More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6143 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0276  ABC transporter related  70.05 
 
 		 601 aa  835    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2524  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  67.68 
 
 		 669 aa  755    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265455  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5449  ABC transporter related  66.61 
 
 		 622 aa  737    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89957  normal  0.0448259 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1416  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  67.51 
 
 		 669 aa  753    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1612  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  67.51 
 
 		 669 aa  753    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.658136  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4941  ABC transporter related  74.3 
 
 		 604 aa  896    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.690923  normal  0.361162 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0233  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  67.51 
 
 		 669 aa  753    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4939  ABC transporter related  68.16 
 
 		 626 aa  781    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.777528 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0198  ABC transporter  65.14 
 
 		 572 aa  767    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0953  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  67.85 
 
 		 669 aa  758    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3687  ABC transporter related  67.8 
 
 		 620 aa  794    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6143  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 		 603 aa  1216    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2299  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  67.68 
 
 		 620 aa  798    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0515  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  67.34 
 
 		 663 aa  758    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6186  multidrug ABC transporter ATPase/permease  60.71 
 
 		 605 aa  722    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159052  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3039  ABC transporter related  59.49 
 
 		 595 aa  681    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0270  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  67.51 
 
 		 669 aa  753    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2182  ABC transporter related  62.33 
 
 		 600 aa  754    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1248  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  69.37 
 
 		 625 aa  827    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7111  ABC transporter related  63.68 
 
 		 596 aa  768    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483113  normal  0.228237 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4845  ABC transporter related  57.53 
 
 		 599 aa  697    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2930  ABC transporter related  58.48 
 
 		 581 aa  673    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3404  ABC transporter related  62.61 
 
 		 600 aa  760    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00337035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2665  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  67.85 
 
 		 669 aa  758    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3233  ABC transporter related  60.1 
 
 		 599 aa  703    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3418  ABC transporter related  57.78 
 
 		 595 aa  660    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  normal  0.0149825 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3727  ABC transporter related  68.31 
 
 		 620 aa  815    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal  0.56235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2811  ABC transporter related  59.49 
 
 		 595 aa  699    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.882155 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4566  ABC transporter related  68.31 
 
 		 620 aa  815    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0712  ABC transporter related  64.36 
 
 		 596 aa  781    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0247864  normal  0.335635 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2875  ABC transporter related  68.87 
 
 		 625 aa  823    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216771  normal  0.111784 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5523  ABC transporter related  67.8 
 
 		 620 aa  794    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3797  ABC transporter related  68.31 
 
 		 620 aa  815    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  normal  0.145878 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1637  ABC transporter related  55.29 
 
 		 630 aa  623  1e-177  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135005  normal  0.475393 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4093  ABC transporter related  51.62 
 
 		 585 aa  551  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0553  ABC transporter related  48.14 
 
 		 598 aa  544  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0356  ABC transporter related  48.01 
 
 		 596 aa  510  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0591  ABC transporter related  45.95 
 
 		 593 aa  503  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179629 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5858  ABC transporter related  40.81 
 
 		 591 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.44 
 
 		 621 aa  345  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1764  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.43 
 
 		 621 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2840  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.43 
 
 		 621 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2871  ABC transporter ATP binding protein  38.43 
 
 		 621 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2813  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.43 
 
 		 621 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2753  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.43 
 
 		 621 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2441  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.43 
 
 		 621 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0567  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.43 
 
 		 589 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  38.53 
 
 		 623 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  38.53 
 
 		 643 aa  340  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.14 
 
 		 595 aa  340  5.9999999999999996e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2203  ABC transporter related  36.16 
 
 		 567 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2146  ABC transporter related  37.11 
 
 		 609 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31543  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4271  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  36.8 
 
 		 637 aa  334  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  36.49 
 
 		 663 aa  333  6e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  36.49 
 
 		 636 aa  332  9e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1135  ABC transporter related  36.32 
 
 		 637 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1159  ABC transporter related  36.32 
 
 		 637 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0680  ABC transporter related  36.14 
 
 		 637 aa  328  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  36.4 
 
 		 630 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2782  putative fused ATP-binding/permease protein  35.76 
 
 		 587 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.896144  normal  0.282624 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.99 
 
 		 598 aa  319  9e-86  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0126222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1768  ABC transporter related  36.77 
 
 		 622 aa  318  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1463  ABC transporter related  37.17 
 
 		 597 aa  318  2e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  36 
 
 		 603 aa  312  1e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3528  ABC transporter related  35.43 
 
 		 589 aa  312  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1408  hypothetical protein  35.02 
 
 		 594 aa  311  2e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1260  hypothetical protein  36.76 
 
 		 582 aa  310  4e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.678722 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1585  hypothetical protein  35.58 
 
 		 593 aa  310  6.999999999999999e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  39.59 
 
 		 587 aa  310  6.999999999999999e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  35.37 
 
 		 603 aa  309  9e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6225  ABC transporter related  36.7 
 
 		 624 aa  309  9e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  37.57 
 
 		 617 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0054  hypothetical protein  35.87 
 
 		 597 aa  307  3e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  34.75 
 
 		 612 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7080  ABC transporter related  40.53 
 
 		 621 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.161763  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0957  hypothetical protein  34.88 
 
 		 593 aa  304  3.0000000000000004e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  34.75 
 
 		 612 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  35.22 
 
 		 633 aa  303  5.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0067  hypothetical protein  34.82 
 
 		 599 aa  301  2e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2780  ABC transporter related  43.88 
 
 		 637 aa  301  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1542  ABC transporter related  36.01 
 
 		 621 aa  300  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264596  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2343  ABC transporter related  39.44 
 
 		 591 aa  300  6e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  0.0107518 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3044  ABC transporter related  35.89 
 
 		 637 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.989361  normal  0.444628 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3490  ATPase  38.59 
 
 		 614 aa  298  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1273  ABC-type transport system ATPase  35.21 
 
 		 622 aa  298  3e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.788537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1622  ABC transporter related  36.47 
 
 		 621 aa  297  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327918  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0739  ABC transport protein ATPase component  35.69 
 
 		 624 aa  297  4e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.191693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6620  ABC transporter related  38.06 
 
 		 617 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.349027  normal  0.153247 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2741  ABC transporter related  34.71 
 
 		 623 aa  296  7e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11970  ABC transporter, transmembrane permease and ATP binding components  38.74 
 
 		 599 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  34.96 
 
 		 629 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0682  ABC transporter related  35.31 
 
 		 606 aa  296  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0526  TonB-dependent receptor  38.06 
 
 		 608 aa  295  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1909  ABC transporter related  36.71 
 
 		 672 aa  296  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2174  ABC transporter related  39.8 
 
 		 627 aa  295  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7369  ABC transporter related  35.87 
 
 		 587 aa  296  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0594477  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2190  hypothetical protein  35.92 
 
 		 610 aa  295  2e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  35.98 
 
 		 655 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2102  ABC transporter related  34.54 
 
 		 623 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2714  ABC transporter related  34.54 
 
 		 623 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>