More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3418 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4941  ABC transporter related  59.28 
 
 		 604 aa  686    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.690923  normal  0.361162 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3687  ABC transporter related  61.27 
 
 		 620 aa  692    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3418  ABC transporter related  100 
 
 		 595 aa  1162    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  normal  0.0149825 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0233  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  60.86 
 
 		 669 aa  645    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1612  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  60.86 
 
 		 669 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.658136  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6143  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  57.78 
 
 		 603 aa  675    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2811  ABC transporter related  83.53 
 
 		 595 aa  968    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.882155 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7111  ABC transporter related  59.11 
 
 		 596 aa  676    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483113  normal  0.228237 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0198  ABC transporter  63.35 
 
 		 572 aa  659    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0953  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  61.21 
 
 		 669 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2930  ABC transporter related  85.54 
 
 		 581 aa  942    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5449  ABC transporter related  60.31 
 
 		 622 aa  635    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89957  normal  0.0448259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0712  ABC transporter related  59.28 
 
 		 596 aa  685    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0247864  normal  0.335635 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2299  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  60.93 
 
 		 620 aa  685    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0515  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  60.62 
 
 		 663 aa  659    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0276  ABC transporter related  60 
 
 		 601 aa  695    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6186  multidrug ABC transporter ATPase/permease  62.41 
 
 		 605 aa  720    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159052  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2182  ABC transporter related  60.93 
 
 		 600 aa  730    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1416  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  60.86 
 
 		 669 aa  645    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1248  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  61.88 
 
 		 625 aa  694    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0270  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  60.86 
 
 		 669 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3404  ABC transporter related  63.56 
 
 		 600 aa  751    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00337035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4939  ABC transporter related  61.11 
 
 		 626 aa  675    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.777528 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3727  ABC transporter related  60.76 
 
 		 620 aa  696    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal  0.56235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4566  ABC transporter related  60.76 
 
 		 620 aa  696    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3039  ABC transporter related  83.53 
 
 		 595 aa  946    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2665  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  61.21 
 
 		 669 aa  649    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2524  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.21 
 
 		 669 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265455  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4845  ABC transporter related  66.84 
 
 		 599 aa  769    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2875  ABC transporter related  61.73 
 
 		 625 aa  698    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216771  normal  0.111784 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5523  ABC transporter related  61.27 
 
 		 620 aa  692    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3233  ABC transporter related  60.65 
 
 		 599 aa  669    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3797  ABC transporter related  60.76 
 
 		 620 aa  696    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  normal  0.145878 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1637  ABC transporter related  58.14 
 
 		 630 aa  602  1.0000000000000001e-171  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135005  normal  0.475393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0553  ABC transporter related  50 
 
 		 598 aa  535  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0356  ABC transporter related  49.82 
 
 		 596 aa  518  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0591  ABC transporter related  48.96 
 
 		 593 aa  516  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179629 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4093  ABC transporter related  50 
 
 		 585 aa  513  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5858  ABC transporter related  41.07 
 
 		 591 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1463  ABC transporter related  40.42 
 
 		 597 aa  357  3.9999999999999996e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.23 
 
 		 595 aa  344  2.9999999999999997e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  38.74 
 
 		 640 aa  340  5e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  41.1 
 
 		 617 aa  339  7e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.07 
 
 		 598 aa  333  4e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0126222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1494  ABC transporter related  36.45 
 
 		 647 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.33 
 
 		 621 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0689  ABC transporter related  38.69 
 
 		 644 aa  326  9e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366434  normal  0.23371 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2146  ABC transporter related  37.2 
 
 		 609 aa  325  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31543  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0567  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.81 
 
 		 589 aa  325  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2441  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.81 
 
 		 621 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2840  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.81 
 
 		 621 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2753  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.81 
 
 		 621 aa  324  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2871  ABC transporter ATP binding protein  38.81 
 
 		 621 aa  324  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2813  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.81 
 
 		 621 aa  324  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1764  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.81 
 
 		 621 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2203  ABC transporter related  39.32 
 
 		 567 aa  324  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4271  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  36.68 
 
 		 637 aa  323  6e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  35.84 
 
 		 612 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  35.84 
 
 		 612 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  37.79 
 
 		 655 aa  321  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  36.66 
 
 		 643 aa  320  7e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  33.9 
 
 		 633 aa  318  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  38.4 
 
 		 663 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  37.29 
 
 		 630 aa  317  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  38.21 
 
 		 636 aa  316  6e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1159  ABC transporter related  37.45 
 
 		 637 aa  316  6e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1135  ABC transporter related  37.45 
 
 		 637 aa  316  7e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  35.85 
 
 		 603 aa  316  9e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  37.75 
 
 		 629 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  36.14 
 
 		 623 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2163  hypothetical protein  36.03 
 
 		 610 aa  313  3.9999999999999997e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0680  ABC transporter related  37.26 
 
 		 637 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0054  hypothetical protein  36.76 
 
 		 597 aa  313  5.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2741  ABC transporter related  37.14 
 
 		 623 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5208  ABC transporter related  37.96 
 
 		 663 aa  312  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.670373  normal  0.309398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  35.97 
 
 		 587 aa  311  2e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2102  ABC transporter related  36.51 
 
 		 623 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2714  ABC transporter related  36.51 
 
 		 623 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0140  ABC transporter related  36.99 
 
 		 672 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0067  hypothetical protein  40.29 
 
 		 599 aa  311  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2190  hypothetical protein  36.03 
 
 		 610 aa  310  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1542  ABC transporter related  37.89 
 
 		 621 aa  310  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264596  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0417  ABC transporter related  35.81 
 
 		 587 aa  310  5e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  35.51 
 
 		 603 aa  310  5.9999999999999995e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1912  ABC transporter related  39.5 
 
 		 604 aa  310  5.9999999999999995e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4741  ABC transporter related  37.76 
 
 		 662 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.616952  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1585  hypothetical protein  41.51 
 
 		 593 aa  309  8e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1408  hypothetical protein  40.99 
 
 		 594 aa  307  4.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2194  ABC transporter related  36.45 
 
 		 624 aa  307  4.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.290194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2782  putative fused ATP-binding/permease protein  36.23 
 
 		 587 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.896144  normal  0.282624 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  36.44 
 
 		 603 aa  306  9.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0478  ABC transporter ATP-binding protein  37.84 
 
 		 592 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0957  hypothetical protein  36.42 
 
 		 593 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0327  ABC transporter, transmembrane region  37.78 
 
 		 587 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2094  ABC transporter related  34.22 
 
 		 661 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181859  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3210  ABC transporter related  39.27 
 
 		 587 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.461099  normal  0.871675 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4185  ABC transporter related  37.61 
 
 		 654 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.903444 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0739  ABC transport protein ATPase component  36.24 
 
 		 624 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.191693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3504  multidrug ABC transporter ATPase/permease  36.38 
 
 		 657 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  34.6 
 
 		 655 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>