More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0878 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0878  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 574 aa  1062    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0730898  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09320  putative ATP-binding component of ABC transporter  93.38 
 
 		 574 aa  924    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.955623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0844  ABC transporter component  64.95 
 
 		 569 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1824  ABC transporter ATP-binding protein  62.25 
 
 		 590 aa  549  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.145117  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0676  ABC efflux pump, fused inner membrane and ATPase subunits  58.54 
 
 		 594 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.194816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3373  ABC transporter related  58.78 
 
 		 588 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195497  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4994  ABC transporter related  58.78 
 
 		 588 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00642068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5293  ABC transporter related  58.86 
 
 		 587 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.159321 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0791  putative ABC transporter, ATP-binding protein  60.5 
 
 		 594 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2154  ABC transporter  60.5 
 
 		 594 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.513956  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0881  putative ABC transporter, ATP-binding protein  60.5 
 
 		 594 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2824  ABC transporter related protein  38.3 
 
 		 571 aa  279  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  38.39 
 
 		 596 aa  272  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4512  ABC transporter component  36.07 
 
 		 575 aa  271  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1036  ABC transporter related protein  38.12 
 
 		 579 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188433  normal  0.0545959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  37.75 
 
 		 581 aa  244  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4419  ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.01 
 
 		 581 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4045  ABC transporter related  35.09 
 
 		 582 aa  236  7e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2595  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  37.21 
 
 		 601 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.398767  normal  0.0147502 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2339  ABC transporter component  34.72 
 
 		 582 aa  225  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.667532  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4444  ABC transporter related  34.38 
 
 		 577 aa  225  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  32.9 
 
 		 577 aa  223  9e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  36.63 
 
 		 578 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  31.23 
 
 		 600 aa  205  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  35.48 
 
 		 577 aa  202  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1441  ABC transporter related  32.18 
 
 		 606 aa  199  7.999999999999999e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3018  ABC transporter related  36.53 
 
 		 595 aa  199  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.6 
 
 		 573 aa  197  5.000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  32.89 
 
 		 590 aa  193  8e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  30.7 
 
 		 588 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  32.03 
 
 		 1138 aa  191  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  28.38 
 
 		 581 aa  191  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  34.62 
 
 		 639 aa  188  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11379  drug ABC transporter ATP-binding protein  32.34 
 
 		 579 aa  189  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73648 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1491  ABC transporter related  31.67 
 
 		 584 aa  189  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  27.32 
 
 		 581 aa  189  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  34.29 
 
 		 579 aa  187  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  31.18 
 
 		 619 aa  188  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  33.18 
 
 		 576 aa  187  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3043  ABC transporter related  38.37 
 
 		 598 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.38 
 
 		 579 aa  185  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  33.52 
 
 		 600 aa  185  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  28.72 
 
 		 571 aa  184  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.52 
 
 		 597 aa  184  3e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  34.24 
 
 		 582 aa  184  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  31.97 
 
 		 638 aa  184  5.0000000000000004e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  28.04 
 
 		 587 aa  184  6e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.29 
 
 		 581 aa  182  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  38.62 
 
 		 622 aa  182  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2225  ABC transporter related  32.48 
 
 		 612 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164174  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  33.48 
 
 		 588 aa  182  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  28.44 
 
 		 575 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.8 
 
 		 574 aa  181  2.9999999999999997e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  34.01 
 
 		 574 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0160  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.97 
 
 		 606 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  34.49 
 
 		 606 aa  181  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.53 
 
 		 577 aa  181  4e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.26 
 
 		 581 aa  181  4e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  33.48 
 
 		 579 aa  180  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  33.71 
 
 		 611 aa  180  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  36.55 
 
 		 640 aa  179  9e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  23.55 
 
 		 580 aa  179  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  32.05 
 
 		 610 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0316  ABC transporter related  34.14 
 
 		 607 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  32.05 
 
 		 610 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2216  ABC transporter related  35.14 
 
 		 651 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298218  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  32.74 
 
 		 598 aa  179  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  31.66 
 
 		 600 aa  179  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  32.05 
 
 		 610 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  36.62 
 
 		 603 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  31.39 
 
 		 578 aa  179  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1572  ABC transporter related protein  32.14 
 
 		 591 aa  179  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.722294  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  31.39 
 
 		 578 aa  179  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0659  ABC transporter, ATP-binding protein  36.18 
 
 		 594 aa  179  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000175742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0988  ABC transporter related  31.17 
 
 		 591 aa  178  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.026388 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  34.48 
 
 		 644 aa  178  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.97 
 
 		 585 aa  177  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.54 
 
 		 622 aa  177  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0157  ABC transporter related  31.8 
 
 		 616 aa  177  4e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.542583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  37.85 
 
 		 619 aa  177  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  42.55 
 
 		 593 aa  177  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.53 
 
 		 627 aa  177  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  31.48 
 
 		 606 aa  177  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2006  ABC transporter related  31.78 
 
 		 575 aa  177  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  32 
 
 		 468 aa  176  7e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  36.72 
 
 		 627 aa  176  9e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  38.24 
 
 		 620 aa  176  9e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.47 
 
 		 612 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  35.14 
 
 		 1228 aa  176  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  35.03 
 
 		 632 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  34.25 
 
 		 575 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  32.19 
 
 		 655 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2094  ABC transporter related  32.88 
 
 		 661 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181859  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  27.9 
 
 		 586 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  35.57 
 
 		 642 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3526  ABC transporter related  29.93 
 
 		 598 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  38.64 
 
 		 628 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1330  ABC transporter related  35.67 
 
 		 571 aa  175  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.987639  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2102  ABC transporter related  31.87 
 
 		 623 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2741  ABC transporter related  31.87 
 
 		 623 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18087  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>