More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0327 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  58.89 
 
 		 630 aa  675    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2441  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  58.89 
 
 		 621 aa  661    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2813  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  58.89 
 
 		 621 aa  661    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3122  ABC transporter related  63.84 
 
 		 588 aa  758    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0567  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  59.74 
 
 		 589 aa  645    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2782  putative fused ATP-binding/permease protein  77.34 
 
 		 587 aa  934    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.896144  normal  0.282624 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0327  ABC transporter, transmembrane region  100 
 
 		 587 aa  1189    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2871  ABC transporter ATP binding protein  58.89 
 
 		 621 aa  661    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1135  ABC transporter related  59.93 
 
 		 637 aa  674    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4271  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  59.76 
 
 		 637 aa  674    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6620  ABC transporter related  66.67 
 
 		 587 aa  785    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00971242  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7369  ABC transporter related  66.67 
 
 		 587 aa  789    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0594477  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  58.89 
 
 		 621 aa  679    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3443  ABC transporter related  63.84 
 
 		 588 aa  758    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3210  ABC transporter related  77.51 
 
 		 587 aa  895    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.461099  normal  0.871675 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1764  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  58.89 
 
 		 621 aa  661    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2840  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  58.89 
 
 		 621 aa  661    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  58.89 
 
 		 623 aa  676    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3528  ABC transporter related  62.99 
 
 		 589 aa  744    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1142  ABC transporter related  75.64 
 
 		 585 aa  893    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0417  ABC transporter related  87.05 
 
 		 587 aa  1052    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0680  ABC transporter related  59.76 
 
 		 637 aa  671    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2146  ABC transporter related  59.93 
 
 		 609 aa  674    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31543  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2753  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  58.89 
 
 		 621 aa  661    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  59.41 
 
 		 636 aa  691    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3319  ABC transporter related  63.33 
 
 		 588 aa  757    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.338254 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  58.72 
 
 		 643 aa  674    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  59.59 
 
 		 663 aa  692    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1159  ABC transporter related  59.93 
 
 		 637 aa  674    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0505  ABC transporter related  54.66 
 
 		 599 aa  629  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.555752  normal  0.0162787 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4748  ABC transporter related  52.81 
 
 		 611 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1362  ABC transporter related  54.72 
 
 		 617 aa  595  1e-168  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4750  ABC transporter related  53.65 
 
 		 611 aa  586  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0785549  normal  0.275934 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2343  ABC transporter related  47.54 
 
 		 591 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  0.0107518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11970  ABC transporter, transmembrane permease and ATP binding components  45.26 
 
 		 599 aa  500  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  44.74 
 
 		 587 aa  489  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0085  ABC transporter related  45.76 
 
 		 604 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  35.3 
 
 		 603 aa  385  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  34.97 
 
 		 603 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2163  hypothetical protein  34.62 
 
 		 610 aa  376  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2190  hypothetical protein  34.63 
 
 		 610 aa  371  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  35.56 
 
 		 633 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0054  hypothetical protein  34.72 
 
 		 597 aa  347  5e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2928  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  39.54 
 
 		 617 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2245  ABC transporter, transmembrane region  39.46 
 
 		 619 aa  329  9e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20584  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0067  hypothetical protein  34.08 
 
 		 599 aa  325  1e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3071  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.64 
 
 		 619 aa  325  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0688673  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1408  hypothetical protein  34.26 
 
 		 594 aa  324  3e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1585  hypothetical protein  34.08 
 
 		 593 aa  319  1e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2080  hypothetical protein  37.34 
 
 		 598 aa  318  1e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.46 
 
 		 595 aa  317  3e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3203  ABC transporter related  39.34 
 
 		 617 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2131  ABC transporter related  39.34 
 
 		 617 aa  317  5e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2628  ABC transporter ATP-binding protein  36.87 
 
 		 658 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0860  ABC transporter related  38.38 
 
 		 621 aa  315  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000519067  hitchhiker  0.000174676 
 
 
-
 
NC_002978  WD0616  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  35.81 
 
 		 591 aa  313  3.9999999999999997e-84  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.146496  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2091  hypothetical protein  36.76 
 
 		 598 aa  313  5.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2169  ABC transporter related  38.76 
 
 		 617 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3410  ABC transporter related  34.6 
 
 		 638 aa  311  2.9999999999999997e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.05 
 
 		 598 aa  310  5e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0126222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2811  ABC transporter related  36.29 
 
 		 595 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.882155 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2821  ABC transporter related  37.91 
 
 		 609 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0644  ABC transporter related  40.16 
 
 		 646 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.601366 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2905  ABC transporter-related protein  37.94 
 
 		 609 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564374  normal  0.291067 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3213  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.23 
 
 		 619 aa  306  9.000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0739  ABC transporter related  38.4 
 
 		 613 aa  305  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.327273  normal  0.0543304 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0591  ABC transporter related  34.96 
 
 		 613 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0415751  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2930  ABC transporter related  35.81 
 
 		 581 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2498  ABC transporter related  37.91 
 
 		 609 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.896627  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1260  hypothetical protein  32.33 
 
 		 582 aa  303  6.000000000000001e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.678722 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1451  ABC transporter-related protein  36.95 
 
 		 609 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.296009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0462  ABC transporter related  39.59 
 
 		 621 aa  303  8.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0665  ABC transporter related  39.59 
 
 		 646 aa  303  8.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.308501 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2206  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  37.86 
 
 		 612 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0526  TonB-dependent receptor  37.55 
 
 		 608 aa  302  9e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0677  ABC transporter related  39.59 
 
 		 618 aa  302  9e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.0281361 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0907  ABC transporter related  35.99 
 
 		 610 aa  303  9e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.657123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0108  ABC transporter related  35.88 
 
 		 636 aa  302  1e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.366198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0836  ABC transporter related  35.99 
 
 		 610 aa  302  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181434  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1441  ABC transporter related  37.78 
 
 		 618 aa  302  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73054 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4566  ABC transporter related  34.58 
 
 		 620 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3727  ABC transporter related  34.58 
 
 		 620 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal  0.56235 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3797  ABC transporter related  34.58 
 
 		 620 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  normal  0.145878 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3128  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  37.7 
 
 		 609 aa  301  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0242  ABC transporter, ATP-binding protein  36.88 
 
 		 706 aa  301  2e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1419  ABC transporter related  38.11 
 
 		 609 aa  301  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00302849  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1366  ABC transporter related  38.11 
 
 		 609 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00434177  normal  0.0240824 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1431  ABC transporter related  38.11 
 
 		 609 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0505297  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1204  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  38.67 
 
 		 614 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494984  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2713  ABC transporter related  37.01 
 
 		 609 aa  300  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00697822  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0198  ABC transporter  36.79 
 
 		 572 aa  300  4e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4941  ABC transporter related  34.37 
 
 		 604 aa  300  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.690923  normal  0.361162 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0276  ABC transporter related  36.33 
 
 		 601 aa  300  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4845  ABC transporter related  34.31 
 
 		 599 aa  300  5e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  34.16 
 
 		 597 aa  300  5e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2865  ABC transporter related  38.67 
 
 		 614 aa  300  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.148905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0083  ABC transporter related  38.46 
 
 		 619 aa  300  5e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0356  ABC transporter related  33.57 
 
 		 596 aa  300  7e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7674  ABC efflux pump, ATPase subunit  38.17 
 
 		 617 aa  299  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22456  normal  0.131905 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0731  hypothetical protein  30.24 
 
 		 582 aa  299  7e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>