More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0054 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006365  plpp0054  hypothetical protein  100 
 
 
597 aa  1222    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0616  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  41.46 
 
 
591 aa  425  1e-118  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.146496  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2091  hypothetical protein  38.45 
 
 
598 aa  423  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2080  hypothetical protein  38.45 
 
 
598 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2163  hypothetical protein  39.59 
 
 
610 aa  416  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1260  hypothetical protein  40.51 
 
 
582 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.678722 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2190  hypothetical protein  39.76 
 
 
610 aa  414  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  38.93 
 
 
603 aa  407  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  38.47 
 
 
603 aa  406  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1408  hypothetical protein  39.63 
 
 
594 aa  407  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0067  hypothetical protein  39.63 
 
 
599 aa  405  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0957  hypothetical protein  39.39 
 
 
593 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1585  hypothetical protein  39.63 
 
 
593 aa  401  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  38.32 
 
 
633 aa  398  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0674  hypothetical protein  37.85 
 
 
581 aa  369  1e-100  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0731  hypothetical protein  36.05 
 
 
582 aa  357  3.9999999999999996e-97  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3410  ABC transporter related  35.85 
 
 
638 aa  350  4e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2782  putative fused ATP-binding/permease protein  34.68 
 
 
587 aa  346  8.999999999999999e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.896144  normal  0.282624 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0327  ABC transporter, transmembrane region  34.21 
 
 
587 aa  342  9e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  34.35 
 
 
587 aa  336  9e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2343  ABC transporter related  34.84 
 
 
591 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  0.0107518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0417  ABC transporter related  34.32 
 
 
587 aa  330  6e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.11 
 
 
595 aa  329  7e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7369  ABC transporter related  35.99 
 
 
587 aa  327  5e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0594477  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6620  ABC transporter related  35.53 
 
 
587 aa  327  5e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00971242  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4941  ABC transporter related  35.21 
 
 
604 aa  325  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.690923  normal  0.361162 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1740  ABC transporter related  36.92 
 
 
609 aa  325  2e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0539083  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3528  ABC transporter related  34.78 
 
 
589 aa  324  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0276  ABC transporter related  37.57 
 
 
601 aa  323  4e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0712  ABC transporter related  33.01 
 
 
596 aa  323  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0247864  normal  0.335635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4091  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.8 
 
 
610 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0803284  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1142  ABC transporter related  33.22 
 
 
585 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0356  ABC transporter related  34.38 
 
 
596 aa  321  3e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0198  ABC transporter  36.95 
 
 
572 aa  321  3e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3319  ABC transporter related  34.78 
 
 
588 aa  320  7e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.338254 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0083  ABC transporter related  37.28 
 
 
619 aa  320  7e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6225  ABC transporter related  39.47 
 
 
624 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00688  multidrug resistance ABC transporter ATP-binding and permease protein  38.51 
 
 
613 aa  318  1e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0450616  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0591  ABC transporter related  38.05 
 
 
613 aa  317  5e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0415751  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7080  ABC transporter related  38.59 
 
 
621 aa  316  6e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.161763  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1431  ABC transporter related  35.33 
 
 
609 aa  316  6e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0505297  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1248  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  35.49 
 
 
625 aa  316  9e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2928  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  35.67 
 
 
617 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398164  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11970  ABC transporter, transmembrane permease and ATP binding components  33.5 
 
 
599 aa  315  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5523  ABC transporter related  38.07 
 
 
620 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0836  ABC transporter related  35.04 
 
 
610 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181434  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4939  ABC transporter related  37.65 
 
 
626 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.777528 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0942  ABC transporter related  34.18 
 
 
622 aa  315  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3687  ABC transporter related  38.07 
 
 
620 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2875  ABC transporter related  33.61 
 
 
625 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216771  normal  0.111784 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1768  ABC transporter related  37.92 
 
 
622 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3827  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  33.76 
 
 
610 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284147  normal  0.0157718 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2299  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  37.65 
 
 
620 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0671  ABC-type multidrug efflux pump, ATP-binding component  33.33 
 
 
607 aa  312  9e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123836  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2811  ABC transporter related  38.61 
 
 
595 aa  312  9e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.882155 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3443  ABC transporter related  34.43 
 
 
588 aa  312  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3122  ABC transporter related  34.43 
 
 
588 aa  312  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1463  ABC transporter related  35.24 
 
 
597 aa  312  1e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0462  ABC transporter related  35.2 
 
 
621 aa  312  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482953  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7111  ABC transporter related  32.73 
 
 
596 aa  312  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483113  normal  0.228237 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.31 
 
 
598 aa  312  1e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0126222  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0907  ABC transporter related  35.89 
 
 
610 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.657123  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4049  ABC transporter related  33.93 
 
 
610 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2821  ABC transporter related  34.5 
 
 
609 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3044  ABC transporter related  35.45 
 
 
637 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.989361  normal  0.444628 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3210  ABC transporter related  33.88 
 
 
587 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.461099  normal  0.871675 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1542  ABC transporter related  34.76 
 
 
621 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264596  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2516  ABC transporter-related protein  34.31 
 
 
610 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584837  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1622  ABC transporter related  34.05 
 
 
621 aa  311  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327918  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001027  ABC transporter ATP-binding protein  36.82 
 
 
616 aa  311  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  32.61 
 
 
663 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3404  ABC transporter related  34.43 
 
 
600 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00337035  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1366  ABC transporter related  35.33 
 
 
609 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00434177  normal  0.0240824 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1348  ABC transporter related  33.94 
 
 
610 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416951  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2782  ABC transporter related  34.77 
 
 
618 aa  310  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.292223 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  32.88 
 
 
623 aa  310  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3046  ABC transporter related  34.77 
 
 
618 aa  310  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.752635 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  32.44 
 
 
636 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  31.97 
 
 
643 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3213  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.55 
 
 
619 aa  309  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4542  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.94 
 
 
610 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3797  ABC transporter related  37.65 
 
 
620 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  normal  0.145878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2245  ABC transporter, transmembrane region  34.43 
 
 
619 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20584  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3727  ABC transporter related  37.65 
 
 
620 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal  0.56235 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7674  ABC efflux pump, ATPase subunit  35.56 
 
 
617 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22456  normal  0.131905 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.71 
 
 
621 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07111  hypothetical protein  36.22 
 
 
612 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4845  ABC transporter related  36.35 
 
 
599 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4566  ABC transporter related  37.65 
 
 
620 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2174  ABC transporter related  38.15 
 
 
627 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0242  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 
706 aa  307  3e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2930  ABC transporter related  37.97 
 
 
581 aa  307  3e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1307  ABC transporter related  33.83 
 
 
611 aa  307  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.556896 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1419  ABC transporter related  35.25 
 
 
609 aa  308  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00302849  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2185  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.85 
 
 
617 aa  307  3e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3491  ATPase  34.33 
 
 
614 aa  307  3e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0677  ABC transporter related  38.96 
 
 
618 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.0281361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0665  ABC transporter related  38.96 
 
 
646 aa  306  7e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.308501 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2941  ABC transporter related  34.27 
 
 
609 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.417973  normal  0.0292535 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1543  ABC transporter related  35.63 
 
 
617 aa  306  9.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.103422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>