More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3210 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2782  putative fused ATP-binding/permease protein  82.45 
 
 		 587 aa  988    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.896144  normal  0.282624 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6620  ABC transporter related  66.16 
 
 		 587 aa  780    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00971242  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  60.1 
 
 		 663 aa  684    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0327  ABC transporter, transmembrane region  77.51 
 
 		 587 aa  914    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  58.89 
 
 		 630 aa  676    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2871  ABC transporter ATP binding protein  59.41 
 
 		 621 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4271  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  59.45 
 
 		 637 aa  659    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2753  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  59.41 
 
 		 621 aa  654    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3319  ABC transporter related  62.65 
 
 		 588 aa  746    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.338254 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1135  ABC transporter related  60.28 
 
 		 637 aa  664    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  59.07 
 
 		 621 aa  668    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2840  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  59.41 
 
 		 621 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3210  ABC transporter related  100 
 
 		 587 aa  1176    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.461099  normal  0.871675 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  59.76 
 
 		 623 aa  679    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1159  ABC transporter related  60.28 
 
 		 637 aa  664    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1142  ABC transporter related  80.24 
 
 		 585 aa  926    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0417  ABC transporter related  79.56 
 
 		 587 aa  959    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1764  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  59.41 
 
 		 621 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3122  ABC transporter related  63.16 
 
 		 588 aa  751    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0680  ABC transporter related  60.1 
 
 		 637 aa  662    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3443  ABC transporter related  63.16 
 
 		 588 aa  751    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  59.59 
 
 		 643 aa  679    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7369  ABC transporter related  67.01 
 
 		 587 aa  786    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0594477  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2146  ABC transporter related  59.45 
 
 		 609 aa  659    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31543  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2441  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  59.41 
 
 		 621 aa  654    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2813  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  59.41 
 
 		 621 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3528  ABC transporter related  62.65 
 
 		 589 aa  736    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  59.93 
 
 		 636 aa  683    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0567  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  59.74 
 
 		 589 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4748  ABC transporter related  54.37 
 
 		 611 aa  627  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0505  ABC transporter related  53.62 
 
 		 599 aa  624  1e-177  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.555752  normal  0.0162787 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4750  ABC transporter related  56.45 
 
 		 611 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0785549  normal  0.275934 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1362  ABC transporter related  53.85 
 
 		 617 aa  581  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  46.64 
 
 		 587 aa  495  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2343  ABC transporter related  45.45 
 
 		 591 aa  491  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  0.0107518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11970  ABC transporter, transmembrane permease and ATP binding components  44.01 
 
 		 599 aa  480  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0085  ABC transporter related  45.62 
 
 		 604 aa  431  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  34.42 
 
 		 603 aa  375  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  34.25 
 
 		 603 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2163  hypothetical protein  35 
 
 		 610 aa  371  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2190  hypothetical protein  34.83 
 
 		 610 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  35.21 
 
 		 633 aa  351  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0067  hypothetical protein  32.99 
 
 		 599 aa  324  3e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0054  hypothetical protein  33.45 
 
 		 597 aa  323  5e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1585  hypothetical protein  33.45 
 
 		 593 aa  323  7e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1408  hypothetical protein  33.28 
 
 		 594 aa  318  1e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3410  ABC transporter related  35.8 
 
 		 638 aa  318  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2930  ABC transporter related  36.05 
 
 		 581 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3071  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.51 
 
 		 619 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0688673  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2928  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  38.11 
 
 		 617 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.8 
 
 		 595 aa  311  2e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2245  ABC transporter, transmembrane region  38.46 
 
 		 619 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20584  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2080  hypothetical protein  36.29 
 
 		 598 aa  308  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2811  ABC transporter related  35.47 
 
 		 595 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.882155 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2091  hypothetical protein  36.13 
 
 		 598 aa  306  9.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.76 
 
 		 598 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0126222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2131  ABC transporter related  38.72 
 
 		 617 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3039  ABC transporter related  37.8 
 
 		 595 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1260  hypothetical protein  32.68 
 
 		 582 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.678722 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1441  ABC transporter related  38.79 
 
 		 618 aa  303  9e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73054 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2628  ABC transporter ATP-binding protein  38.48 
 
 		 658 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3046  ABC transporter related  37.88 
 
 		 618 aa  302  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.752635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3418  ABC transporter related  44.33 
 
 		 595 aa  302  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  normal  0.0149825 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2169  ABC transporter related  38.25 
 
 		 617 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1204  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  36.69 
 
 		 614 aa  299  9e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494984  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2865  ABC transporter related  36.69 
 
 		 614 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.148905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2182  ABC transporter related  35.64 
 
 		 600 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4941  ABC transporter related  34.72 
 
 		 604 aa  298  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.690923  normal  0.361162 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3203  ABC transporter related  38.1 
 
 		 617 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3404  ABC transporter related  35.06 
 
 		 600 aa  297  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00337035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1463  ABC transporter related  36.89 
 
 		 597 aa  296  6e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0616  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  34.26 
 
 		 591 aa  296  7e-79  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.146496  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3213  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.27 
 
 		 619 aa  296  8e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0860  ABC transporter related  36.29 
 
 		 621 aa  293  6e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000519067  hitchhiker  0.000174676 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2782  ABC transporter related  36.86 
 
 		 618 aa  293  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.292223 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0739  ABC transporter related  37.73 
 
 		 613 aa  293  7e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.327273  normal  0.0543304 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3797  ABC transporter related  34.58 
 
 		 620 aa  293  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  normal  0.145878 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4566  ABC transporter related  34.58 
 
 		 620 aa  293  7e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3727  ABC transporter related  34.58 
 
 		 620 aa  293  7e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal  0.56235 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2524  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  42.56 
 
 		 669 aa  293  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265455  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0953  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  42.56 
 
 		 669 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3233  ABC transporter related  37.4 
 
 		 599 aa  292  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0515  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  42.3 
 
 		 663 aa  292  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2665  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  42.56 
 
 		 669 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0276  ABC transporter related  34.43 
 
 		 601 aa  292  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0731  hypothetical protein  31.75 
 
 		 582 aa  292  1e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2299  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  35.25 
 
 		 620 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4845  ABC transporter related  33.85 
 
 		 599 aa  291  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0591  ABC transporter related  36.12 
 
 		 613 aa  291  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0415751  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2905  ABC transporter-related protein  36 
 
 		 609 aa  290  3e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564374  normal  0.291067 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02200  ABC transporter, ATP-binding protein  35.13 
 
 		 577 aa  290  4e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3687  ABC transporter related  33.79 
 
 		 620 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5523  ABC transporter related  34.24 
 
 		 620 aa  290  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00688  multidrug resistance ABC transporter ATP-binding and permease protein  36.97 
 
 		 613 aa  290  6e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0450616  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7080  ABC transporter related  36.33 
 
 		 621 aa  290  7e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.161763  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2642  ABC transporter related  35.81 
 
 		 614 aa  289  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.988853  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0233  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  42.04 
 
 		 669 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0270  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  42.04 
 
 		 669 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1612  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  42.04 
 
 		 669 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.658136  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1416  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  42.04 
 
 		 669 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>