More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_11970 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  60.38 
 
 		 587 aa  723    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2343  ABC transporter related  74.36 
 
 		 591 aa  890    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  0.0107518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11970  ABC transporter, transmembrane permease and ATP binding components  100 
 
 		 599 aa  1212    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0085  ABC transporter related  53.68 
 
 		 604 aa  542  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.81 
 
 		 621 aa  521  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  47.54 
 
 		 643 aa  519  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  47.89 
 
 		 623 aa  519  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3122  ABC transporter related  47.49 
 
 		 588 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  47.29 
 
 		 630 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  45.58 
 
 		 663 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3443  ABC transporter related  47.49 
 
 		 588 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3528  ABC transporter related  47.03 
 
 		 589 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  45.41 
 
 		 636 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3319  ABC transporter related  46.79 
 
 		 588 aa  512  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.338254 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2871  ABC transporter ATP binding protein  45.75 
 
 		 621 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2146  ABC transporter related  46.43 
 
 		 609 aa  508  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31543  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2441  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.75 
 
 		 621 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2840  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.75 
 
 		 621 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1764  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.75 
 
 		 621 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2813  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.75 
 
 		 621 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2753  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.75 
 
 		 621 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4271  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  45.41 
 
 		 637 aa  501  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0680  ABC transporter related  45.07 
 
 		 637 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1135  ABC transporter related  45.24 
 
 		 637 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1159  ABC transporter related  45.24 
 
 		 637 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7369  ABC transporter related  46.91 
 
 		 587 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0594477  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6620  ABC transporter related  47.27 
 
 		 587 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00971242  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0567  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  47.23 
 
 		 589 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0327  ABC transporter, transmembrane region  45.26 
 
 		 587 aa  491  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2782  putative fused ATP-binding/permease protein  43.82 
 
 		 587 aa  488  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.896144  normal  0.282624 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1142  ABC transporter related  45.94 
 
 		 585 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0417  ABC transporter related  44.82 
 
 		 587 aa  484  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4748  ABC transporter related  45.74 
 
 		 611 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4750  ABC transporter related  44.58 
 
 		 611 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0785549  normal  0.275934 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0505  ABC transporter related  45.02 
 
 		 599 aa  455  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.555752  normal  0.0162787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3210  ABC transporter related  44.01 
 
 		 587 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.461099  normal  0.871675 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1362  ABC transporter related  44.56 
 
 		 617 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2163  hypothetical protein  36.05 
 
 		 610 aa  383  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2190  hypothetical protein  36.22 
 
 		 610 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  34.47 
 
 		 603 aa  375  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  34.41 
 
 		 603 aa  375  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  37.19 
 
 		 633 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0462  ABC transporter related  39.12 
 
 		 621 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0083  ABC transporter related  36.64 
 
 		 619 aa  339  8e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0067  hypothetical protein  35.64 
 
 		 599 aa  339  9.999999999999999e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0860  ABC transporter related  35.77 
 
 		 621 aa  335  2e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000519067  hitchhiker  0.000174676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0665  ABC transporter related  38.84 
 
 		 646 aa  333  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.308501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0677  ABC transporter related  38.84 
 
 		 618 aa  333  4e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.0281361 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1585  hypothetical protein  35.24 
 
 		 593 aa  332  1e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0671  ABC-type multidrug efflux pump, ATP-binding component  35.8 
 
 		 607 aa  332  1e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123836  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0644  ABC transporter related  38.37 
 
 		 646 aa  329  8e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.601366 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0591  ABC transporter related  39.28 
 
 		 613 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0415751  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1260  hypothetical protein  34.62 
 
 		 582 aa  327  3e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.678722 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1408  hypothetical protein  34.86 
 
 		 594 aa  327  4.0000000000000003e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0553  ABC transporter related  39.06 
 
 		 598 aa  325  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1494  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.2 
 
 		 630 aa  324  3e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.283216  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0731  hypothetical protein  34.37 
 
 		 582 aa  324  4e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2893  ABC transporter related  40.44 
 
 		 614 aa  323  7e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2080  hypothetical protein  34.31 
 
 		 598 aa  322  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6225  ABC transporter related  39.39 
 
 		 624 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.57 
 
 		 595 aa  322  9.999999999999999e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  38.42 
 
 		 579 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1674  ABC transporter related  35.26 
 
 		 610 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3410  ABC transporter related  36.32 
 
 		 638 aa  320  6e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1622  ABC transporter related  36.63 
 
 		 621 aa  320  7e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327918  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2642  ABC transporter related  38.11 
 
 		 614 aa  319  9e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.988853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4542  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.46 
 
 		 610 aa  319  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1204  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  38.56 
 
 		 614 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494984  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2865  ABC transporter related  38.4 
 
 		 614 aa  319  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.148905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3046  ABC transporter related  36.14 
 
 		 618 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.752635 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1235  ABC transporter related  38.89 
 
 		 610 aa  318  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0197069  normal  0.341484 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1621  ABC transporter related  39.11 
 
 		 618 aa  318  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0907741  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3213  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.67 
 
 		 619 aa  317  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1348  ABC transporter related  35.63 
 
 		 610 aa  316  8e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416951  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2240  ABC transporter related  36.16 
 
 		 626 aa  316  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3071  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.35 
 
 		 619 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0688673  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0054  hypothetical protein  33.5 
 
 		 597 aa  315  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7080  ABC transporter related  39.04 
 
 		 621 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.161763  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.91 
 
 		 598 aa  315  9.999999999999999e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0126222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  36.81 
 
 		 571 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2782  ABC transporter related  35.06 
 
 		 618 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.292223 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2185  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.1 
 
 		 617 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2091  hypothetical protein  33 
 
 		 598 aa  313  4.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001027  ABC transporter ATP-binding protein  33.61 
 
 		 616 aa  313  5.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4091  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.94 
 
 		 610 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0803284  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1451  ABC transporter-related protein  37.4 
 
 		 609 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.296009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3836  ABC transporter related  34.96 
 
 		 610 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.643944 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07111  hypothetical protein  33.67 
 
 		 612 aa  312  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0957  hypothetical protein  32.72 
 
 		 593 aa  312  1e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04842  ABC transporter ATP-binding protein  39.19 
 
 		 610 aa  312  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2905  ABC transporter-related protein  37.93 
 
 		 609 aa  311  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564374  normal  0.291067 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1493  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.91 
 
 		 621 aa  312  1e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.246296  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1543  ABC transporter related  37.13 
 
 		 617 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.103422 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  34.13 
 
 		 655 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3491  ATPase  40.77 
 
 		 614 aa  311  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3208  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.82 
 
 		 625 aa  311  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333533  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2928  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  37.47 
 
 		 617 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1427  ABC transporter-like  37.84 
 
 		 610 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.582294  normal  0.104251 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1001  ABC transporter related protein  33.39 
 
 		 593 aa  311  2.9999999999999997e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2576  ABC transporter related  38.73 
 
 		 620 aa  310  5.9999999999999995e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.739746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>