More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2782 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3443  ABC transporter related  63.84 
 
 		 588 aa  771    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2813  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  58.97 
 
 		 621 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1764  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  58.97 
 
 		 621 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3528  ABC transporter related  63.33 
 
 		 589 aa  764    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0567  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  59.38 
 
 		 589 aa  649    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3319  ABC transporter related  64.01 
 
 		 588 aa  774    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.338254 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0327  ABC transporter, transmembrane region  77.34 
 
 		 587 aa  919    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2871  ABC transporter ATP binding protein  58.97 
 
 		 621 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6620  ABC transporter related  67.18 
 
 		 587 aa  810    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00971242  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7369  ABC transporter related  67.35 
 
 		 587 aa  813    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0594477  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4271  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  59.48 
 
 		 637 aa  684    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1159  ABC transporter related  59.83 
 
 		 637 aa  683    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2441  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  58.97 
 
 		 621 aa  671    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  58.79 
 
 		 630 aa  695    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  58.97 
 
 		 621 aa  694    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  59.66 
 
 		 663 aa  704    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3210  ABC transporter related  82.45 
 
 		 587 aa  943    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.461099  normal  0.871675 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  58.97 
 
 		 623 aa  693    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1142  ABC transporter related  77.87 
 
 		 585 aa  915    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0417  ABC transporter related  78.36 
 
 		 587 aa  959    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  58.79 
 
 		 643 aa  692    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0680  ABC transporter related  59.66 
 
 		 637 aa  680    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  59.48 
 
 		 636 aa  703    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2146  ABC transporter related  59.48 
 
 		 609 aa  682    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31543  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3122  ABC transporter related  63.84 
 
 		 588 aa  771    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1135  ABC transporter related  59.83 
 
 		 637 aa  683    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2840  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  58.97 
 
 		 621 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2782  putative fused ATP-binding/permease protein  100 
 
 		 587 aa  1186    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.896144  normal  0.282624 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2753  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  58.97 
 
 		 621 aa  671    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0505  ABC transporter related  54.31 
 
 		 599 aa  629  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.555752  normal  0.0162787 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4748  ABC transporter related  52.98 
 
 		 611 aa  627  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1362  ABC transporter related  54.22 
 
 		 617 aa  590  1e-167  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4750  ABC transporter related  53.99 
 
 		 611 aa  588  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0785549  normal  0.275934 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2343  ABC transporter related  45.89 
 
 		 591 aa  500  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  0.0107518 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  46.21 
 
 		 587 aa  499  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11970  ABC transporter, transmembrane permease and ATP binding components  43.82 
 
 		 599 aa  488  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0085  ABC transporter related  45 
 
 		 604 aa  444  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  36.32 
 
 		 603 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  35.85 
 
 		 603 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2163  hypothetical protein  36.04 
 
 		 610 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2190  hypothetical protein  35.69 
 
 		 610 aa  375  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  34.68 
 
 		 633 aa  355  1e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0054  hypothetical protein  34.68 
 
 		 597 aa  346  8.999999999999999e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1408  hypothetical protein  34.22 
 
 		 594 aa  335  1e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0067  hypothetical protein  33.81 
 
 		 599 aa  332  1e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2245  ABC transporter, transmembrane region  39.38 
 
 		 619 aa  332  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20584  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1585  hypothetical protein  34.22 
 
 		 593 aa  329  9e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.72 
 
 		 595 aa  328  1.0000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2928  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  39.04 
 
 		 617 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6186  multidrug ABC transporter ATPase/permease  36.39 
 
 		 605 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159052  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3071  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.33 
 
 		 619 aa  323  4e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0688673  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.48 
 
 		 598 aa  323  4e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0126222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2182  ABC transporter related  36.1 
 
 		 600 aa  323  7e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3410  ABC transporter related  34.29 
 
 		 638 aa  322  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0462  ABC transporter related  41.22 
 
 		 621 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6143  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.76 
 
 		 603 aa  321  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3213  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.35 
 
 		 619 aa  320  6e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0677  ABC transporter related  41.36 
 
 		 618 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.0281361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0665  ABC transporter related  41.36 
 
 		 646 aa  319  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.308501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0644  ABC transporter related  41.36 
 
 		 646 aa  319  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.601366 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2524  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.05 
 
 		 669 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265455  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0957  hypothetical protein  34.92 
 
 		 593 aa  317  3e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3046  ABC transporter related  39.6 
 
 		 618 aa  317  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.752635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2169  ABC transporter related  38.46 
 
 		 617 aa  316  8e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3203  ABC transporter related  38.2 
 
 		 617 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0591  ABC transporter related  36.81 
 
 		 613 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0415751  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2173  ABC transporter related  39.54 
 
 		 616 aa  315  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0739  ABC transporter related  38.65 
 
 		 613 aa  315  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.327273  normal  0.0543304 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2665  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  44.79 
 
 		 669 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0953  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  44.79 
 
 		 669 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0198  ABC transporter  37.75 
 
 		 572 aa  315  1.9999999999999998e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0276  ABC transporter related  35.98 
 
 		 601 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2131  ABC transporter related  37.97 
 
 		 617 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1441  ABC transporter related  39.1 
 
 		 618 aa  313  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73054 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2628  ABC transporter ATP-binding protein  37.97 
 
 		 658 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0233  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  44.53 
 
 		 669 aa  312  9e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1612  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  44.53 
 
 		 669 aa  312  9e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.658136  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1416  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  44.53 
 
 		 669 aa  312  9e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0270  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  44.53 
 
 		 669 aa  312  9e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1204  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  36.95 
 
 		 614 aa  312  1e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494984  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0515  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  44.01 
 
 		 663 aa  312  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2811  ABC transporter related  36.47 
 
 		 595 aa  311  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.882155 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2865  ABC transporter related  36.82 
 
 		 614 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.148905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2905  ABC transporter-related protein  37.32 
 
 		 609 aa  311  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564374  normal  0.291067 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1260  hypothetical protein  32.8 
 
 		 582 aa  311  2.9999999999999997e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.678722 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1621  ABC transporter related  39.87 
 
 		 618 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0907741  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1768  ABC transporter related  37.82 
 
 		 622 aa  311  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3727  ABC transporter related  35.42 
 
 		 620 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal  0.56235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4566  ABC transporter related  35.42 
 
 		 620 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3797  ABC transporter related  35.42 
 
 		 620 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  normal  0.145878 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00688  multidrug resistance ABC transporter ATP-binding and permease protein  36.7 
 
 		 613 aa  310  5e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0450616  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0731  hypothetical protein  32.69 
 
 		 582 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0242  ABC transporter, ATP-binding protein  36.53 
 
 		 706 aa  309  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3827  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  36.96 
 
 		 610 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284147  normal  0.0157718 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3687  ABC transporter related  35.7 
 
 		 620 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2782  ABC transporter related  38.42 
 
 		 618 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.292223 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0860  ABC transporter related  36.96 
 
 		 621 aa  309  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000519067  hitchhiker  0.000174676 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2930  ABC transporter related  37.19 
 
 		 581 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0836  ABC transporter related  36.3 
 
 		 610 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181434  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5523  ABC transporter related  35.7 
 
 		 620 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>