More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3695 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3695  ABC transporter related  100 
 
 		 603 aa  1180    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.49 
 
 		 595 aa  346  8e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1463  ABC transporter related  38.18 
 
 		 597 aa  334  3e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.81 
 
 		 598 aa  330  3e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0126222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2928  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  39 
 
 		 617 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6620  ABC transporter related  41.39 
 
 		 617 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.349027  normal  0.153247 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6140  ABC transporter related  41.39 
 
 		 617 aa  323  6e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5775  ABC transporter related  41.39 
 
 		 617 aa  323  6e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.832359  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0860  ABC transporter related  39.8 
 
 		 621 aa  322  9.999999999999999e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000519067  hitchhiker  0.000174676 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3071  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38 
 
 		 619 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0688673  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2169  ABC transporter related  38.8 
 
 		 617 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2245  ABC transporter, transmembrane region  38.72 
 
 		 619 aa  320  5e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2811  ABC transporter related  44.42 
 
 		 595 aa  318  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.882155 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2821  ABC transporter related  36.41 
 
 		 609 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7674  ABC efflux pump, ATPase subunit  41.32 
 
 		 617 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22456  normal  0.131905 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6066  ABC transporter related  42.6 
 
 		 617 aa  317  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0549196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2182  ABC transporter related  37.76 
 
 		 600 aa  316  9e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3039  ABC transporter related  44.21 
 
 		 595 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1431  ABC transporter related  37.58 
 
 		 609 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0505297  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2905  ABC transporter-related protein  37.68 
 
 		 609 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564374  normal  0.291067 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2185  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.36 
 
 		 617 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3128  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  37.37 
 
 		 609 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1366  ABC transporter related  37.58 
 
 		 609 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00434177  normal  0.0240824 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2930  ABC transporter related  43.72 
 
 		 581 aa  313  7.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1419  ABC transporter related  37.37 
 
 		 609 aa  311  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00302849  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1457  ABC transporter related  36.59 
 
 		 609 aa  311  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.162011  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2498  ABC transporter related  36.05 
 
 		 609 aa  309  9e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.896627  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1588  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.63 
 
 		 612 aa  309  1.0000000000000001e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3418  ABC transporter related  40.55 
 
 		 595 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  normal  0.0149825 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2782  ABC transporter related  37.98 
 
 		 618 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.292223 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1348  ABC transporter related  38.66 
 
 		 610 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416951  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3203  ABC transporter related  38.2 
 
 		 617 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3404  ABC transporter related  39.23 
 
 		 600 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00337035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4941  ABC transporter related  37.04 
 
 		 604 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.690923  normal  0.361162 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4049  ABC transporter related  38.99 
 
 		 610 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07111  hypothetical protein  37.02 
 
 		 612 aa  306  5.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2848  ABC transporter-related protein  39.52 
 
 		 611 aa  306  8.000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.934041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1441  ABC transporter related  38.12 
 
 		 618 aa  306  9.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73054 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1898  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  37.68 
 
 		 610 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0761429  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2131  ABC transporter related  38.2 
 
 		 617 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1556  ABC transporter related  36.05 
 
 		 609 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00693987  normal  0.0222029 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2801  ABC transporter related  36.05 
 
 		 609 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0386861  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3687  ABC transporter related  41.1 
 
 		 620 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2941  ABC transporter related  36.05 
 
 		 609 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.417973  normal  0.0292535 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1666  ABC transporter related  38.4 
 
 		 613 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.66549  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6186  multidrug ABC transporter ATPase/permease  36.99 
 
 		 605 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159052  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4542  ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.46 
 
 		 610 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7111  ABC transporter related  37.76 
 
 		 596 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483113  normal  0.228237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2628  ABC transporter ATP-binding protein  38 
 
 		 658 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5523  ABC transporter related  41.1 
 
 		 620 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1451  ABC transporter-related protein  38.23 
 
 		 609 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.296009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0591  ABC transporter related  38.12 
 
