More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0216 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0216  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  100 
 
 
575 aa  1145    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0215  multidrug resistance protein 1  98.09 
 
 
575 aa  1127    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0272  ABC transporter related  47.9 
 
 
578 aa  539  9.999999999999999e-153  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.933843  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2302  ABC transporter related protein  48.43 
 
 
582 aa  521  1e-146  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2559  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.48 
 
 
606 aa  471  1.0000000000000001e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10350  cysteine export CydDC family ABC transporter permease subunit/ATP-binding protein CydC  38.96 
 
 
1205 aa  438  1e-121  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.247589  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1010  multidrug ABC transporter ATPase/permease  33.72 
 
 
1353 aa  381  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1721  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydC  46.92 
 
 
993 aa  354  2e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.489544 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1641  ABC transporter, transmembrane region, type 1  33.51 
 
 
574 aa  346  6e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2748  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydD  31.08 
 
 
552 aa  326  7e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.507813  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1665  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  31.71 
 
 
578 aa  323  6e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0230718  normal  0.637803 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0190  ABC transporter related  31.45 
 
 
608 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0603074  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1786  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  33.27 
 
 
580 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.540323  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0822  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  30.53 
 
 
579 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00702953  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0716  ATPase  29.55 
 
 
582 aa  313  4.999999999999999e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0188  ABC transporter related  30.12 
 
 
611 aa  311  2e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.55078  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0698  ABC transporter, transmembrane region, type 1  31.03 
 
 
579 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.717868  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1312  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  32.38 
 
 
589 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000743018  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0353  ABC transporter related  36.25 
 
 
575 aa  300  3e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2097  ABC transporter related  31.45 
 
 
636 aa  295  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2510  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.37 
 
 
577 aa  291  2e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1455  ABC transporter related  31.29 
 
 
583 aa  289  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.490863  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1292  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  29.62 
 
 
590 aa  282  1e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1962  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  30.02 
 
 
1201 aa  280  7e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072256  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1388  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  29.1 
 
 
577 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.96198  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1109  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  29.1 
 
 
585 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1879  ABC transporter, ATP-binding/permease protein CydD  29.21 
 
 
592 aa  276  6e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0473  ATPase  29.17 
 
 
588 aa  270  5e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4285  ABC transporter related  29.52 
 
 
1179 aa  270  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3493  ABC transporter related  29.28 
 
 
1179 aa  269  8e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4081  ABC transporter, transmembrane region, type 1  29.52 
 
 
1179 aa  270  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0040  ABC transporter related  34.69 
 
 
550 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3442  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.81 
 
 
1179 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.507362  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1637  ABC transporter, transmembrane region, type 1  32.35 
 
 
589 aa  260  5.0000000000000005e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.490977  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  30.07 
 
 
597 aa  257  3e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0352  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydD  29.12 
 
 
553 aa  257  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3278  ABC transporter, transmembrane region, type 1  30.49 
 
 
579 aa  256  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2634  ABC transporter-related protein  32.54 
 
 
572 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159287  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3780  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  27.27 
 
 
646 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3106  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  28.84 
 
 
643 aa  254  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  29.47 
 
 
575 aa  253  9.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3494  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  26.76 
 
 
621 aa  252  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0840  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  27.23 
 
 
645 aa  252  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  32.42 
 
 
588 aa  249  9e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0340  ABC transporter related  26.84 
 
 
580 aa  248  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  33.4 
 
 
594 aa  247  4e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0812  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  26.56 
 
 
653 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1215  transport ATP-binding protein CydD  29.92 
 
 
573 aa  246  6e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00367068  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0802  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  27.54 
 
 
595 aa  246  6.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0767  ABC transporter CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family permease/ATP-binding protein CydD  28.9 
 
 
559 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190762  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3849  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  27.24 
 
 
609 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000408655 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0908  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  29.72 
 
 
644 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3127  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  26.48 
 
 
651 aa  244  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.36 
 
 
574 aa  244  3.9999999999999997e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0710  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  27.68 
 
 
607 aa  243  6e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0156837 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.51 
 
 
571 aa  243  7e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0899  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  29.52 
 
 
642 aa  243  7e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  30.04 
 
 
582 aa  243  9e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0873  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  29.52 
 
 
644 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  27.84 
 
 
597 aa  241  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3454  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  28.23 
 
 
603 aa  242  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0184148 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  29.78 
 
 
618 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.45 
 
 
571 aa  241  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  27.83 
 
 
581 aa  240  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  29.27 
 
 
597 aa  241  4e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  27.85 
 
 
634 aa  241  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.45 
 
 
571 aa  240  5e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.45 
 
 
571 aa  240  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.45 
 
 
571 aa  240  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  31.29 
 
 
571 aa  240  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  29.27 
 
 
597 aa  240  5e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  32.45 
 
 
571 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.45 
 
 
571 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.45 
 
 
571 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  29.82 
 
 
584 aa  240  6.999999999999999e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.45 
 
 
571 aa  239  8e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  27.81 
 
 
571 aa  239  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  28.3 
 
 
666 aa  239  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02607  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  28.24 
 
 
595 aa  238  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3546  ABC transporter related  31.3 
 
 
573 aa  238  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  31.15 
 
 
572 aa  238  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3463  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  29.41 
 
 
650 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  27.44 
 
 
578 aa  237  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  27.44 
 
 
578 aa  237  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.37 
 
 
578 aa  237  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  31.98 
 
 
586 aa  237  5.0000000000000005e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  29.49 
 
 
593 aa  236  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  25.57 
 
 
585 aa  236  6e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  31.49 
 
 
582 aa  236  6e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  31.57 
 
 
608 aa  236  7e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.11 
 
 
677 aa  236  8e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1805  transport ATP-binding protein CydC  27.79 
 
 
571 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1945  transport ATP-binding protein CydC  27.79 
 
 
571 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0823  ABC transporter, transmembrane region, type 1  28.37 
 
 
558 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2023  transport ATP-binding protein CydC  27.58 
 
 
571 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.94731  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  27.21 
 
 
614 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0191  ABC transporter related  29.75 
 
 
579 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.059505  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1980  transport ATP-binding protein CydC  28 
 
 
571 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11013e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1779  ABC transporter, ATP-binding and permease  27.79 
 
 
571 aa  234  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  28.89 
 
 
601 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>