More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2299 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_7111  ABC transporter related  67.28 
 
 		 596 aa  814    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483113  normal  0.228237 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3797  ABC transporter related  96.77 
 
 		 620 aa  1179    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  normal  0.145878 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4845  ABC transporter related  59.12 
 
 		 599 aa  699    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4939  ABC transporter related  96 
 
 		 626 aa  1109    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.777528 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0270  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  78.1 
 
 		 669 aa  874    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0233  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  78.1 
 
 		 669 aa  874    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3418  ABC transporter related  60.93 
 
 		 595 aa  672    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  normal  0.0149825 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2930  ABC transporter related  60.55 
 
 		 581 aa  667    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2811  ABC transporter related  62.2 
 
 		 595 aa  697    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.882155 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0953  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  78.59 
 
 		 669 aa  880    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2524  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  78.43 
 
 		 669 aa  879    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265455  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2665  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  78.59 
 
 		 669 aa  880    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3233  ABC transporter related  62.77 
 
 		 599 aa  716    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1637  ABC transporter related  57.05 
 
 		 630 aa  639    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135005  normal  0.475393 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2299  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  100 
 
 		 620 aa  1235    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0515  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  78.84 
 
 		 663 aa  887    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0712  ABC transporter related  66.61 
 
 		 596 aa  801    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0247864  normal  0.335635 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4941  ABC transporter related  69.95 
 
 		 604 aa  838    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.690923  normal  0.361162 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5449  ABC transporter related  79.3 
 
 		 622 aa  889    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89957  normal  0.0448259 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6143  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  67.68 
 
 		 603 aa  793    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2182  ABC transporter related  63.51 
 
 		 600 aa  740    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3727  ABC transporter related  96.77 
 
 		 620 aa  1179    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal  0.56235 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1248  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  81.2 
 
 		 625 aa  962    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0276  ABC transporter related  71.38 
 
 		 601 aa  848    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3404  ABC transporter related  62.96 
 
 		 600 aa  753    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00337035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0198  ABC transporter  66.39 
 
 		 572 aa  787    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1612  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  78.1 
 
 		 669 aa  874    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.658136  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3687  ABC transporter related  95 
 
 		 620 aa  1150    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4566  ABC transporter related  96.77 
 
 		 620 aa  1179    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3039  ABC transporter related  61.86 
 
 		 595 aa  672    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6186  multidrug ABC transporter ATPase/permease  60.75 
 
 		 605 aa  701    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159052  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2875  ABC transporter related  81.53 
 
 		 625 aa  969    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216771  normal  0.111784 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1416  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  78.1 
 
 		 669 aa  874    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5523  ABC transporter related  95.16 
 
 		 620 aa  1152    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0553  ABC transporter related  49.4 
 
 		 598 aa  548  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0356  ABC transporter related  50.7 
 
 		 596 aa  533  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4093  ABC transporter related  49.33 
 
 		 585 aa  525  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5858  ABC transporter related  41.57 
 
 		 591 aa  492  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0591  ABC transporter related  46.03 
 
 		 593 aa  490  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179629 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  36.79 
 
 		 643 aa  333  8e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  37.35 
 
 		 623 aa  331  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.82 
 
 		 621 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2146  ABC transporter related  36.03 
 
 		 609 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31543  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  36.55 
 
 		 630 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4271  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  35.87 
 
 		 637 aa  327  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  35.88 
 
 		 663 aa  326  9e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  35.88 
 
 		 636 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1135  ABC transporter related  36.36 
 
 		 637 aa  325  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1159  ABC transporter related  36.36 
 
 		 637 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1463  ABC transporter related  40.85 
 
 		 597 aa  322  9.999999999999999e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1542  ABC transporter related  36.45 
 
 		 621 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264596  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0680  ABC transporter related  36.2 
 
 		 637 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1764  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.01 
 
 		 621 aa  319  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  37.77 
 
 		 603 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2753  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.01 
 
 		 621 aa  319  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2871  ABC transporter ATP binding protein  36.01 
 
 		 621 aa  319  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2441  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.01 
 
 		 621 aa  319  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2813  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.01 
 
 		 621 aa  319  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2840  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.01 
 
 		 621 aa  319  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  38.15 
 
 		 655 aa  318  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2203  ABC transporter related  35.65 
 
 		 567 aa  318  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0054  hypothetical protein  33.44 
 
 		 597 aa  317  3e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.63 
 
 		 595 aa  317  4e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3044  ABC transporter related  38.33 
 
 		 637 aa  317  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.989361  normal  0.444628 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  38.29 
 
 		 603 aa  317  5e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  37.35 
 
 		 603 aa  315  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0567  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.89 
 
 		 589 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2780  ABC transporter related  39 
 
 		 637 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2782  putative fused ATP-binding/permease protein  35.61 
 
 		 587 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.896144  normal  0.282624 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.37 
 
 		 598 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0126222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2782  ABC transporter related  36.53 
 
 		 618 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.292223 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2343  ABC transporter related  36.05 
 
 		 591 aa  311  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  0.0107518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0417  ABC transporter related  35.2 
 
 		 587 aa  311  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  39.29 
 
 		 617 aa  310  4e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1494  ABC transporter related  36.75 
 
 		 647 aa  309  9e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0391  ABC transporter-related protein  35.7 
 
 		 630 aa  309  9e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00324467 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  36.41 
 
 		 587 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3046  ABC transporter related  35.91 
 
 		 618 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.752635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5208  ABC transporter related  38.12 
 
 		 663 aa  307  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.670373  normal  0.309398 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1768  ABC transporter related  34.28 
 
 		 622 aa  307  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1113  ABC transporter related  36.65 
 
 		 646 aa  307  4.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2163  hypothetical protein  32.19 
 
 		 610 aa  307  5.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0597  ABC transporter related  35.29 
 
 		 596 aa  306  6e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0644  ABC transporter related  50.78 
 
 		 646 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.601366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4741  ABC transporter related  37.93 
 
 		 662 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.616952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3356  ABC transporter related  35.12 
 
 		 594 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0405132  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0754  ABC transporter, ATP-binding protein  35.12 
 
 		 596 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  35.74 
 
 		 629 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2190  hypothetical protein  32.36 
 
 		 610 aa  303  4.0000000000000003e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3526  ABC transporter related  34.95 
 
 		 598 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3223  ABC transporter related  38.52 
 
 		 620 aa  303  6.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0689  ABC transporter related  37.13 
 
 		 644 aa  303  8.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366434  normal  0.23371 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  36.07 
 
 		 640 aa  303  9e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2194  ABC transporter related  36.87 
 
 		 624 aa  302  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.290194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2174  ABC transporter related  40.88 
 
 		 627 aa  302  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1765  putative multidrug export ATP-binding/permease protein  37.2 
 
 		 611 aa  302  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.193785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6620  ABC transporter related  35.03 
 
 		 587 aa  301  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00971242  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0327  ABC transporter, transmembrane region  34.47 
 
 		 587 aa  301  3e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0682  ABC transporter related  36.51 
 
 		 606 aa  301  3e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5775  ABC transporter related  38.03 
 
 		 617 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.832359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>