More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2524 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5449  ABC transporter related  77.98 
 
 		 622 aa  881    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89957  normal  0.0448259 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3233  ABC transporter related  61.98 
 
 		 599 aa  706    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0270  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  99.55 
 
 		 669 aa  1332    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2524  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  100 
 
 		 669 aa  1338    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265455  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0233  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  99.55 
 
 		 669 aa  1332    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4941  ABC transporter related  69.85 
 
 		 604 aa  834    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.690923  normal  0.361162 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3727  ABC transporter related  80.07 
 
 		 620 aa  957    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal  0.56235 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0712  ABC transporter related  65.34 
 
 		 596 aa  785    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0247864  normal  0.335635 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1416  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  99.55 
 
 		 669 aa  1332    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0198  ABC transporter  65.77 
 
 		 572 aa  768    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0953  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  99.7 
 
 		 669 aa  1333    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2665  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  99.7 
 
 		 669 aa  1333    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1612  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  99.55 
 
 		 669 aa  1332    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.658136  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0276  ABC transporter related  70.2 
 
 		 601 aa  824    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2299  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  78.92 
 
 		 620 aa  939    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0515  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  93.72 
 
 		 663 aa  1142    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2182  ABC transporter related  61.55 
 
 		 600 aa  728    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7111  ABC transporter related  66.67 
 
 		 596 aa  796    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483113  normal  0.228237 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1248  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  79.14 
 
 		 625 aa  918    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3418  ABC transporter related  61.62 
 
 		 595 aa  677    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  normal  0.0149825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2811  ABC transporter related  61.77 
 
 		 595 aa  695    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.882155 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3404  ABC transporter related  61.24 
 
 		 600 aa  741    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00337035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4845  ABC transporter related  61.21 
 
 		 599 aa  699    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4566  ABC transporter related  80.07 
 
 		 620 aa  957    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4939  ABC transporter related  78.62 
 
 		 626 aa  920    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.777528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6186  multidrug ABC transporter ATPase/permease  61.03 
 
 		 605 aa  701    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159052  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2875  ABC transporter related  79.64 
 
 		 625 aa  924    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216771  normal  0.111784 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3687  ABC transporter related  80.73 
 
 		 620 aa  947    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2930  ABC transporter related  60.48 
 
 		 581 aa  671    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3039  ABC transporter related  60.92 
 
 		 595 aa  673    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3797  ABC transporter related  80.07 
 
 		 620 aa  957    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  normal  0.145878 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6143  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  67.68 
 
 		 603 aa  795    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5523  ABC transporter related  80.73 
 
 		 620 aa  946    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1637  ABC transporter related  56.48 
 
 		 630 aa  635  1e-180  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135005  normal  0.475393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0553  ABC transporter related  50.94 
 
 		 598 aa  562  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0356  ABC transporter related  49.83 
 
 		 596 aa  523  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4093  ABC transporter related  48.9 
 
 		 585 aa  514  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0591  ABC transporter related  46.55 
 
 		 593 aa  500  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179629 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5858  ABC transporter related  41.44 
 
 		 591 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.59 
 
 		 595 aa  349  1e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1135  ABC transporter related  37.41 
 
 		 637 aa  347  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4271  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  37.41 
 
 		 637 aa  347  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1159  ABC transporter related  37.41 
 
 		 637 aa  347  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  37.78 
 
 		 663 aa  346  7e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  37.61 
 
 		 636 aa  345  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0680  ABC transporter related  37.24 
 
 		 637 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2146  ABC transporter related  37.07 
 
 		 609 aa  342  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31543  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.33 
 
 		 621 aa  342  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1463  ABC transporter related  38.67 
 
 		 597 aa  339  9.999999999999999e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  36.96 
 
 		 643 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  36.77 
 
 		 623 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.46 
 
 		 598 aa  333  8e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0126222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  36.77 
 
 		 630 aa  332  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2813  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.47 
 
 		 621 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2871  ABC transporter ATP binding protein  36.47 
 
 		 621 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2441  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.47 
 
 		 621 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2753  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.47 
 
 		 621 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2782  putative fused ATP-binding/permease protein  35.75 
 
 		 587 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.896144  normal  0.282624 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2840  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.47 
 
 		 621 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1764  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.47 
 
 		 621 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0567  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.89 
 
 		 589 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  37.13 
 
 		 640 aa  323  9.000000000000001e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  36.14 
 
 		 612 aa  319  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  36.14 
 
 		 612 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2102  ABC transporter related  36.99 
 
 		 623 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2714  ABC transporter related  36.99 
 
 		 623 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2741  ABC transporter related  37.21 
 
 		 623 aa  317  6e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  38.64 
 
 		 603 aa  316  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  38.34 
 
 		 617 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  34.87 
 
 		 629 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1113  ABC transporter related  37.99 
 
 		 646 aa  315  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1622  ABC transporter related  38.2 
 
 		 621 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327918  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0975  ABC transporter related  37.12 
 
 		 626 aa  313  4.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0054  hypothetical protein  33.68 
 
 		 597 aa  313  9e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2203  ABC transporter related  35.39 
 
 		 567 aa  313  9e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1273  ABC-type transport system ATPase  35.41 
 
 		 622 aa  313  1e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.788537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0417  ABC transporter related  34.85 
 
 		 587 aa  311  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6620  ABC transporter related  36.7 
 
 		 587 aa  310  5e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00971242  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1542  ABC transporter related  37.25 
 
 		 621 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264596  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2194  ABC transporter related  34.86 
 
 		 624 aa  309  1.0000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.290194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0585  ABC transporter related  36.43 
 
 		 623 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1585  hypothetical protein  37.12 
 
 		 593 aa  308  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0980  ABC transporter related  35.64 
 
 		 606 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2216  ABC transporter related  35.3 
 
 		 651 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298218  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0478  ABC transporter ATP-binding protein  35.3 
 
 		 592 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3071  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.77 
 
 		 619 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0688673  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1408  hypothetical protein  36.96 
 
 		 594 aa  307  4.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2340  ABC transporter related  37.27 
 
 		 604 aa  307  4.0000000000000004e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.502377 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  35.76 
 
 		 612 aa  307  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1666  ABC transporter related  35.24 
 
 		 613 aa  307  5.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.66549  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2245  ABC transporter, transmembrane region  35.22 
 
 		 619 aa  306  6e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  35.59 
 
 		 612 aa  306  6e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  36.77 
 
 		 595 aa  306  8.000000000000001e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2632  ABC transporter related  36.82 
 
 		 623 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3208  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.71 
 
 		 625 aa  306  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333533  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3044  ABC transporter related  36.93 
 
 		 637 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.989361  normal  0.444628 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  35.05 
 
 		 655 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1494  ABC transporter related  35.92 
 
 		 647 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0140  ABC transporter related  37.48 
 
 		 672 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  36.56 
 
 		 606 aa  304  4.0000000000000003e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>