More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6186 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6186  multidrug ABC transporter ATPase/permease  100 
 
 		 605 aa  1210    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159052  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5449  ABC transporter related  61.28 
 
 		 622 aa  666    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89957  normal  0.0448259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4845  ABC transporter related  64.32 
 
 		 599 aa  748    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2875  ABC transporter related  61.25 
 
 		 625 aa  716    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216771  normal  0.111784 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4941  ABC transporter related  60.27 
 
 		 604 aa  707    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.690923  normal  0.361162 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0233  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  60.51 
 
 		 669 aa  652    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0712  ABC transporter related  59.66 
 
 		 596 aa  699    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0247864  normal  0.335635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3039  ABC transporter related  63.78 
 
 		 595 aa  721    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6143  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  60.71 
 
 		 603 aa  722    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1416  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  60.51 
 
 		 669 aa  652    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0198  ABC transporter  65.42 
 
 		 572 aa  678    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0953  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  60.85 
 
 		 669 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2524  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  60.85 
 
 		 669 aa  656    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265455  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0276  ABC transporter related  61.45 
 
 		 601 aa  723    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2665  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  60.85 
 
 		 669 aa  655    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3727  ABC transporter related  61.95 
 
 		 620 aa  731    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal  0.56235 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2299  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  60.75 
 
 		 620 aa  706    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3687  ABC transporter related  61.26 
 
 		 620 aa  711    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0515  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  61.03 
 
 		 663 aa  663    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3418  ABC transporter related  62.41 
 
 		 595 aa  705    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  normal  0.0149825 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0270  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  60.51 
 
 		 669 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2182  ABC transporter related  77.85 
 
 		 600 aa  952    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1248  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  61.42 
 
 		 625 aa  717    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3404  ABC transporter related  76.22 
 
 		 600 aa  914    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00337035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4939  ABC transporter related  60.44 
 
 		 626 aa  701    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.777528 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7111  ABC transporter related  59.66 
 
 		 596 aa  696    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483113  normal  0.228237 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4566  ABC transporter related  61.95 
 
 		 620 aa  731    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2930  ABC transporter related  64.58 
 
 		 581 aa  721    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1612  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  60.51 
 
 		 669 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.658136  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2811  ABC transporter related  63.61 
 
 		 595 aa  732    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.882155 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5523  ABC transporter related  61.26 
 
 		 620 aa  710    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3797  ABC transporter related  61.95 
 
 		 620 aa  731    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  normal  0.145878 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3233  ABC transporter related  59.9 
 
 		 599 aa  691    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1637  ABC transporter related  54.9 
 
 		 630 aa  607  9.999999999999999e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135005  normal  0.475393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0553  ABC transporter related  49.91 
 
 		 598 aa  536  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0356  ABC transporter related  49.74 
 
 		 596 aa  516  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0591  ABC transporter related  48.06 
 
 		 593 aa  500  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179629 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4093  ABC transporter related  48.8 
 
 		 585 aa  498  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5858  ABC transporter related  41.67 
 
 		 591 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.32 
 
 		 595 aa  354  2e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.19 
 
 		 598 aa  335  2e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0126222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2203  ABC transporter related  38.13 
 
 		 567 aa  332  9e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2782  putative fused ATP-binding/permease protein  36.39 
 
 		 587 aa  331  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.896144  normal  0.282624 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1463  ABC transporter related  37.99 
 
 		 597 aa  320  5e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  37.55 
 
 		 603 aa  319  7.999999999999999e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  37.55 
 
 		 603 aa  318  1e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2892  ABC transporter related  40.85 
 
 		 612 aa  316  8e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1542  ABC transporter related  37.65 
 
 		 621 aa  316  9e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264596  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3490  ATPase  38.64 
 
 		 614 aa  314  3.9999999999999997e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0739  ABC transport protein ATPase component  37.94 
 
 		 624 aa  313  7.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.191693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  34.78 
 
 		 663 aa  313  9e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  36.5 
 
 		 629 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  34.6 
 
 		 636 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0567  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.06 
 
 		 589 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1764  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.06 
 
 		 621 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2871  ABC transporter ATP binding protein  38.06 
 
 		 621 aa  310  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2753  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.06 
 
 		 621 aa  310  5e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2840  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.06 
 
 		 621 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2441  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.06 
 
 		 621 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2813  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.06 
 
 		 621 aa  310  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2146  ABC transporter related  37.88 
 
 		 609 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31543  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4271  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  34.96 
 
 		 637 aa  307  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.85 
 
 		 621 aa  308  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6620  ABC transporter related  39.32 
 
 		 617 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.349027  normal  0.153247 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1135  ABC transporter related  35.12 
 
 		 637 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1159  ABC transporter related  35.12 
 
 		 637 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  37.88 
 
 		 623 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5775  ABC transporter related  39.15 
 
 		 617 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.832359  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6140  ABC transporter related  39.15 
 
 		 617 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1912  ABC transporter related  35.84 
 
 		 604 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  36.73 
 
 		 630 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0957  hypothetical protein  37.53 
 
 		 593 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0680  ABC transporter related  34.95 
 
 		 637 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0591  ABC transporter related  36.6 
 
 		 613 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0415751  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3044  ABC transporter related  36.06 
 
 		 637 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.989361  normal  0.444628 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2174  ABC transporter related  41.24 
 
 		 627 aa  303  6.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7674  ABC efflux pump, ATPase subunit  38.97 
 
 		 617 aa  302  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22456  normal  0.131905 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  35.34 
 
 		 597 aa  302  1e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0665  ABC transporter related  52.2 
 
 		 646 aa  301  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.308501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0644  ABC transporter related  51.89 
 
 		 646 aa  301  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.601366 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  38.16 
 
 		 643 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2780  ABC transporter related  35.74 
 
 		 637 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  38.18 
 
 		 587 aa  301  3e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0677  ABC transporter related  52.2 
 
 		 618 aa  301  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.0281361 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  33.33 
 
 		 633 aa  299  8e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7369  ABC transporter related  35.86 
 
 		 587 aa  299  8e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0594477  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  37.41 
 
 		 617 aa  299  8e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2185  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.28 
 
 		 617 aa  298  1e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1204  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  43.83 
 
 		 614 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494984  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2343  ABC transporter related  35.26 
 
 		 591 aa  299  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  0.0107518 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2642  ABC transporter related  43.27 
 
 		 614 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.988853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3528  ABC transporter related  35.58 
 
 		 589 aa  298  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2135  ABC transporter-related protein  37.93 
 
 		 630 aa  297  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180328 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3491  ATPase  39.48 
 
 		 614 aa  297  3e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2163  hypothetical protein  36.95 
 
 		 610 aa  297  4e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1408  hypothetical protein  41.12 
 
 		 594 aa  296  6e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2865  ABC transporter related  43.58 
 
 		 614 aa  296  7e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.148905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0327  ABC transporter, transmembrane region  35.58 
 
 		 587 aa  295  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  35.54 
 
 		 612 aa  296  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0671  ABC-type multidrug efflux pump, ATP-binding component  35.71 
 
 		 607 aa  295  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>