More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6620 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_2146  ABC transporter related  60.07 
 
 		 609 aa  669    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31543  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3122  ABC transporter related  77.55 
 
 		 588 aa  955    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1764  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.46 
 
 		 621 aa  681    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0567  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.74 
 
 		 589 aa  662    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0327  ABC transporter, transmembrane region  66.67 
 
 		 587 aa  781    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2871  ABC transporter ATP binding protein  61.46 
 
 		 621 aa  681    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3319  ABC transporter related  77.72 
 
 		 588 aa  959    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.338254 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7369  ABC transporter related  94.72 
 
 		 587 aa  1112    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0594477  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4271  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  59.72 
 
 		 637 aa  666    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  59.93 
 
 		 643 aa  692    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2441  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.46 
 
 		 621 aa  681    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3443  ABC transporter related  77.55 
 
 		 588 aa  955    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3528  ABC transporter related  77.25 
 
 		 589 aa  939    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.11 
 
 		 621 aa  697    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2753  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.46 
 
 		 621 aa  681    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  60.42 
 
 		 663 aa  694    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2813  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.46 
 
 		 621 aa  681    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3210  ABC transporter related  66.16 
 
 		 587 aa  754    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.461099  normal  0.871675 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  60.69 
 
 		 623 aa  701    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6620  ABC transporter related  100 
 
 		 587 aa  1186    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00971242  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1142  ABC transporter related  63.71 
 
 		 585 aa  741    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1159  ABC transporter related  59.9 
 
 		 637 aa  668    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0417  ABC transporter related  66.33 
 
 		 587 aa  797    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0680  ABC transporter related  59.72 
 
 		 637 aa  665    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2782  putative fused ATP-binding/permease protein  67.18 
 
 		 587 aa  822    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.896144  normal  0.282624 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2840  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.46 
 
 		 621 aa  681    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  60.07 
 
 		 630 aa  692    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1135  ABC transporter related  59.9 
 
 		 637 aa  668    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  60.24 
 
 		 636 aa  693    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0505  ABC transporter related  52.29 
 
 		 599 aa  592  1e-168  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.555752  normal  0.0162787 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1362  ABC transporter related  53.79 
 
 		 617 aa  594  1e-168  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4750  ABC transporter related  55.3 
 
 		 611 aa  585  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0785549  normal  0.275934 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4748  ABC transporter related  51.46 
 
 		 611 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2343  ABC transporter related  49.65 
 
 		 591 aa  534  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  0.0107518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11970  ABC transporter, transmembrane permease and ATP binding components  47.27 
 
 		 599 aa  503  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  44.14 
 
 		 587 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0085  ABC transporter related  44.29 
 
 		 604 aa  430  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  35.37 
 
 		 603 aa  378  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  34.69 
 
 		 603 aa  376  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2163  hypothetical protein  35.53 
 
 		 610 aa  360  6e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  35.44 
 
 		 633 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2190  hypothetical protein  35.36 
 
 		 610 aa  354  2e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0054  hypothetical protein  35.53 
 
 		 597 aa  339  9e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1408  hypothetical protein  38.86 
 
 		 594 aa  338  1.9999999999999998e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0731  hypothetical protein  35.15 
 
 		 582 aa  333  4e-90  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0860  ABC transporter related  38.74 
 
 		 621 aa  333  7.000000000000001e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000519067  hitchhiker  0.000174676 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1585  hypothetical protein  38.86 
 
 		 593 aa  332  9e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1621  ABC transporter related  40.32 
 
 		 618 aa  332  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0907741  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2245  ABC transporter, transmembrane region  36.22 
 
 		 619 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20584  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0067  hypothetical protein  37.71 
 
 		 599 aa  328  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3071  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.03 
 
 		 619 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0688673  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2928  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  38.28 
 
 		 617 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3213  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.67 
 
 		 619 aa  325  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1441  ABC transporter related  37.55 
 
 		 618 aa  324  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73054 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0671  ABC-type multidrug efflux pump, ATP-binding component  34.58 
 
 		 607 aa  323  5e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123836  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2173  ABC transporter related  40.85 
 
 		 616 aa  323  7e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0242  ABC transporter, ATP-binding protein  38.77 
 
 		 706 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2892  ABC transporter related  36.92 
 
 		 612 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.04 
 
 		 595 aa  320  3.9999999999999996e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1457  ABC transporter related  37.78 
 
 		 609 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.162011  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2713  ABC transporter related  35.02 
 
 		 609 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00697822  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.42 
 
 		 598 aa  319  1e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0126222  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2080  hypothetical protein  37.47 
 
 		 598 aa  317  3e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3490  ATPase  37.31 
 
 		 614 aa  317  5e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3203  ABC transporter related  38.13 
 
 		 617 aa  317  6e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2821  ABC transporter related  37.17 
 
 		 609 aa  316  6e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3410  ABC transporter related  34.9 
 
 		 638 aa  316  9e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2169  ABC transporter related  37.38 
 
 		 617 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4091  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.57 
 
 		 610 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0803284  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0836  ABC transporter related  38.07 
 
 		 610 aa  313  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181434  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3044  ABC transporter related  37.35 
 
 		 637 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.989361  normal  0.444628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2131  ABC transporter related  38.13 
 
 		 617 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001285  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  37.27 
 
 		 603 aa  312  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000363731  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2780  ABC transporter related  36.35 
 
 		 637 aa  312  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2628  ABC transporter ATP-binding protein  36.75 
 
 		 658 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1666  ABC transporter related  37.36 
 
 		 613 aa  311  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.66549  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0907  ABC transporter related  37.86 
 
 		 610 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.657123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0591  ABC transporter related  35.58 
 
 		 613 aa  311  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0415751  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1419  ABC transporter related  36.55 
 
 		 609 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00302849  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0644  ABC transporter related  38.84 
 
 		 646 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.601366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0462  ABC transporter related  35.64 
 
 		 621 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2905  ABC transporter-related protein  34.13 
 
 		 609 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564374  normal  0.291067 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1431  ABC transporter related  36.55 
 
 		 609 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0505297  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2091  hypothetical protein  36.48 
 
 		 598 aa  310  4e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1366  ABC transporter related  36.55 
 
 		 609 aa  310  4e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00434177  normal  0.0240824 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2240  ABC transporter related  36.22 
 
 		 626 aa  310  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2135  ABC transporter-related protein  36.12 
 
 		 630 aa  309  6.999999999999999e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180328 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6620  ABC transporter related  36.8 
 
 		 617 aa  309  8e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.349027  normal  0.153247 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4939  ABC transporter related  35.84 
 
 		 626 aa  309  8e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.777528 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1494  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40 
 
 		 630 aa  309  8e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.283216  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2848  ABC transporter-related protein  37.61 
 
 		 611 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.934041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6140  ABC transporter related  36.78 
 
 		 617 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001027  ABC transporter ATP-binding protein  36.57 
 
 		 616 aa  309  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5775  ABC transporter related  36.78 
 
 		 617 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.832359  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1768  ABC transporter related  38.16 
 
 		 622 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1542  ABC transporter related  39.2 
 
 		 621 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264596  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0665  ABC transporter related  38.78 
 
 		 646 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.308501 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1427  ABC transporter-like  36.87 
 
 		 610 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.582294  normal  0.104251 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1204  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  37.31 
 
 		 614 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494984  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0677  ABC transporter related  38.78 
 
 		 618 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.0281361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>