More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5293 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0881  putative ABC transporter, ATP-binding protein  78.97 
 
 		 594 aa  775    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5293  ABC transporter related  100 
 
 		 587 aa  1128    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.159321 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2154  ABC transporter  78.62 
 
 		 594 aa  774    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.513956  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0676  ABC efflux pump, fused inner membrane and ATPase subunits  91.2 
 
 		 594 aa  1007    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.194816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1824  ABC transporter ATP-binding protein  80.67 
 
 		 590 aa  786    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.145117  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0791  putative ABC transporter, ATP-binding protein  78.79 
 
 		 594 aa  774    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3373  ABC transporter related  98.3 
 
 		 588 aa  1102    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195497  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4994  ABC transporter related  98.3 
 
 		 588 aa  1102    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00642068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09320  putative ATP-binding component of ABC transporter  58.93 
 
 		 574 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.955623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0844  ABC transporter component  54.98 
 
 		 569 aa  487  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0878  ABC transporter ATP-binding protein  58.88 
 
 		 574 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0730898  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4512  ABC transporter component  37.04 
 
 		 575 aa  278  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  37.5 
 
 		 596 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  40.7 
 
 		 581 aa  264  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2824  ABC transporter related protein  36.51 
 
 		 571 aa  258  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4419  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.96 
 
 		 581 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1036  ABC transporter related protein  38.43 
 
 		 579 aa  242  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188433  normal  0.0545959 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  35.16 
 
 		 577 aa  241  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4444  ABC transporter related  35.17 
 
 		 577 aa  231  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  35.85 
 
 		 578 aa  222  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4045  ABC transporter related  33.75 
 
 		 582 aa  222  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2595  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  35.8 
 
 		 601 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.398767  normal  0.0147502 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1491  ABC transporter related  36.32 
 
 		 584 aa  212  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  31.41 
 
 		 600 aa  204  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1441  ABC transporter related  32.42 
 
 		 606 aa  200  6e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2339  ABC transporter component  32.3 
 
 		 582 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.667532  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  34.51 
 
 		 1228 aa  195  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  34.24 
 
 		 607 aa  192  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  31.48 
 
 		 627 aa  192  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11379  drug ABC transporter ATP-binding protein  31.84 
 
 		 579 aa  192  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73648 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.93 
 
 		 581 aa  190  7e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1331  ABC transporter related  30.9 
 
 		 596 aa  189  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  31.97 
 
 		 592 aa  188  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  32.43 
 
 		 576 aa  188  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.57 
 
 		 572 aa  188  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  39.01 
 
 		 614 aa  189  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  35.75 
 
 		 596 aa  188  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  32.29 
 
 		 595 aa  187  5e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11970  ABC transporter, transmembrane permease and ATP binding components  30.54 
 
 		 599 aa  185  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3018  ABC transporter related  37.82 
 
 		 595 aa  183  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  32.52 
 
 		 574 aa  182  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3043  ABC transporter related  31.69 
 
 		 598 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.59 
 
 		 574 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  31.1 
 
 		 610 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  31.18 
 
 		 567 aa  181  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  31.18 
 
 		 567 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.37 
 
 		 574 aa  181  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  24.74 
 
 		 579 aa  181  4.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  27.94 
 
 		 581 aa  180  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  30.92 
 
 		 610 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  30.92 
 
 		 610 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2125  lipid ABC transporter, ATP-binding/permease protein MsbA  26.59 
 
 		 602 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153506  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  30.25 
 
 		 619 aa  178  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  36.02 
 
 		 1218 aa  179  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  32.5 
 
 		 597 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  32.33 
 
 		 565 aa  178  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2942  ABC transporter, transmembrane region  35.33 
 
 		 605 aa  177  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  29.76 
 
 		 593 aa  177  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.29 
 
 		 614 aa  177  4e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  35.05 
 
 		 620 aa  177  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  33.57 
 
 		 610 aa  177  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  31.13 
 
 		 592 aa  177  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  33.52 
 
 		 572 aa  177  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  24.75 
 
 		 587 aa  177  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  29.55 
 
 		 666 aa  177  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  24.75 
 
 		 587 aa  177  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10350  cysteine export CydDC family ABC transporter permease subunit/ATP-binding protein CydC  37.92 
 
 		 1205 aa  176  8e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.247589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0028  ABC transporter related  28.02 
 
 		 615 aa  176  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1370  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  43.16 
 
 		 598 aa  176  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  29.07 
 
 		 588 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  28.8 
 
 		 609 aa  176  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.68 
 
 		 573 aa  175  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.22 
 
 		 567 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  32.17 
 
 		 593 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  28.52 
 
 		 587 aa  175  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  26.88 
 
 		 590 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.51 
 
 		 583 aa  174  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  29 
 
 		 576 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  25.43 
 
 		 580 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2533  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  38.97 
 
 		 590 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611222  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.03 
 
 		 721 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.32 
 
 		 1257 aa  174  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2631  ABC transporter related  34.55 
 
 		 608 aa  174  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478405  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4713  ABC transporter related  38.56 
 
 		 616 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  33.21 
 
 		 578 aa  174  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  33.72 
 
 		 582 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.49 
 
 		 622 aa  174  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  29.92 
 
 		 580 aa  174  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  29.82 
 
 		 655 aa  174  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  29.33 
 
 		 579 aa  174  5e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.76 
 
 		 597 aa  174  5.999999999999999e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1472  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  27.92 
 
 		 628 aa  173  7.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868614  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.01 
 
 		 627 aa  173  9e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  25.24 
 
 		 582 aa  173  9e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  30.87 
 
 		 600 aa  173  9e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  32.08 
 
 		 608 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.67 
 
 		 596 aa  172  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.11 
 
 		 579 aa  172  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  37.33 
 
 		 1436 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  30.81 
 
 		 588 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>