More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2182 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6186  multidrug ABC transporter ATPase/permease  77.85 
 
 		 605 aa  930    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159052  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0198  ABC transporter  60.17 
 
 		 572 aa  682    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3727  ABC transporter related  64.03 
 
 		 620 aa  741    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal  0.56235 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0270  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.05 
 
 		 669 aa  663    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7111  ABC transporter related  61.23 
 
 		 596 aa  706    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483113  normal  0.228237 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0276  ABC transporter related  63.59 
 
 		 601 aa  730    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0233  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  61.05 
 
 		 669 aa  663    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3233  ABC transporter related  61.58 
 
 		 599 aa  716    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5449  ABC transporter related  61.86 
 
 		 622 aa  658    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89957  normal  0.0448259 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0953  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  61.38 
 
 		 669 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6143  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  62.12 
 
 		 603 aa  739    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2299  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  63.51 
 
 		 620 aa  728    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3039  ABC transporter related  63.13 
 
 		 595 aa  733    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0515  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  61.38 
 
 		 663 aa  674    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2524  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.38 
 
 		 669 aa  668    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265455  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2930  ABC transporter related  62.93 
 
 		 581 aa  718    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1612  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  61.05 
 
 		 669 aa  663    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.658136  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2182  ABC transporter related  100 
 
 		 600 aa  1201    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2875  ABC transporter related  63.18 
 
 		 625 aa  723    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216771  normal  0.111784 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1248  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  63.7 
 
 		 625 aa  731    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0712  ABC transporter related  60.72 
 
 		 596 aa  702    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0247864  normal  0.335635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3404  ABC transporter related  78.17 
 
 		 600 aa  958    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00337035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3687  ABC transporter related  62.65 
 
 		 620 aa  726    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1416  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.05 
 
 		 669 aa  663    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4566  ABC transporter related  64.03 
 
 		 620 aa  741    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3418  ABC transporter related  60.93 
 
 		 595 aa  696    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  normal  0.0149825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4845  ABC transporter related  65.87 
 
 		 599 aa  778    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4941  ABC transporter related  64.3 
 
 		 604 aa  747    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.690923  normal  0.361162 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2665  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  61.38 
 
 		 669 aa  667    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4939  ABC transporter related  62.29 
 
 		 626 aa  723    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.777528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2811  ABC transporter related  62.46 
 
 		 595 aa  739    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.882155 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5523  ABC transporter related  62.65 
 
 		 620 aa  725    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3797  ABC transporter related  64.03 
 
 		 620 aa  741    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  normal  0.145878 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1637  ABC transporter related  56.95 
 
 		 630 aa  619  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135005  normal  0.475393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0553  ABC transporter related  51.22 
 
 		 598 aa  554  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0356  ABC transporter related  50.35 
 
 		 596 aa  530  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4093  ABC transporter related  50.09 
 
 		 585 aa  524  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0591  ABC transporter related  47.7 
 
 		 593 aa  499  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179629 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5858  ABC transporter related  41.74 
 
 		 591 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.72 
 
 		 598 aa  358  9.999999999999999e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0126222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.59 
 
 		 595 aa  354  2e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1463  ABC transporter related  40.04 
 
 		 597 aa  339  9.999999999999999e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2782  putative fused ATP-binding/permease protein  36.1 
 
 		 587 aa  323  7e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.896144  normal  0.282624 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.47 
 
 		 621 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  36.32 
 
 		 629 aa  319  7.999999999999999e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2203  ABC transporter related  35.6 
 
 		 567 aa  318  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0957  hypothetical protein  34.57 
 
 		 593 aa  313  4.999999999999999e-84  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2840  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.3 
 
 		 621 aa  313  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2871  ABC transporter ATP binding protein  36.3 
 
 		 621 aa  313  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2753  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.3 
 
 		 621 aa  313  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2441  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.3 
 
 		 621 aa  313  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2813  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.3 
 
 		 621 aa  313  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1764  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.3 
 
 		 621 aa  313  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0567  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.3 
 
 		 589 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  36.28 
 
 		 597 aa  312  1e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  34.55 
 
 		 630 aa  310  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0478  ABC transporter ATP-binding protein  35.5 
 
 		 592 aa  309  6.999999999999999e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  34.26 
 
 		 663 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  34.26 
 
 		 636 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4271  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  33.91 
 
 		 637 aa  307  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  38.66 
 
 		 603 aa  306  6e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  35.12 
 
 		 612 aa  306  6e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1912  ABC transporter related  36.07 
 
 		 604 aa  306  8.000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  37.46 
 
 		 617 aa  306  8.000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  34.95 
 
 		 612 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3044  ABC transporter related  36.27 
 
 		 637 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.989361  normal  0.444628 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1135  ABC transporter related  33.74 
 
 		 637 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2780  ABC transporter related  36.44 
 
 		 637 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  36.11 
 
 		 640 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1159  ABC transporter related  33.74 
 
 		 637 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1542  ABC transporter related  37.65 
 
 		 621 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264596  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0083  ABC transporter related  40.33 
 
 		 619 aa  303  5.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2174  ABC transporter related  39.45 
 
 		 627 aa  303  5.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0680  ABC transporter related  33.56 
 
 		 637 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2146  ABC transporter related  33.28 
 
 		 609 aa  303  9e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31543  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  37.5 
 
 		 601 aa  302  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  38.26 
 
 		 603 aa  302  1e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  34.31 
 
 		 623 aa  302  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2102  ABC transporter related  35.54 
 
 		 623 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2714  ABC transporter related  35.54 
 
 		 623 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2632  ABC transporter related  36.03 
 
 		 623 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3695  ABC transporter related  41.95 
 
 		 603 aa  301  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3490  ATPase  40.58 
 
 		 614 aa  301  3e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  36.05 
 
 		 612 aa  301  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2741  ABC transporter related  35.37 
 
 		 623 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0739  ABC transport protein ATPase component  38.18 
 
 		 624 aa  300  5e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.191693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  35.88 
 
 		 612 aa  300  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2892  ABC transporter related  38.91 
 
 		 612 aa  300  7e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2766  ABC transporter related  35.87 
 
 		 623 aa  299  9e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3504  multidrug ABC transporter ATPase/permease  36.72 
 
 		 657 aa  299  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0572  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.53 
 
 		 651 aa  298  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620233  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1595  ABC transporter related  33.51 
 
 		 607 aa  298  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00338699  normal  0.481245 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  34.89 
 
 		 655 aa  298  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3491  ATPase  38.82 
 
 		 614 aa  297  4e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4748  ABC transporter related  34.91 
 
 		 611 aa  297  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  33.28 
 
 		 643 aa  297  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2865  ABC transporter related  37.31 
 
 		 614 aa  296  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.148905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0417  ABC transporter related  34.72 
 
 		 587 aa  296  5e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5775  ABC transporter related  39.92 
 
 		 617 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.832359  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6140  ABC transporter related  39.92 
 
 		 617 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.660679 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>