More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4750 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4748  ABC transporter related  61.95 
 
 		 611 aa  736    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0567  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  62.92 
 
 		 589 aa  676    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2871  ABC transporter ATP binding protein  61.47 
 
 		 621 aa  688    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4750  ABC transporter related  100 
 
 		 611 aa  1225    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0785549  normal  0.275934 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4271  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  61.32 
 
 		 637 aa  690    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1764  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.47 
 
 		 621 aa  688    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.62 
 
 		 621 aa  717    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  59.63 
 
 		 630 aa  690    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  61.99 
 
 		 623 aa  707    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2441  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.47 
 
 		 621 aa  688    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2840  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.47 
 
 		 621 aa  688    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  61.82 
 
 		 643 aa  704    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0680  ABC transporter related  62.33 
 
 		 637 aa  691    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1135  ABC transporter related  62.5 
 
 		 637 aa  693    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2813  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.47 
 
 		 621 aa  688    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  61.76 
 
 		 663 aa  715    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2753  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.47 
 
 		 621 aa  688    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  61.76 
 
 		 636 aa  715    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1159  ABC transporter related  62.5 
 
 		 637 aa  693    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2146  ABC transporter related  61.64 
 
 		 609 aa  685    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31543  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0417  ABC transporter related  54.23 
 
 		 587 aa  634  1e-180  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2782  putative fused ATP-binding/permease protein  54.06 
 
 		 587 aa  627  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.896144  normal  0.282624 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3528  ABC transporter related  53.55 
 
 		 589 aa  618  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6620  ABC transporter related  55.19 
 
 		 587 aa  617  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00971242  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0327  ABC transporter, transmembrane region  53.71 
 
 		 587 aa  608  1e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7369  ABC transporter related  54.5 
 
 		 587 aa  610  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0594477  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3210  ABC transporter related  56.51 
 
 		 587 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.461099  normal  0.871675 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3443  ABC transporter related  53.73 
 
 		 588 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3122  ABC transporter related  53.73 
 
 		 588 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3319  ABC transporter related  53.21 
 
 		 588 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.338254 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1142  ABC transporter related  54.92 
 
 		 585 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0505  ABC transporter related  50.87 
 
 		 599 aa  566  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.555752  normal  0.0162787 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1362  ABC transporter related  51.92 
 
 		 617 aa  545  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11970  ABC transporter, transmembrane permease and ATP binding components  44.58 
 
 		 599 aa  494  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2343  ABC transporter related  42.91 
 
 		 591 aa  484  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  0.0107518 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  42.48 
 
 		 587 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0085  ABC transporter related  44.29 
 
 		 604 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  31.6 
 
 		 603 aa  331  3e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  31.43 
 
 		 603 aa  329  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  33 
 
 		 633 aa  320  3e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2163  hypothetical protein  31.99 
 
 		 610 aa  320  7e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2190  hypothetical protein  32.16 
 
 		 610 aa  315  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1585  hypothetical protein  34.44 
 
 		 593 aa  311  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0067  hypothetical protein  33.22 
 
 		 599 aa  310  4e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3410  ABC transporter related  35.83 
 
 		 638 aa  310  6.999999999999999e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2169  ABC transporter related  41.31 
 
 		 617 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2928  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  40.51 
 
 		 617 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398164  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3071  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.3 
 
 		 619 aa  306  6e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0688673  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1408  hypothetical protein  32.75 
 
 		 594 aa  304  4.0000000000000003e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2245  ABC transporter, transmembrane region  40.3 
 
 		 619 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0731  hypothetical protein  33.1 
 
 		 582 aa  300  5e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2080  hypothetical protein  33.14 
 
 		 598 aa  300  7e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.59 
 
 		 598 aa  299  9e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1441  ABC transporter related  37.61 
 
 		 618 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73054 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1260  hypothetical protein  30.88 
 
 		 582 aa  295  2e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.678722 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0739  ABC transporter related  39.24 
 
 		 613 aa  294  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.327273  normal  0.0543304 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2091  hypothetical protein  32.63 
 
 		 598 aa  293  5e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3404  ABC transporter related  36.88 
 
 		 600 aa  293  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00337035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0942  ABC transporter related  35.73 
 
 		 622 aa  289  9e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.06 
 
 		 598 aa  289  1e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0126222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4845  ABC transporter related  34.05 
 
 		 599 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2516  ABC transporter-related protein  34.21 
 
 		 610 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6143  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.58 
 
 		 603 aa  287  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2131  ABC transporter related  39.92 
 
 		 617 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.27 
 
 		 595 aa  285  2.0000000000000002e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2628  ABC transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 		 658 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.58 
 
 		 641 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  35.7 
 
 		 606 aa  283  6.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0860  ABC transporter related  36.27 
 
 		 621 aa  282  1e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000519067  hitchhiker  0.000174676 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2936  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.72 
 
 		 593 aa  282  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7111  ABC transporter related  33.64 
 
 		 596 aa  282  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483113  normal  0.228237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3203  ABC transporter related  39.5 
 
 		 617 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1307  ABC transporter related  35.71 
 
 		 611 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.556896 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  37.17 
 
 		 594 aa  281  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2811  ABC transporter related  35.83 
 
 		 595 aa  280  4e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.882155 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0836  ABC transporter related  37.65 
 
 		 610 aa  280  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181434  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5775  ABC transporter related  38.62 
 
 		 617 aa  280  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.832359  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6140  ABC transporter related  38.62 
 
 		 617 aa  280  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0907  ABC transporter related  37.45 
 
 		 610 aa  279  9e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.657123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6620  ABC transporter related  38.2 
 
 		 617 aa  279  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.349027  normal  0.153247 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0975  ABC transporter related  41.13 
 
 		 626 aa  279  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2185  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.43 
 
 		 617 aa  279  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1588  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.12 
 
 		 612 aa  278  1e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.16 
 
 		 639 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3213  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.64 
 
 		 619 aa  278  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2182  ABC transporter related  34.94 
 
 		 600 aa  277  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3233  ABC transporter related  37.58 
 
 		 599 aa  276  6e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494492  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0054  hypothetical protein  31.73 
 
 		 597 aa  276  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0332  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.21 
 
 		 586 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.01 
 
 		 608 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4878  response regulator receiver protein  36.15 
 
 		 991 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.360645  normal  0.0233171 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3801  response regulator receiver protein  36.15 
 
 		 981 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  34.54 
 
 		 606 aa  276  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2905  ABC transporter-related protein  36.51 
 
 		 609 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564374  normal  0.291067 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1666  ABC transporter related  38.72 
 
 		 613 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.66549  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2135  ABC transporter-related protein  45.61 
 
 		 630 aa  275  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180328 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07111  hypothetical protein  36.66 
 
 		 612 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0276  ABC transporter related  33.64 
 
 		 601 aa  275  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1898  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  34.04 
 
 		 610 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0761429  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7674  ABC efflux pump, ATPase subunit  38.28 
 
 		 617 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22456  normal  0.131905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>