More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0591 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0591  ABC transporter related  100 
 
 
593 aa  1198    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179629 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0356  ABC transporter related  54.45 
 
 
596 aa  620  1e-176  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3404  ABC transporter related  49.12 
 
 
600 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00337035  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2811  ABC transporter related  49.74 
 
 
595 aa  528  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.882155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0712  ABC transporter related  46.13 
 
 
596 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0247864  normal  0.335635 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0276  ABC transporter related  46.18 
 
 
601 aa  521  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3418  ABC transporter related  48.97 
 
 
595 aa  520  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  normal  0.0149825 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2182  ABC transporter related  47.71 
 
 
600 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4845  ABC transporter related  48.62 
 
 
599 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2930  ABC transporter related  50.44 
 
 
581 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6143  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.17 
 
 
603 aa  512  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3039  ABC transporter related  49.74 
 
 
595 aa  514  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7111  ABC transporter related  45.77 
 
 
596 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483113  normal  0.228237 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3233  ABC transporter related  48.31 
 
 
599 aa  511  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494492  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0553  ABC transporter related  46.91 
 
 
598 aa  510  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6186  multidrug ABC transporter ATPase/permease  48.16 
 
 
605 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159052  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3727  ABC transporter related  45.98 
 
 
620 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal  0.56235 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4941  ABC transporter related  45 
 
 
604 aa  499  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.690923  normal  0.361162 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4939  ABC transporter related  46.41 
 
 
626 aa  499  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.777528 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4566  ABC transporter related  45.98 
 
 
620 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3797  ABC transporter related  45.98 
 
 
620 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  normal  0.145878 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5523  ABC transporter related  44.93 
 
 
620 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2299  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  45.8 
 
 
620 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3687  ABC transporter related  44.76 
 
 
620 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0198  ABC transporter  49.3 
 
 
572 aa  489  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2875  ABC transporter related  44.68 
 
 
625 aa  485  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216771  normal  0.111784 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0515  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  46.35 
 
 
663 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1248  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  45.2 
 
 
625 aa  484  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1637  ABC transporter related  45.87 
 
 
630 aa  481  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135005  normal  0.475393 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2665  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  46.53 
 
 
669 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0953  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  46.53 
 
 
669 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2524  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  46.35 
 
 
669 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265455  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0233  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  46.18 
 
 
669 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0270  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  46.18 
 
 
669 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1416  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  46.18 
 
 
669 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1612  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  46.18 
 
 
669 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.658136  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5449  ABC transporter related  46.17 
 
 
622 aa  464  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89957  normal  0.0448259 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4093  ABC transporter related  45.96 
 
 
585 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5858  ABC transporter related  38.79 
 
 
591 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2203  ABC transporter related  37.21 
 
 
567 aa  351  3e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  36.25 
 
 
630 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.82 
 
 
621 aa  321  3e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  35.13 
 
 
663 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  36.01 
 
 
623 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  35.13 
 
 
636 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11970  ABC transporter, transmembrane permease and ATP binding components  37.19 
 
 
599 aa  317  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1273  ABC-type transport system ATPase  36.59 
 
 
622 aa  316  7e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.788537  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  37.46 
 
 
612 aa  316  7e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  35.84 
 
 
643 aa  316  7e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1764  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.99 
 
 
621 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2813  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.99 
 
 
621 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2871  ABC transporter ATP binding protein  35.99 
 
 
621 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2441  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.99 
 
 
621 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2840  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.99 
 
 
621 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1135  ABC transporter related  35.19 
 
 
637 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  37.29 
 
 
612 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2753  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.99 
 
 
621 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1159  ABC transporter related  35.35 
 
 
637 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2146  ABC transporter related  35.91 
 
 
609 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31543  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4271  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  35.29 
 
 
637 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611516  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  36.77 
 
 
606 aa  313  3.9999999999999997e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.72 
 
 
595 aa  313  4.999999999999999e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0680  ABC transporter related  35.19 
 
 
637 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0567  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.09 
 
 
589 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  38.21 
 
 
768 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1868  ABC transporter related  38.13 
 
 
610 aa  309  8e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0975  ABC transporter related  38.53 
 
 
626 aa  309  9e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0555  ABC transporter related  36.33 
 
 
628 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  33.98 
 
 
633 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  35.48 
 
 
597 aa  308  3e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  38.81 
 
 
655 aa  307  3e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3122  ABC transporter related  36.73 
 
 
588 aa  307  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3443  ABC transporter related  36.73 
 
 
588 aa  307  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6441  response regulator receiver protein  37.13 
 
 
933 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603753  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1388  response regulator receiver protein  37.13 
 
 
921 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251284  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2343  ABC transporter related  35.46 
 
 
591 aa  306  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  0.0107518 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6032  response regulator receiver protein  37.13 
 
 
933 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.340327  normal  0.371985 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0994  ABC transporter related  36.14 
 
 
652 aa  306  9.000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  34.52 
 
 
629 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  35.56 
 
 
587 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5655  response regulator receiver protein  37.69 
 
 
935 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2741  ABC transporter related  35.73 
 
 
623 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18087  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5208  ABC transporter related  38.93 
 
 
663 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.670373  normal  0.309398 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2102  ABC transporter related  35.5 
 
 
623 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2714  ABC transporter related  35.5 
 
 
623 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1050  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.86 
 
 
609 aa  303  6.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.718087  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  36.41 
 
 
655 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1765  putative multidrug export ATP-binding/permease protein  36.86 
 
 
611 aa  303  7.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.193785  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.86 
 
 
591 aa  303  7.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  38.48 
 
 
601 aa  302  9e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1472  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.52 
 
 
628 aa  302  9e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868614  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3319  ABC transporter related  36.58 
 
 
588 aa  302  9e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.338254 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1463  ABC transporter related  35.15 
 
 
597 aa  302  1e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4741  ABC transporter related  38.73 
 
 
662 aa  302  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.616952  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001027  ABC transporter ATP-binding protein  34.36 
 
 
616 aa  302  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0449  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.12 
 
 
625 aa  302  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6403  response regulator receiver protein  37.52 
 
 
936 aa  302  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.452757  normal  0.164839 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0391  ABC transporter-related protein  33.86 
 
 
630 aa  302  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00324467 
 
 
-
 
NC_004310  BR0442  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.93 
 
 
628 aa  301  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745625  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  37.07 
 
 
764 aa  301  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>