More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0791 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5293  ABC transporter related  78.62 
 
 
587 aa  806    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.159321 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2154  ABC transporter  99.83 
 
 
594 aa  1133    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.513956  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0676  ABC efflux pump, fused inner membrane and ATPase subunits  78.17 
 
 
594 aa  827    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.194816  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1824  ABC transporter ATP-binding protein  87.75 
 
 
590 aa  885    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.145117  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3373  ABC transporter related  78.52 
 
 
588 aa  804    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195497  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0881  putative ABC transporter, ATP-binding protein  99.83 
 
 
594 aa  1130    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4994  ABC transporter related  78.52 
 
 
588 aa  804    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00642068  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0791  putative ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
594 aa  1132    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09320  putative ATP-binding component of ABC transporter  59.53 
 
 
574 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.955623  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0844  ABC transporter component  54.4 
 
 
569 aa  488  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0878  ABC transporter ATP-binding protein  60.36 
 
 
574 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0730898  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4512  ABC transporter component  35.66 
 
 
575 aa  269  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  38.17 
 
 
596 aa  263  8.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  39.33 
 
 
581 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2824  ABC transporter related protein  36.7 
 
 
571 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866997  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4419  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36 
 
 
581 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1036  ABC transporter related protein  37.75 
 
 
579 aa  239  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188433  normal  0.0545959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4444  ABC transporter related  36.12 
 
 
577 aa  229  8e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  33.39 
 
 
577 aa  228  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4045  ABC transporter related  33.88 
 
 
582 aa  220  6e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1491  ABC transporter related  36.39 
 
 
584 aa  206  7e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2595  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  36 
 
 
601 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.398767  normal  0.0147502 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  35.23 
 
 
607 aa  206  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  36.64 
 
 
578 aa  204  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1441  ABC transporter related  31.77 
 
 
606 aa  204  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  30.55 
 
 
576 aa  198  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  31.27 
 
 
600 aa  196  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  30.34 
 
 
592 aa  193  9e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2339  ABC transporter component  32.18 
 
 
582 aa  190  7e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.667532  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.29 
 
 
581 aa  189  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  30.19 
 
 
595 aa  189  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  29.72 
 
 
619 aa  188  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  35.86 
 
 
596 aa  188  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11379  drug ABC transporter ATP-binding protein  32.01 
 
 
579 aa  188  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.73648 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  28.77 
 
 
588 aa  185  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11970  ABC transporter, transmembrane permease and ATP binding components  31.52 
 
 
599 aa  183  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  31.42 
 
 
588 aa  184  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  29.33 
 
 
581 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  30.07 
 
 
627 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  34.12 
 
 
622 aa  181  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3042  ABC transporter related  31.44 
 
 
611 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3018  ABC transporter related  36.13 
 
 
595 aa  181  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  33.26 
 
 
600 aa  181  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  38.7 
 
 
614 aa  179  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2125  lipid ABC transporter, ATP-binding/permease protein MsbA  25.49 
 
 
602 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153506  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0478  ABC transporter ATP-binding protein  33.86 
 
 
592 aa  178  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  35.04 
 
 
1228 aa  179  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1432  ABC transporter related protein  32.35 
 
 
661 aa  178  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.590543  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  29.7 
 
 
581 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  31.92 
 
 
598 aa  177  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  37.69 
 
 
620 aa  176  7e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  33.04 
 
 
567 aa  176  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  23.78 
 
 
587 aa  176  9e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  23.78 
 
 
587 aa  176  9e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.07 
 
 
583 aa  176  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  27.73 
 
 
590 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  32.82 
 
 
567 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  32.41 
 
 
579 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.02 
 
 
587 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.02 
 
 
618 aa  175  2.9999999999999996e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  38.44 
 
 
619 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1472  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.16 
 
 
628 aa  174  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868614  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  31.54 
 
 
606 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3822  ABC transporter transmembrane region  36.2 
 
 
605 aa  174  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568746  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.75 
 
 
614 aa  174  5e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.29 
 
 
574 aa  174  5.999999999999999e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  31.99 
 
 
580 aa  174  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3043  ABC transporter related  32.3 
 
 
598 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  26.72 
 
 
583 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2942  ABC transporter, transmembrane region  33.92 
 
 
605 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  31.18 
 
 
592 aa  173  7.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  34.5 
 
 
636 aa  173  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  26 
 
 
738 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0785  ABC transporter transmembrane region  35.42 
 
 
701 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244223  hitchhiker  0.00200741 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  28.35 
 
 
579 aa  172  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  32.96 
 
 
593 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  32.44 
 
 
565 aa  172  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0157  ABC transporter related  34.03 
 
 
616 aa  172  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.542583  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1370  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.74 
 
 
598 aa  172  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15083  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  26.55 
 
 
568 aa  171  3e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.97 
 
 
587 aa  171  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  31.35 
 
 
733 aa  171  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.78 
 
 
567 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.31 
 
 
608 aa  171  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  30.93 
 
 
576 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  33.33 
 
 
612 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  30.99 
 
 
606 aa  171  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  31.71 
 
 
610 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.28 
 
 
579 aa  171  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  29.4 
 
 
606 aa  171  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  29.44 
 
 
612 aa  171  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0189  ABC transporter related  29.54 
 
 
576 aa  171  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.087717  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  29.64 
 
 
587 aa  171  5e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  31.49 
 
 
610 aa  170  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  31.49 
 
 
610 aa  170  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.24 
 
 
574 aa  170  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2515  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  43.78 
 
 
587 aa  170  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.296095 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1331  ABC transporter related  29.89 
 
 
596 aa  170  8e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  35.46 
 
 
579 aa  170  8e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1909  ABC transporter related  29.73 
 
 
672 aa  170  8e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>