More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1408 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006365  plpp0067  hypothetical protein  91.71 
 
 
599 aa  1125    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1585  hypothetical protein  97.97 
 
 
593 aa  1183    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1408  hypothetical protein  100 
 
 
594 aa  1213    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  42.09 
 
 
603 aa  486  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  42.26 
 
 
603 aa  486  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0957  hypothetical protein  40.96 
 
 
593 aa  430  1e-119  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2190  hypothetical protein  40.5 
 
 
610 aa  426  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2163  hypothetical protein  40.34 
 
 
610 aa  427  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1260  hypothetical protein  41.09 
 
 
582 aa  422  1e-117  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.678722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  39.26 
 
 
633 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_002978  WD0616  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  39.86 
 
 
591 aa  405  1.0000000000000001e-112  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.146496  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0054  hypothetical protein  39.63 
 
 
597 aa  407  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7080  ABC transporter related  39.43 
 
 
621 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.161763  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3046  ABC transporter related  35.96 
 
 
618 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.752635 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001027  ABC transporter ATP-binding protein  36.7 
 
 
616 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1768  ABC transporter related  40.48 
 
 
622 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0731  hypothetical protein  38.43 
 
 
582 aa  370  1e-101  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00688  multidrug resistance ABC transporter ATP-binding and permease protein  40.67 
 
 
613 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0450616  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2185  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.64 
 
 
617 aa  366  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1451  ABC transporter-related protein  40.7 
 
 
609 aa  368  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.296009  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6225  ABC transporter related  37.71 
 
 
624 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0462  ABC transporter related  37.94 
 
 
621 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482953  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3213  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.37 
 
 
619 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2516  ABC transporter-related protein  38.32 
 
 
610 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584837  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0591  ABC transporter related  38.35 
 
 
613 aa  368  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0415751  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1457  ABC transporter related  37.7 
 
 
609 aa  364  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.162011  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2782  ABC transporter related  35.1 
 
 
618 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.292223 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07111  hypothetical protein  39.72 
 
 
612 aa  363  3e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0674  hypothetical protein  37.33 
 
 
581 aa  363  4e-99  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1898  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  41.48 
 
 
610 aa  363  4e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0761429  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2928  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  36.84 
 
 
617 aa  362  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398164  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0644  ABC transporter related  38.15 
 
 
646 aa  362  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.601366 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22440  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  41.68 
 
 
610 aa  362  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000108745 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0671  ABC-type multidrug efflux pump, ATP-binding component  34.96 
 
 
607 aa  360  3e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123836  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0942  ABC transporter related  36.78 
 
 
622 aa  360  3e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0677  ABC transporter related  42.66 
 
 
618 aa  360  6e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.0281361 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2245  ABC transporter, transmembrane region  40.85 
 
 
619 aa  359  8e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20584  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0665  ABC transporter related  42.66 
 
 
646 aa  359  8e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.308501 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0242  ABC transporter, ATP-binding protein  39.53 
 
 
706 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2905  ABC transporter-related protein  36.56 
 
 
609 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564374  normal  0.291067 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1431  ABC transporter related  36.32 
 
 
609 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0505297  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1621  ABC transporter related  40.4 
 
 
618 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0907741  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1742  ABC transporter related  36.18 
 
 
609 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.394506 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2532  ABC transporter related  34.4 
 
 
609 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00690658  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3836  ABC transporter related  40.24 
 
 
610 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.643944 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2713  ABC transporter related  35.82 
 
 
609 aa  355  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00697822  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4091  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.28 
 
 
610 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0803284  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3203  ABC transporter related  35.79 
 
 
617 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3071  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.91 
 
 
619 aa  352  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0688673  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2135  ABC transporter-related protein  39.12 
 
 
630 aa  352  1e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180328 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0836  ABC transporter related  40.48 
 
 
610 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181434  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3410  ABC transporter related  34.97 
 
 
638 aa  352  1e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2579  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  39.33 
 
 
611 aa  352  1e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000689381  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0526  TonB-dependent receptor  34.88 
 
 
608 aa  351  2e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1366  ABC transporter related  35.49 
 
 
609 aa  351  2e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00434177  normal  0.0240824 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1427  ABC transporter-like  40.85 
 
 
610 aa  350  3e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.582294  normal  0.104251 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2892  ABC transporter related  38.66 
 
 
612 aa  350  4e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1204  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  35.67 
 
 
614 aa  350  5e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494984  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4049  ABC transporter related  39.63 
 
 
610 aa  350  5e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0907  ABC transporter related  40.08 
 
 
610 aa  350  6e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.657123  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2865  ABC transporter related  35.94 
 
 
614 aa  349  8e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.148905  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4542  ABC transporter permease/ATP-binding protein  39.84 
 
 
610 aa  349  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1348  ABC transporter related  39.84 
 
 
610 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416951  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1419  ABC transporter related  35.32 
 
 
609 aa  348  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00302849  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2173  ABC transporter related  35.67 
 
 
616 aa  348  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2821  ABC transporter related  35.26 
 
 
609 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001285  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  34.8 
 
 
603 aa  348  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000363731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3827  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  39.88 
 
 
610 aa  348  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284147  normal  0.0157718 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0691  ABC transporter ATP-binding protein  36.18 
 
 
609 aa  348  2e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3490  ATPase  35.18 
 
 
614 aa  347  4e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0739  ABC transporter related  38.24 
 
 
613 aa  347  4e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.327273  normal  0.0543304 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1588  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.03 
 
 
612 aa  347  5e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1307  ABC transporter related  36.92 
 
 
611 aa  346  7e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.556896 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2498  ABC transporter related  35.09 
 
 
609 aa  346  8e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.896627  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.48 
 
 
595 aa  346  8e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2780  ABC transporter related  39.47 
 
 
637 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1494  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.04 
 
 
630 aa  345  1e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.283216  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2628  ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 
658 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  35.37 
 
 
663 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2131  ABC transporter related  35.45 
 
 
617 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2642  ABC transporter related  35.26 
 
 
614 aa  343  4e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.988853  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0860  ABC transporter related  37.52 
 
 
621 aa  343  4e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000519067  hitchhiker  0.000174676 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  35.19 
 
 
636 aa  343  5e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3044  ABC transporter related  39.47 
 
 
637 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.989361  normal  0.444628 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.34 
 
 
621 aa  343  7e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1542  ABC transporter related  39.92 
 
 
621 aa  342  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264596  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1740  ABC transporter related  36.1 
 
 
609 aa  342  1e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0539083  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2169  ABC transporter related  39.1 
 
 
617 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  35.36 
 
 
623 aa  342  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1666  ABC transporter related  38.43 
 
 
613 aa  342  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.66549  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1493  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.38 
 
 
621 aa  341  2e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.246296  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  34.84 
 
 
643 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1135  ABC transporter related  35.19 
 
 
637 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1159  ABC transporter related  35.19 
 
 
637 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4271  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  34.66 
 
 
637 aa  339  7e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611516  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2146  ABC transporter related  35.12 
 
 
609 aa  339  7e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31543  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3611  ABC transporter related  39.55 
 
 
626 aa  338  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1622  ABC transporter related  39.05 
 
 
621 aa  338  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327918  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1441  ABC transporter related  38.72 
 
 
618 aa  339  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.73054 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2840  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.86 
 
 
621 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>