 		 613 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0415751  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2343  ABC transporter related  38.13 
 
 		 591 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  0.0107518 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0276  ABC transporter related  39.58 
 
 		 601 aa  303  6.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001027  ABC transporter ATP-binding protein  35.74 
 
 		 616 aa  303  7.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0739  ABC transporter related  40.96 
 
 		 613 aa  303  8.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.327273  normal  0.0543304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3528  ABC transporter related  39.43 
 
 		 589 aa  303  8.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2532  ABC transporter related  37.2 
 
 		 609 aa  302  9e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00690658  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0671  ABC-type multidrug efflux pump, ATP-binding component  35.96 
 
 		 607 aa  302  1e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123836  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22440  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  37.8 
 
 		 610 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000108745 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4939  ABC transporter related  40.89 
 
 		 626 aa  302  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.777528 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3727  ABC transporter related  41.26 
 
 		 620 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal  0.56235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4566  ABC transporter related  41.26 
 
 		 620 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3797  ABC transporter related  41.26 
 
 		 620 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  normal  0.145878 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0957  hypothetical protein  34.43 
 
 		 593 aa  300  4e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1742  ABC transporter related  36.22 
 
 		 609 aa  300  5e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.394506 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2579  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  36.33 
 
 		 611 aa  300  5e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000689381  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3046  ABC transporter related  37.76 
 
 		 618 aa  300  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.752635 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2135  ABC transporter-related protein  39.3 
 
 		 630 aa  300  5e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180328 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00688  multidrug resistance ABC transporter ATP-binding and permease protein  37.72 
 
 		 613 aa  299  8e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0450616  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2299  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  40.84 
 
 		 620 aa  299  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1768  ABC transporter related  36.69 
 
 		 622 aa  298  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3836  ABC transporter related  38.38 
 
 		 610 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.643944 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2089  ABC transporter related  38.4 
 
 		 613 aa  299  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.240835  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0242  ABC transporter, ATP-binding protein  34.59 
 
 		 706 aa  298  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0691  ABC transporter ATP-binding protein  35.77 
 
 		 609 aa  298  2e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4845  ABC transporter related  41.27 
 
 		 599 aa  298  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2206  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  37.5 
 
 		 612 aa  298  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4091  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.77 
 
 		 610 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0803284  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2163  hypothetical protein  34.97 
 
 		 610 aa  297  3e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2713  ABC transporter related  35.96 
 
 		 609 aa  298  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00697822  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3443  ABC transporter related  39.54 
 
 		 588 aa  297  5e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2892  ABC transporter related  38.68 
 
 		 612 aa  296  5e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3122  ABC transporter related  39.54 
 
 		 588 aa  297  5e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0836  ABC transporter related  40.04 
 
 		 610 aa  296  7e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181434  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001285  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  36.83 
 
 		 603 aa  296  9e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000363731  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  37.77 
 
 		 630 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0067  hypothetical protein  35 
 
 		 599 aa  295  1e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0907  ABC transporter related  39.84 
 
 		 610 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.657123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2721  ABC transporter related  38.2 
 
 		 615 aa  296  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3319  ABC transporter related  39.51 
 
 		 588 aa  295  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.338254 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1248  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  37.99 
 
 		 625 aa  294  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3490  ATPase  37.95 
 
 		 614 aa  293  5e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11970  ABC transporter, transmembrane permease and ATP binding components  36.77 
 
 		 599 aa  293  5e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0526  TonB-dependent receptor  36.11 
 
 		 608 aa  293  6e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2190  hypothetical protein  34.97 
 
 		 610 aa  293  7e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0712  ABC transporter related  40.79 
 
 		 596 aa  292  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0247864  normal  0.335635 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  34.38 
 
 		 603 aa  292  1e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3827  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  37.3 
 
 		 610 aa  292  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284147  normal  0.0157718 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3233  ABC transporter related  38.28 
 
 		 599 aa  291  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494492  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>