More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1135 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6620  ABC transporter related  59.9 
 
 		 587 aa  695    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00971242  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2753  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  89.92 
 
 		 621 aa  1048    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0567  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  90.23 
 
 		 589 aa  988    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  87.06 
 
 		 630 aa  1041    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0327  ABC transporter, transmembrane region  59.93 
 
 		 587 aa  689    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2871  ABC transporter ATP binding protein  89.92 
 
 		 621 aa  1048    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3443  ABC transporter related  57.19 
 
 		 588 aa  675    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2840  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  89.92 
 
 		 621 aa  1048    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4271  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  96.86 
 
 		 637 aa  1211    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7369  ABC transporter related  59.72 
 
 		 587 aa  697    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0594477  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3122  ABC transporter related  57.19 
 
 		 588 aa  675    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1764  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  89.92 
 
 		 621 aa  1048    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  89.29 
 
 		 621 aa  1080    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3319  ABC transporter related  57.19 
 
 		 588 aa  676    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.338254 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3210  ABC transporter related  60.28 
 
 		 587 aa  663    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.461099  normal  0.871675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2782  putative fused ATP-binding/permease protein  59.83 
 
 		 587 aa  717    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.896144  normal  0.282624 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  85.69 
 
 		 623 aa  1030    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4748  ABC transporter related  59.86 
 
 		 611 aa  715    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3528  ABC transporter related  58.35 
 
 		 589 aa  704    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1142  ABC transporter related  59.14 
 
 		 585 aa  671    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0417  ABC transporter related  60.62 
 
 		 587 aa  712    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2441  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  89.92 
 
 		 621 aa  1048    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  96.7 
 
 		 663 aa  1223    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0505  ABC transporter related  54.4 
 
 		 599 aa  646    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.555752  normal  0.0162787 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0680  ABC transporter related  99.69 
 
 		 637 aa  1282    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1135  ABC transporter related  100 
 
 		 637 aa  1289    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4750  ABC transporter related  62.87 
 
 		 611 aa  689    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0785549  normal  0.275934 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2813  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  89.92 
 
 		 621 aa  1048    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  84.35 
 
 		 643 aa  1045    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2146  ABC transporter related  95.08 
 
 		 609 aa  1127    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31543  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  96.55 
 
 		 636 aa  1222    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1159  ABC transporter related  99.84 
 
 		 637 aa  1285    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1362  ABC transporter related  55.24 
 
 		 617 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2343  ABC transporter related  44.59 
 
 		 591 aa  542  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  0.0107518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11970  ABC transporter, transmembrane permease and ATP binding components  45.24 
 
 		 599 aa  531  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  44.08 
 
 		 587 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0085  ABC transporter related  44.66 
 
 		 604 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  34.73 
 
 		 603 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  34.73 
 
 		 603 aa  368  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  37.04 
 
 		 633 aa  364  3e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1585  hypothetical protein  35.38 
 
 		 593 aa  350  6e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2163  hypothetical protein  34.21 
 
 		 610 aa  348  1e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1408  hypothetical protein  35.19 
 
 		 594 aa  347  4e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2190  hypothetical protein  34.21 
 
 		 610 aa  344  4e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3404  ABC transporter related  38.34 
 
 		 600 aa  342  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00337035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.29 
 
 		 595 aa  340  4e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4845  ABC transporter related  38.82 
 
 		 599 aa  333  4e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0067  hypothetical protein  33.84 
 
 		 599 aa  333  5e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6143  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.67 
 
 		 603 aa  330  4e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0083  ABC transporter related  39.92 
 
 		 619 aa  328  1.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2185  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.58 
 
 		 617 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0276  ABC transporter related  37.91 
 
 		 601 aa  326  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0515  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  37.67 
 
 		 663 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3410  ABC transporter related  37.15 
 
 		 638 aa  325  2e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3491  ATPase  40.45 
 
 		 614 aa  324  3e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2928  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  38.06 
 
 		 617 aa  324  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2524  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.22 
 
 		 669 aa  323  6e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265455  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1441  ABC transporter related  37.83 
 
 		 618 aa  323  7e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73054 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6225  ABC transporter related  37.82 
 
 		 624 aa  323  8e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2811  ABC transporter related  37.02 
 
 		 595 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.882155 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2665  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  37.22 
 
 		 669 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0953  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  37.22 
 
 		 669 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3611  ABC transporter related  39.68 
 
 		 626 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0739  ABC transporter related  39.11 
 
 		 613 aa  322  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.327273  normal  0.0543304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7080  ABC transporter related  37.69 
 
 		 621 aa  321  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.161763  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0233  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  37.05 
 
 		 669 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2169  ABC transporter related  38.31 
 
 		 617 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1416  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.05 
 
 		 669 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0270  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.05 
 
 		 669 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1612  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  37.05 
 
 		 669 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.658136  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2245  ABC transporter, transmembrane region  37.77 
 
 		 619 aa  320  6e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3687  ABC transporter related  37.24 
 
 		 620 aa  320  6e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2080  hypothetical protein  35.02 
 
 		 598 aa  319  1e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7111  ABC transporter related  35.52 
 
 		 596 aa  319  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483113  normal  0.228237 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6620  ABC transporter related  38.1 
 
 		 617 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.349027  normal  0.153247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6186  multidrug ABC transporter ATPase/permease  35.64 
 
 		 605 aa  317  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159052  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5523  ABC transporter related  37.07 
 
 		 620 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.08 
 
 		 598 aa  317  4e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0126222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0860  ABC transporter related  36.36 
 
 		 621 aa  317  5e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000519067  hitchhiker  0.000174676 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3071  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.03 
 
 		 619 aa  317  6e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0688673  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6140  ABC transporter related  38.02 
 
 		 617 aa  316  7e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5775  ABC transporter related  38.02 
 
 		 617 aa  316  7e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.832359  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0671  ABC-type multidrug efflux pump, ATP-binding component  36.94 
 
 		 607 aa  316  7e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123836  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3039  ABC transporter related  38.97 
 
 		 595 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4939  ABC transporter related  36.7 
 
 		 626 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.777528 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3213  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.12 
 
 		 619 aa  315  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3233  ABC transporter related  39.63 
 
 		 599 aa  315  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2905  ABC transporter-related protein  37.6 
 
 		 609 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564374  normal  0.291067 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2135  ABC transporter-related protein  36 
 
 		 630 aa  314  2.9999999999999996e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180328 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0836  ABC transporter related  36.97 
 
 		 610 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181434  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0054  hypothetical protein  32.44 
 
 		 597 aa  314  3.9999999999999997e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3203  ABC transporter related  38.59 
 
 		 617 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2299  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  35.76 
 
 		 620 aa  313  9e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3727  ABC transporter related  35.92 
 
 		 620 aa  313  9e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal  0.56235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4566  ABC transporter related  35.92 
 
 		 620 aa  313  9e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3797  ABC transporter related  35.92 
 
 		 620 aa  313  9e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  normal  0.145878 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2628  ABC transporter ATP-binding protein  38.68 
 
 		 658 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2091  hypothetical protein  34.24 
 
 		 598 aa  312  1e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2131  ABC transporter related  38.68 
 
 		 617 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0591  ABC transporter related  35.42 
 
 		 593 aa  311  2e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179629 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>