More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0085 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0085  ABC transporter related  100 
 
 		 604 aa  1181    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  52.36 
 
 		 587 aa  592  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11970  ABC transporter, transmembrane permease and ATP binding components  53.68 
 
 		 599 aa  589  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2343  ABC transporter related  53.94 
 
 		 591 aa  590  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  0.0107518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0417  ABC transporter related  46.41 
 
 		 587 aa  478  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2782  putative fused ATP-binding/permease protein  45.65 
 
 		 587 aa  475  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.896144  normal  0.282624 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  45.86 
 
 		 630 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  44.31 
 
 		 663 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  44.9 
 
 		 621 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  44.56 
 
 		 643 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  44.2 
 
 		 623 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  44.31 
 
 		 636 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7369  ABC transporter related  44.46 
 
 		 587 aa  451  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0594477  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6620  ABC transporter related  44.46 
 
 		 587 aa  451  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00971242  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0327  ABC transporter, transmembrane region  47.03 
 
 		 587 aa  450  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3528  ABC transporter related  42.76 
 
 		 589 aa  450  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1142  ABC transporter related  45.74 
 
 		 585 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0567  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.88 
 
 		 589 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2840  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  44.72 
 
 		 621 aa  445  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2871  ABC transporter ATP binding protein  44.72 
 
 		 621 aa  445  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4271  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  45.02 
 
 		 637 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2753  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  44.72 
 
 		 621 aa  445  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3122  ABC transporter related  42.33 
 
 		 588 aa  443  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2441  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  44.72 
 
 		 621 aa  445  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2813  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  44.72 
 
 		 621 aa  445  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1764  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  44.72 
 
 		 621 aa  445  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3443  ABC transporter related  42.33 
 
 		 588 aa  443  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1135  ABC transporter related  44.66 
 
 		 637 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1159  ABC transporter related  44.66 
 
 		 637 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3319  ABC transporter related  42.43 
 
 		 588 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.338254 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0680  ABC transporter related  44.48 
 
 		 637 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2146  ABC transporter related  44.48 
 
 		 609 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31543  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4750  ABC transporter related  45.32 
 
 		 611 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0785549  normal  0.275934 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3210  ABC transporter related  45.37 
 
 		 587 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.461099  normal  0.871675 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4748  ABC transporter related  44.15 
 
 		 611 aa  429  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0505  ABC transporter related  41.8 
 
 		 599 aa  417  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.555752  normal  0.0162787 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1362  ABC transporter related  43.72 
 
 		 617 aa  411  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  32.99 
 
 		 603 aa  353  7e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  32.99 
 
 		 603 aa  351  2e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3071  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.36 
 
 		 619 aa  347  5e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0688673  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2163  hypothetical protein  32.42 
 
 		 610 aa  345  2e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2190  hypothetical protein  32.59 
 
 		 610 aa  343  5.999999999999999e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2928  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  40.41 
 
 		 617 aa  340  4e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  34.19 
 
 		 633 aa  337  5.999999999999999e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2080  hypothetical protein  33.67 
 
 		 598 aa  333  4e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0067  hypothetical protein  35.53 
 
 		 599 aa  333  5e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2245  ABC transporter, transmembrane region  40.16 
 
 		 619 aa  332  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20584  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1585  hypothetical protein  35.36 
 
 		 593 aa  331  2e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2131  ABC transporter related  40.16 
 
 		 617 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3410  ABC transporter related  40.33 
 
 		 638 aa  330  4e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2628  ABC transporter ATP-binding protein  39.96 
 
 		 658 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2892  ABC transporter related  38.18 
 
 		 612 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2091  hypothetical protein  33 
 
 		 598 aa  328  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1408  hypothetical protein  35.03 
 
 		 594 aa  328  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0671  ABC-type multidrug efflux pump, ATP-binding component  36.93 
 
 		 607 aa  328  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123836  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3203  ABC transporter related  39.96 
 
 		 617 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0677  ABC transporter related  40.58 
 
 		 618 aa  323  6e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.0281361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0665  ABC transporter related  40.58 
 
 		 646 aa  323  7e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.308501 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0276  ABC transporter related  38.83 
 
 		 601 aa  323  8e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3490  ATPase  41.2 
 
 		 614 aa  322  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1451  ABC transporter-related protein  38.16 
 
 		 609 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.296009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2169  ABC transporter related  39.71 
 
 		 617 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2579  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  37.33 
 
 		 611 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000689381  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001027  ABC transporter ATP-binding protein  36.49 
 
 		 616 aa  321  3e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2865  ABC transporter related  38.79 
 
 		 614 aa  321  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.148905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1204  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  39.01 
 
 		 614 aa  320  5e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494984  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2642  ABC transporter related  38.88 
 
 		 614 aa  319  7e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.988853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1588  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.13 
 
 		 612 aa  319  7e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4542  ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.62 
 
 		 610 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0198  ABC transporter  38.36 
 
 		 572 aa  319  9e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07111  hypothetical protein  37.11 
 
 		 612 aa  319  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3836  ABC transporter related  35.59 
 
 		 610 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.643944 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1348  ABC transporter related  37.62 
 
 		 610 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416951  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0591  ABC transporter related  38.14 
 
 		 613 aa  318  2e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0415751  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1366  ABC transporter related  38.02 
 
 		 609 aa  318  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00434177  normal  0.0240824 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1431  ABC transporter related  38.02 
 
 		 609 aa  318  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0505297  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0644  ABC transporter related  40.17 
 
 		 646 aa  317  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.601366 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2893  ABC transporter related  40.37 
 
 		 614 aa  317  4e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4049  ABC transporter related  37.62 
 
 		 610 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1621  ABC transporter related  40.66 
 
 		 618 aa  317  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0907741  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1419  ABC transporter related  37.81 
 
 		 609 aa  316  6e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00302849  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1494  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.92 
 
 		 630 aa  315  9.999999999999999e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.283216  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1768  ABC transporter related  36.94 
 
 		 622 aa  316  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3128  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  37.81 
 
 		 609 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0242  ABC transporter, ATP-binding protein  37.35 
 
 		 706 aa  315  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1457  ABC transporter related  39.14 
 
 		 609 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.162011  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2811  ABC transporter related  39.55 
 
 		 595 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.882155 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1441  ABC transporter related  39.76 
 
 		 618 aa  315  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73054 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2821  ABC transporter related  36.98 
 
 		 609 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2905  ABC transporter-related protein  38.87 
 
 		 609 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564374  normal  0.291067 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2498  ABC transporter related  37.19 
 
 		 609 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.896627  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2721  ABC transporter related  40.24 
 
 		 615 aa  313  6.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0478  ABC transporter ATP-binding protein  36.16 
 
 		 592 aa  313  7.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1742  ABC transporter related  37.6 
 
 		 609 aa  312  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.394506 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6225  ABC transporter related  40.91 
 
 		 624 aa  312  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1273  ABC-type transport system ATPase  37.69 
 
 		 622 aa  311  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.788537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3208  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.83 
 
 		 625 aa  310  4e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333533  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2185  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.43 
 
 		 617 aa  310  4e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2532  ABC transporter related  38.46 
 
 		 609 aa  310  5e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00690658  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2206  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  37.76 
 
 		 612 aa  310  5e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>