More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3410 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3410  ABC transporter related  100 
 
 		 638 aa  1299    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  43.15 
 
 		 633 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2163  hypothetical protein  34.69 
 
 		 610 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  35.5 
 
 		 603 aa  362  1e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2190  hypothetical protein  37.35 
 
 		 610 aa  360  4e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  35 
 
 		 603 aa  358  1.9999999999999998e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0067  hypothetical protein  35.2 
 
 		 599 aa  356  5.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1408  hypothetical protein  34.97 
 
 		 594 aa  352  1e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0054  hypothetical protein  35.85 
 
 		 597 aa  350  4e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1585  hypothetical protein  35.14 
 
 		 593 aa  350  4e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7080  ABC transporter related  41.56 
 
 		 621 aa  348  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.161763  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3836  ABC transporter related  40.49 
 
 		 610 aa  343  8e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.643944 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4049  ABC transporter related  40.9 
 
 		 610 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04842  ABC transporter ATP-binding protein  41.5 
 
 		 610 aa  340  5e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3213  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.68 
 
 		 619 aa  340  5.9999999999999996e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0942  ABC transporter related  42.83 
 
 		 622 aa  337  2.9999999999999997e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6225  ABC transporter related  41.75 
 
 		 624 aa  335  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1348  ABC transporter related  39.88 
 
 		 610 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416951  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1898  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  41.95 
 
 		 610 aa  333  5e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0761429  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1427  ABC transporter-like  40.35 
 
 		 610 aa  333  6e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.582294  normal  0.104251 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0957  hypothetical protein  37.78 
 
 		 593 aa  333  6e-90  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1451  ABC transporter-related protein  40.36 
 
 		 609 aa  333  8e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.296009  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4542  ABC transporter permease/ATP-binding protein  39.88 
 
 		 610 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0462  ABC transporter related  38.54 
 
 		 621 aa  332  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482953  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4091  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.92 
 
 		 610 aa  331  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0803284  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0836  ABC transporter related  41.11 
 
 		 610 aa  331  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181434  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0907  ABC transporter related  40.91 
 
 		 610 aa  331  3e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.657123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  39.26 
 
 		 587 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0671  ABC-type multidrug efflux pump, ATP-binding component  34.73 
 
 		 607 aa  328  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123836  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07111  hypothetical protein  38.71 
 
 		 612 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1742  ABC transporter related  39.84 
 
 		 609 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.394506 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2579  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  35.84 
 
 		 611 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000689381  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22440  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  41.55 
 
 		 610 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000108745 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2892  ABC transporter related  41.86 
 
 		 612 aa  327  3e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2516  ABC transporter-related protein  37.7 
 
 		 610 aa  327  6e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001027  ABC transporter ATP-binding protein  38.18 
 
 		 616 aa  325  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2782  ABC transporter related  39 
 
 		 618 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.292223 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1260  hypothetical protein  35.32 
 
 		 582 aa  325  2e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.678722 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3046  ABC transporter related  38.37 
 
 		 618 aa  325  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.752635 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0113  ABC transporter related  40.04 
 
 		 619 aa  325  2e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  36.7 
 
 		 630 aa  324  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1493  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.64 
 
 		 621 aa  324  4e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.246296  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3827  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  39.51 
 
 		 610 aa  323  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284147  normal  0.0157718 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1204  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  40.29 
 
 		 614 aa  323  5e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494984  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1366  ABC transporter related  39.31 
 
 		 609 aa  323  7e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00434177  normal  0.0240824 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1431  ABC transporter related  39.31 
 
 		 609 aa  323  7e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0505297  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2865  ABC transporter related  40.29 
 
 		 614 aa  323  8e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.148905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1622  ABC transporter related  36.48 
 
 		 621 aa  323  8e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327918  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0677  ABC transporter related  42.07 
 
 		 618 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.0281361 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2782  putative fused ATP-binding/permease protein  34.29 
 
