More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4994 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5293  ABC transporter related  98.3 
 
 		 587 aa  1102    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.159321 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2154  ABC transporter  78.52 
 
 		 594 aa  770    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.513956  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0791  putative ABC transporter, ATP-binding protein  78.69 
 
 		 594 aa  771    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0676  ABC efflux pump, fused inner membrane and ATPase subunits  91.08 
 
 		 594 aa  1009    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.194816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1824  ABC transporter ATP-binding protein  80.5 
 
 		 590 aa  778    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.145117  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0881  putative ABC transporter, ATP-binding protein  78.87 
 
 		 594 aa  772    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3373  ABC transporter related  100 
 
 		 588 aa  1126    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195497  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4994  ABC transporter related  100 
 
 		 588 aa  1126    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00642068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09320  putative ATP-binding component of ABC transporter  58.86 
 
 		 574 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.955623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0844  ABC transporter component  54.98 
 
 		 569 aa  487  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0878  ABC transporter ATP-binding protein  58.8 
 
 		 574 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0730898  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4512  ABC transporter component  37.21 
 
 		 575 aa  279  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  37.6 
 
 		 596 aa  269  8.999999999999999e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  40.92 
 
 		 581 aa  265  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2824  ABC transporter related protein  36.54 
 
 		 571 aa  261  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4419  ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.11 
 
 		 581 aa  252  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  34.49 
 
 		 577 aa  244  3.9999999999999997e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1036  ABC transporter related protein  38.25 
 
 		 579 aa  242  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188433  normal  0.0545959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4444  ABC transporter related  35.63 
 
 		 577 aa  238  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4045  ABC transporter related  34.12 
 
 		 582 aa  224  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2595  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  35.8 
 
 		 601 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.398767  normal  0.0147502 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  35.66 
 
 		 578 aa  223  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1491  ABC transporter related  36.56 
 
 		 584 aa  216  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  31.41 
 
 		 600 aa  206  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  34.56 
 
 		 1228 aa  199  7.999999999999999e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2339  ABC transporter component  32.24 
 
 		 582 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.667532  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1441  ABC transporter related  32.24 
 
 		 606 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11379  drug ABC transporter ATP-binding protein  31.67 
 
 		 579 aa  196  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73648 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  34.73 
 
 		 607 aa  194  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  32.18 
 
 		 576 aa  194  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  31.48 
 
 		 627 aa  192  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1331  ABC transporter related  32.45 
 
 		 596 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.73 
 
 		 581 aa  191  4e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  34.32 
 
 		 596 aa  190  7e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  31.61 
 
 		 592 aa  189  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  33.04 
 
 		 595 aa  187  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  38.7 
 
 		 614 aa  187  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.75 
 
 		 572 aa  187  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  24.91 
 
 		 579 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  31.36 
 
 		 610 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  28.42 
 
 		 593 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11970  ABC transporter, transmembrane permease and ATP binding components  31.48 
 
 		 599 aa  185  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3018  ABC transporter related  38.05 
 
 		 595 aa  185  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  31.17 
 
 		 610 aa  183  7e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  31.17 
 
 		 610 aa  183  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  30.72 
 
 		 619 aa  182  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  32.74 
 
 		 574 aa  183  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  27.96 
 
 		 581 aa  182  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2125  lipid ABC transporter, ATP-binding/permease protein MsbA  25.91 
 
 		 602 aa  181  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153506  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2942  ABC transporter, transmembrane region  34.79 
 
 		 605 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.55 
 
 		 574 aa  180  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.55 
 
 		 574 aa  180  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  36.67 
 
 		 1218 aa  180  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  31.23 
 
 		 567 aa  179  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0028  ABC transporter related  28.21 
 
 		 615 aa  179  9e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  31.23 
 
 		 567 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  31.11 
 
 		 593 aa  179  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3043  ABC transporter related  33.26 
 
 		 598 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  29.42 
 
 		 666 aa  178  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  33.52 
 
 		 572 aa  178  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  29.14 
 
 		 576 aa  179  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  33.57 
 
 		 610 aa  178  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10350  cysteine export CydDC family ABC transporter permease subunit/ATP-binding protein CydC  37.92 
 
 		 1205 aa  177  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.247589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.33 
 
 		 1257 aa  177  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  35.05 
 
 		 620 aa  177  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.23 
 
 		 721 aa  177  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  27.11 
 
 		 590 aa  177  5e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4713  ABC transporter related  38.87 
 
 		 616 aa  177  6e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  31.69 
 
 		 597 aa  177  6e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.3 
 
 		 573 aa  177  7e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.09 
 
 		 583 aa  176  7e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.57 
 
 		 579 aa  177  7e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.09 
 
 		 614 aa  177  7e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.52 
 
 		 567 aa  176  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.79 
 
 		 622 aa  176  8e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1370  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  43.16 
 
 		 598 aa  176  8e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  29.07 
 
 		 588 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  32.61 
 
 		 565 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  27.99 
 
 		 587 aa  175  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25 
 
 		 596 aa  175  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0478  ABC transporter ATP-binding protein  34.25 
 
 		 592 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  25.81 
 
 		 587 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2631  ABC transporter related  34.85 
 
 		 608 aa  175  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478405  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  34.01 
 
 		 582 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  29.78 
 
 		 579 aa  176  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  36.17 
 
 		 578 aa  175  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  25.81 
 
 		 587 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1441  ABC transporter related protein  35.6 
 
 		 606 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.695725  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  25.6 
 
 		 580 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1472  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.17 
 
 		 628 aa  174  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868614  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  30.28 
 
 		 600 aa  174  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  33.73 
 
 		 592 aa  174  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  30.48 
 
 		 606 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.76 
 
 		 597 aa  174  5e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  44.8 
 
 		 580 aa  174  5e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2533  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  38.97 
 
 		 590 aa  174  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611222  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  25.39 
 
 		 582 aa  174  5.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1175  ABC transporter related  34.03 
 
 		 625 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  32.25 
 
 		 606 aa  174  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  29.17 
 
 		 655 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>