More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5523 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4941  ABC transporter related  70.29 
 
 		 604 aa  833    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.690923  normal  0.361162 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4845  ABC transporter related  60.14 
 
 		 599 aa  699    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6186  multidrug ABC transporter ATPase/permease  62.01 
 
 		 605 aa  709    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159052  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0233  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  80.07 
 
 		 669 aa  882    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6143  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  67.8 
 
 		 603 aa  791    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3797  ABC transporter related  95.65 
 
 		 620 aa  1177    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  normal  0.145878 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1637  ABC transporter related  56.53 
 
 		 630 aa  635    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135005  normal  0.475393 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2930  ABC transporter related  60.73 
 
 		 581 aa  670    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2524  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  80.4 
 
 		 669 aa  887    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265455  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0953  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  80.56 
 
 		 669 aa  888    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2811  ABC transporter related  62.54 
 
 		 595 aa  701    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.882155 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3039  ABC transporter related  61.86 
 
 		 595 aa  675    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0276  ABC transporter related  71.05 
 
 		 601 aa  853    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2299  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  95.16 
 
 		 620 aa  1153    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1416  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  80.07 
 
 		 669 aa  882    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0515  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  80.4 
 
 		 663 aa  900    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5449  ABC transporter related  79.3 
 
 		 622 aa  889    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89957  normal  0.0448259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0712  ABC transporter related  67.11 
 
 		 596 aa  807    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0247864  normal  0.335635 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3233  ABC transporter related  62.33 
 
 		 599 aa  715    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2182  ABC transporter related  63.4 
 
 		 600 aa  736    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1248  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  81.7 
 
 		 625 aa  967    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3687  ABC transporter related  99.84 
 
 		 620 aa  1235    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3418  ABC transporter related  61.27 
 
 		 595 aa  678    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  normal  0.0149825 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4939  ABC transporter related  91.35 
 
 		 626 aa  1094    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.777528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3404  ABC transporter related  62.79 
 
 		 600 aa  749    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00337035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0198  ABC transporter  66.56 
 
 		 572 aa  793    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2875  ABC transporter related  82.03 
 
 		 625 aa  975    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216771  normal  0.111784 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7111  ABC transporter related  67.61 
 
 		 596 aa  816    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483113  normal  0.228237 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4566  ABC transporter related  95.65 
 
 		 620 aa  1177    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1612  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  80.07 
 
 		 669 aa  882    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.658136  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3727  ABC transporter related  95.65 
 
 		 620 aa  1177    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal  0.56235 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2665  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  80.56 
 
 		 669 aa  888    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0270  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  80.07 
 
 		 669 aa  882    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5523  ABC transporter related  100 
 
 		 620 aa  1238    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0553  ABC transporter related  49.4 
 
 		 598 aa  545  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0356  ABC transporter related  50.35 
 
 		 596 aa  529  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4093  ABC transporter related  49.33 
 
 		 585 aa  520  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5858  ABC transporter related  42.08 
 
 		 591 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0591  ABC transporter related  45.15 
 
 		 593 aa  490  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179629 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  38.49 
 
 		 623 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  37.41 
 
 		 643 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.61 
 
 		 621 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2146  ABC transporter related  36.94 
 
 		 609 aa  332  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31543  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1542  ABC transporter related  38.23 
 
 		 621 aa  332  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264596  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4271  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  37.46 
 
 		 637 aa  331  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  37.35 
 
 		 630 aa  332  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1135  ABC transporter related  37.63 
 
 		 637 aa  329  7e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1463  ABC transporter related  38.22 
 
 		 597 aa  329  8e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1159  ABC transporter related  37.63 
 
 		 637 aa  329  8e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  37.63 
 
 		 663 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0680  ABC transporter related  37.46 
 
 		 637 aa  327  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.17 
 
 		 595 aa  326  6e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  37.46 
 
 		 636 aa  326  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3044  ABC transporter related  38.94 
 
 		 637 aa  323  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.989361  normal  0.444628 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0054  hypothetical protein  33.61 
 
 		 597 aa  322  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2840  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.63 
 
 		 621 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2441  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.63 
 
 		 621 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2813  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.63 
 
 		 621 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  35.29 
 
 		 603 aa  322  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1764  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.63 
 
 		 621 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2871  ABC transporter ATP binding protein  36.63 
 
 		 621 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2753  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.63 
 
 		 621 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2780  ABC transporter related  39.89 
 
 		 637 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  37.89 
 
 		 603 aa  320  6e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0567  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.64 
 
 		 589 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  39.2 
 
 		 655 aa  317  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2782  putative fused ATP-binding/permease protein  36.49 
 
 		 587 aa  318  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.896144  normal  0.282624 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.77 
 
 		 598 aa  317  4e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0126222  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  34.71 
 
 		 603 aa  316  7e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2343  ABC transporter related  36.49 
 
 		 591 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  0.0107518 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2203  ABC transporter related  35.12 
 
 		 567 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  40.03 
 
 		 617 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  36.52 
 
 		 587 aa  313  9e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0417  ABC transporter related  34.92 
 
 		 587 aa  310  4e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1768  ABC transporter related  34.83 
 
 		 622 aa  309  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0644  ABC transporter related  51.41 
 
 		 646 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.601366 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2163  hypothetical protein  32.76 
 
 		 610 aa  308  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5208  ABC transporter related  38.7 
 
 		 663 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.670373  normal  0.309398 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1494  ABC transporter related  36.39 
 
 		 647 aa  307  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  36.24 
 
 		 640 aa  306  9.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4741  ABC transporter related  38.51 
 
 		 662 aa  306  9.000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.616952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1622  ABC transporter related  37.23 
 
 		 621 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327918  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2190  hypothetical protein  32.93 
 
 		 610 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0682  ABC transporter related  36.57 
 
 		 606 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1113  ABC transporter related  37 
 
 		 646 aa  305  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2174  ABC transporter related  40.88 
 
 		 627 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3208  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.09 
 
 		 625 aa  304  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333533  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0689  ABC transporter related  37.31 
 
 		 644 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366434  normal  0.23371 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3046  ABC transporter related  35.38 
 
 		 618 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.752635 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6620  ABC transporter related  35.38 
 
 		 587 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00971242  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0597  ABC transporter related  35.03 
 
 		 596 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6225  ABC transporter related  51.88 
 
 		 624 aa  303  9e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0665  ABC transporter related  50.46 
 
 		 646 aa  303  9e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.308501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0677  ABC transporter related  50.46 
 
 		 618 aa  302  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.0281361 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2782  ABC transporter related  35.09 
 
 		 618 aa  302  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.292223 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1740  ABC transporter related  46.15 
 
 		 609 aa  301  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0539083  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3223  ABC transporter related  38.47 
 
 		 620 aa  301  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3356  ABC transporter related  34.85 
 
 		 594 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0405132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1765  putative multidrug export ATP-binding/permease protein  37.24 
 
 		 611 aa  301  3e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.193785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0391  ABC transporter-related protein  35.65 
 
 		 630 aa  301  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00324467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>