More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1756 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3443  ABC transporter related  58.41 
 
 
588 aa  683    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3528  ABC transporter related  58.35 
 
 
589 aa  696    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1764  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  97.48 
 
 
621 aa  1123    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0567  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  97.52 
 
 
589 aa  1058    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0505  ABC transporter related  55.96 
 
 
599 aa  655    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.555752  normal  0.0162787 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2146  ABC transporter related  89.75 
 
 
609 aa  1050    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31543  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0327  ABC transporter, transmembrane region  58.89 
 
 
587 aa  682    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2871  ABC transporter ATP binding protein  97.48 
 
 
621 aa  1123    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  87.44 
 
 
663 aa  1074    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  85.69 
 
 
643 aa  1025    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6620  ABC transporter related  61.11 
 
 
587 aa  704    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00971242  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4271  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  89.65 
 
 
637 aa  1054    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611516  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4750  ABC transporter related  62.44 
 
 
611 aa  692    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0785549  normal  0.275934 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2840  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  97.48 
 
 
621 aa  1123    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  100 
 
 
621 aa  1251    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2813  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  97.48 
 
 
621 aa  1123    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3210  ABC transporter related  59.07 
 
 
587 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.461099  normal  0.871675 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  86.39 
 
 
630 aa  1035    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  85.19 
 
 
623 aa  1025    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7369  ABC transporter related  61.11 
 
 
587 aa  707    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0594477  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3319  ABC transporter related  58.58 
 
 
588 aa  687    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.338254 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1142  ABC transporter related  57.93 
 
 
585 aa  661    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1135  ABC transporter related  89.29 
 
 
637 aa  1057    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0417  ABC transporter related  59.59 
 
 
587 aa  711    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3122  ABC transporter related  58.41 
 
 
588 aa  683    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2441  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  97.48 
 
 
621 aa  1123    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0680  ABC transporter related  89.13 
 
 
637 aa  1054    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2753  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  97.48 
 
 
621 aa  1123    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2782  putative fused ATP-binding/permease protein  58.97 
 
 
587 aa  713    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.896144  normal  0.282624 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4748  ABC transporter related  60.07 
 
 
611 aa  711    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  87.28 
 
 
636 aa  1072    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1159  ABC transporter related  89.29 
 
 
637 aa  1057    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1362  ABC transporter related  55.48 
 
 
617 aa  610  1e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2343  ABC transporter related  45.53 
 
 
591 aa  547  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  0.0107518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11970  ABC transporter, transmembrane permease and ATP binding components  45.81 
 
 
599 aa  537  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  44.25 
 
 
587 aa  510  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0085  ABC transporter related  44.9 
 
 
604 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  34.9 
 
 
603 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  34.75 
 
 
603 aa  375  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  35.11 
 
 
633 aa  364  3e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2163  hypothetical protein  34.13 
 
 
610 aa  355  1e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2190  hypothetical protein  33.96 
 
 
610 aa  350  7e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1585  hypothetical protein  35.32 
 
 
593 aa  347  3e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1408  hypothetical protein  35.34 
 
 
594 aa  345  1e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3404  ABC transporter related  38.66 
 
 
600 aa  345  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00337035  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6143  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.44 
 
 
603 aa  342  8e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.84 
 
 
595 aa  341  2e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4845  ABC transporter related  39.2 
 
 
599 aa  336  7e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0067  hypothetical protein  34.45 
 
 
599 aa  335  2e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0276  ABC transporter related  38.46 
 
 
601 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2811  ABC transporter related  35.79 
 
 
595 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.882155 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7111  ABC transporter related  36.96 
 
 
596 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483113  normal  0.228237 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4939  ABC transporter related  37 
 
 
626 aa  325  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.777528 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.03 
 
 
598 aa  323  5e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0126222  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0712  ABC transporter related  35.75 
 
 
596 aa  323  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0247864  normal  0.335635 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2080  hypothetical protein  35.48 
 
 
598 aa  322  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2928  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  38.14 
 
 
617 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398164  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0083  ABC transporter related  38.9 
 
 
619 aa  321  1.9999999999999998e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2182  ABC transporter related  35.47 
 
 
600 aa  320  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3687  ABC transporter related  36.71 
 
 
620 aa  320  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5523  ABC transporter related  36.71 
 
 
620 aa  320  6e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2245  ABC transporter, transmembrane region  38.12 
 
 
619 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20584  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0515  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  36.64 
 
 
663 aa  318  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2185  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.93 
 
 
617 aa  317  3e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2524  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.88 
 
 
669 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265455  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1441  ABC transporter related  37.19 
 
 
618 aa  317  3e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.73054 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0198  ABC transporter  36.9 
 
 
572 aa  317  4e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3418  ABC transporter related  37.33 
 
 
595 aa  317  5e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  normal  0.0149825 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3727  ABC transporter related  35.85 
 
 
620 aa  317  6e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal  0.56235 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2665  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  36.88 
 
 
669 aa  316  6e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0953  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  36.88 
 
 
669 aa  316  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3797  ABC transporter related  35.85 
 
 
620 aa  317  6e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  normal  0.145878 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4566  ABC transporter related  35.85 
 
 
620 aa  317  6e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2299  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  36.36 
 
 
620 aa  316  7e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3233  ABC transporter related  39.09 
 
 
599 aa  316  7e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494492  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3039  ABC transporter related  37.37 
 
 
595 aa  316  7e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2091  hypothetical protein  36.46 
 
 
598 aa  316  8e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0270  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.71 
 
 
669 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0233  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  36.71 
 
 
669 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1416  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.71 
 
 
669 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1612  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  36.71 
 
 
669 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.658136  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3491  ATPase  39.12 
 
 
614 aa  315  9.999999999999999e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1463  ABC transporter related  35.7 
 
 
597 aa  314  2.9999999999999996e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0591  ABC transporter related  35.69 
 
 
593 aa  314  2.9999999999999996e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179629 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3410  ABC transporter related  36.44 
 
 
638 aa  314  2.9999999999999996e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0860  ABC transporter related  36.73 
 
 
621 aa  313  4.999999999999999e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000519067  hitchhiker  0.000174676 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3071  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.45 
 
 
619 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0688673  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2930  ABC transporter related  38.01 
 
 
581 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5775  ABC transporter related  37.96 
 
 
617 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.832359  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6140  ABC transporter related  37.96 
 
 
617 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2780  ABC transporter related  35.08 
 
 
637 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0054  hypothetical protein  32.71 
 
 
597 aa  313  6.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2848  ABC transporter-related protein  37.13 
 
 
611 aa  313  6.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.934041  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0731  hypothetical protein  31.99 
 
 
582 aa  313  7.999999999999999e-84  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7080  ABC transporter related  37.31 
 
 
621 aa  313  9e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.161763  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2169  ABC transporter related  35.85 
 
 
617 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6620  ABC transporter related  37.26 
 
 
617 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.349027  normal  0.153247 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0836  ABC transporter related  35.89 
 
 
610 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181434  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2875  ABC transporter related  36.58 
 
 
625 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216771  normal  0.111784 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6225  ABC transporter related  36.92 
 
 
624 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>