 		 587 aa  322  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.896144  normal  0.282624 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001285  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  37.68 
 
 		 603 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000363731  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0665  ABC transporter related  42.07 
 
 		 646 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.308501 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1494  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40 
 
 		 630 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.283216  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1419  ABC transporter related  39.11 
 
 		 609 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00302849  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0644  ABC transporter related  41.3 
 
 		 646 aa  320  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.601366 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1235  ABC transporter related  39.81 
 
 		 610 aa  320  5e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0197069  normal  0.341484 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2206  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  38.24 
 
 		 612 aa  320  5e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0083  ABC transporter related  39.36 
 
 		 619 aa  320  6e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1666  ABC transporter related  35.67 
 
 		 613 aa  320  7e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.66549  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2905  ABC transporter-related protein  39.18 
 
 		 609 aa  320  7e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564374  normal  0.291067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11970  ABC transporter, transmembrane permease and ATP binding components  36.32 
 
 		 599 aa  320  7e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0242  ABC transporter, ATP-binding protein  37.95 
 
 		 706 aa  319  7.999999999999999e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0591  ABC transporter related  34.94 
 
 		 613 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0415751  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3128  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  38.91 
 
 		 609 aa  318  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1674  ABC transporter related  38.31 
 
 		 610 aa  318  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5775  ABC transporter related  40.5 
 
 		 617 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.832359  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3490  ATPase  39.68 
 
 		 614 aa  318  2e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6140  ABC transporter related  40.5 
 
 		 617 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2532  ABC transporter related  38.45 
 
 		 609 aa  317  3e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00690658  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2173  ABC transporter related  38.53 
 
 		 616 aa  318  3e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2343  ABC transporter related  35.19 
 
 		 591 aa  317  4e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  0.0107518 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  36.81 
 
 		 663 aa  317  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7674  ABC efflux pump, ATPase subunit  40.07 
 
 		 617 aa  317  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22456  normal  0.131905 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1621  ABC transporter related  39.88 
 
 		 618 aa  317  6e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0907741  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2641  ABC transporter related  38.68 
 
 		 614 aa  316  8e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.580365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2185  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.55 
 
 		 617 aa  316  8e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6620  ABC transporter related  39.59 
 
 		 617 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.349027  normal  0.153247 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1768  ABC transporter related  38.2 
 
 		 622 aa  316  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2821  ABC transporter related  39.2 
 
 		 609 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  36.63 
 
 		 636 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2089  ABC transporter related  35.67 
 
 		 613 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.240835  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0860  ABC transporter related  37.84 
 
 		 621 aa  315  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000519067  hitchhiker  0.000174676 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2928  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  37.72 
 
 		 617 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0085  ABC transporter related  40.08 
 
 		 604 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4271  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  36.72 
 
 		 637 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3071  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.65 
 
 		 619 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0688673  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  35.15 
 
 		 643 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0691  ABC transporter ATP-binding protein  36.4 
 
 		 609 aa  313  5.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1159  ABC transporter related  37.15 
 
 		 637 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00688  multidrug resistance ABC transporter ATP-binding and permease protein  38.29 
 
 		 613 aa  313  6.999999999999999e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0450616  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1135  ABC transporter related  37.15 
 
 		 637 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2864  ABC transporter related  39.16 
 
 		 614 aa  313  7.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.146581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1142  ABC transporter related  34.49 
 
 		 585 aa  312  9e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2135  ABC transporter-related protein  38.7 
 
 		 630 aa  312  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180328 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2811  ABC transporter related  37.92 
 
 		 595 aa  311  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.882155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3210  ABC transporter related  39.59 
 
 		 587 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.461099  normal  0.871675 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2498  ABC transporter related  39.2 
 
 		 609 aa  311  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.896627  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1203  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  38.39 
 
 		 614 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0276633  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0680  ABC transporter related  36.98 
 
 		 637 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0526  TonB-dependent receptor  38.35 
 
 		 608 aa  310  4e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>