e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  33.85 
 
 		 601 aa  273  5.000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  30.09 
 
 		 586 aa  273  6e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  32.14 
 
 		 591 aa  273  6e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.1 
 
 		 586 aa  273  6e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.23 
 
 		 582 aa  273  7e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  30.64 
 
 		 625 aa  273  7e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  32.05 
 
 		 611 aa  273  9e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.93 
 
 		 586 aa  272  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.26 
 
 		 586 aa  272  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  32.16 
 
 		 587 aa  272  1e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  31.86 
 
 		 611 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0316  ABC transporter related  34.62 
 
 		 607 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  32.23 
 
 		 595 aa  271  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0272  ABC transporter related  29.88 
 
 		 578 aa  271  2.9999999999999997e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.933843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.21 
 
 		 582 aa  270  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  30.08 
 
 		 611 aa  270  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  34.72 
 
 		 578 aa  270  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.65 
 
 		 571 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  31.65 
 
 		 571 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.65 
 
 		 571 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.65 
 
 		 571 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.65 
 
 		 571 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.65 
 
 		 571 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  32.05 
 
 		 576 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  29.91 
 
 		 638 aa  270  5.9999999999999995e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  30.89 
 
 		 586 aa  270  7e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.48 
 
 		 571 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  32.01 
 
 		 601 aa  269  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  32.59 
 
 		 596 aa  269  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0716  ATPase  28.64 
 
 		 582 aa  269  1e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  32.01 
 
 		 601 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  33.2 
 
 		 587 aa  269  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  33.2 
 
 		 587 aa  269  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.76 
 
 		 582 aa  269  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  35.18 
 
 		 598 aa  269  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.3 
 
 		 583 aa  268  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  32.35 
 
 		 596 aa  268  2e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12051  multidrug ABC transporter  34.63 
 
 		 590 aa  268  2e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>