More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4748 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1135  ABC transporter related  59.86 
 
 		 637 aa  678    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2813  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  60.07 
 
 		 621 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0567  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  60.39 
 
 		 589 aa  653    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  57.84 
 
 		 630 aa  678    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2871  ABC transporter ATP binding protein  60.07 
 
 		 621 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4271  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  59.86 
 
 		 637 aa  680    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  59.86 
 
 		 663 aa  698    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4750  ABC transporter related  62.63 
 
 		 611 aa  696    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0785549  normal  0.275934 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  60.07 
 
 		 621 aa  694    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  59.69 
 
 		 636 aa  697    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4748  ABC transporter related  100 
 
 		 611 aa  1220    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2840  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  60.07 
 
 		 621 aa  672    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  59.02 
 
 		 623 aa  682    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2753  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  60.07 
 
 		 621 aa  672    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1764  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  60.07 
 
 		 621 aa  672    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1159  ABC transporter related  59.86 
 
 		 637 aa  678    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0680  ABC transporter related  59.69 
 
 		 637 aa  675    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2146  ABC transporter related  58.67 
 
 		 609 aa  663    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31543  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2441  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  60.07 
 
 		 621 aa  672    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  58.52 
 
 		 643 aa  684    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2782  putative fused ATP-binding/permease protein  52.98 
 
 		 587 aa  627  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.896144  normal  0.282624 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0417  ABC transporter related  52.64 
 
 		 587 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0327  ABC transporter, transmembrane region  52.81 
 
 		 587 aa  600  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3210  ABC transporter related  54.37 
 
 		 587 aa  591  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.461099  normal  0.871675 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1142  ABC transporter related  52.82 
 
 		 585 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3528  ABC transporter related  50.86 
 
 		 589 aa  581  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6620  ABC transporter related  51.46 
 
 		 587 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00971242  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3122  ABC transporter related  50.34 
 
 		 588 aa  569  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7369  ABC transporter related  51.11 
 
 		 587 aa  571  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0594477  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3443  ABC transporter related  50.34 
 
 		 588 aa  569  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0505  ABC transporter related  51.9 
 
 		 599 aa  567  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.555752  normal  0.0162787 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3319  ABC transporter related  48.97 
 
 		 588 aa  560  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.338254 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1362  ABC transporter related  51.9 
 
 		 617 aa  550  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2343  ABC transporter related  44.5 
 
 		 591 aa  480  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  0.0107518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11970  ABC transporter, transmembrane permease and ATP binding components  45.74 
 
 		 599 aa  474  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  42.91 
 
 		 587 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0085  ABC transporter related  43.41 
 
 		 604 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2163  hypothetical protein  34.74 
 
 		 610 aa  343  4e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2190  hypothetical protein  34.56 
 
 		 610 aa  339  9.999999999999999e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  32.76 
 
 		 603 aa  338  1.9999999999999998e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  33.39 
 
 		 603 aa  336  5.999999999999999e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3404  ABC transporter related  36.44 
 
 		 600 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00337035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4845  ABC transporter related  36.82 
 
 		 599 aa  307  4.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  31.83 
 
 		 633 aa  303  7.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0739  ABC transporter related  40.52 
 
 		 613 aa  300  5e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.327273  normal  0.0543304 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3410  ABC transporter related  34.03 
 
 		 638 aa  298  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0067  hypothetical protein  32.11 
 
 		 599 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0731  hypothetical protein  32.75 
 
 		 582 aa  299  1e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2182  ABC transporter related  34.62 
 
 		 600 aa  297  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1585  hypothetical protein  32.11 
 
 		 593 aa  295  2e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0276  ABC transporter related  35.83 
 
 		 601 aa  295  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1408  hypothetical protein  31.93 
 
 		 594 aa  293  5e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1441  ABC transporter related  37.61 
 
 		 618 aa  291  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73054 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2811  ABC transporter related  36.6 
 
 		 595 aa  291  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.882155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2185  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.9 
 
 		 617 aa  289  8e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3491  ATPase  41.16 
 
 		 614 aa  289  1e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0198  ABC transporter  36.92 
 
 		 572 aa  288  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0332  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.12 
 
 		 586 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1307  ABC transporter related  36.5 
 
 		 611 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.556896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3039  ABC transporter related  38.03 
 
 		 595 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0712  ABC transporter related  34.2 
 
 		 596 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0247864  normal  0.335635 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0994  ABC transporter related  35.84 
 
 		 652 aa  283  5.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0836  ABC transporter related  36.23 
 
 		 610 aa  283  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181434  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1674  ABC transporter related  34.91 
 
 		 610 aa  283  7.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6186  multidrug ABC transporter ATPase/permease  34.85 
 
 		 605 aa  282  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159052  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2930  ABC transporter related  37.05 
 
 		 581 aa  282  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0515  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  34.51 
 
 		 663 aa  281  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  35.54 
 
 		 594 aa  281  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3213  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.87 
 
 		 619 aa  281  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1512  ABC transporter related  35.66 
 
 		 611 aa  281  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00861332  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0907  ABC transporter related  36.03 
 
 		 610 aa  280  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.657123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6225  ABC transporter related  38.71 
 
 		 624 aa  280  7e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.45 
 
 		 595 aa  279  1e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4941  ABC transporter related  37.45 
 
 		 604 aa  279  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.690923  normal  0.361162 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  32.56 
 
 		 598 aa  278  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0054  hypothetical protein  31.56 
 
 		 597 aa  278  2e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2928  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  35.1 
 
 		 617 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0083  ABC transporter related  37.19 
 
 		 619 aa  278  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6143  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.06 
 
 		 603 aa  277  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2905  ABC transporter-related protein  34.99 
 
 		 609 aa  277  4e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564374  normal  0.291067 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2642  ABC transporter related  36.6 
 
 		 614 aa  277  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.988853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3418  ABC transporter related  37.5 
 
 		 595 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  normal  0.0149825 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7111  ABC transporter related  35.23 
 
 		 596 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483113  normal  0.228237 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2524  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.05 
 
 		 669 aa  275  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265455  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2665  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  40.05 
 
 		 669 aa  273  6e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4049  ABC transporter related  34.97 
 
 		 610 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0953  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  40.05 
 
 		 669 aa  273  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.36 
 
 		 598 aa  273  8.000000000000001e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0126222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1612  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  39.79 
 
 		 669 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.658136  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0233  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  39.79 
 
 		 669 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2080  hypothetical protein  33.27 
 
 		 598 aa  273  1e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0270  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.79 
 
 		 669 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  35.45 
 
 		 606 aa  272  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1416  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.79 
 
 		 669 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0860  ABC transporter related  31.4 
 
 		 621 aa  272  1e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000519067  hitchhiker  0.000174676 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2169  ABC transporter related  35.16 
 
 		 617 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2893  ABC transporter related  36.5 
 
 		 614 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5858  ABC transporter related  39.73 
 
 		 591 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2875  ABC transporter related  34.69 
 
 		 625 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216771  normal  0.111784 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3071  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.18 
 
 		 619 aa  270  8e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0688673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>