More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0712 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2665  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  65.51 
 
 		 669 aa  739    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0712  ABC transporter related  100 
 
 		 596 aa  1202    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0247864  normal  0.335635 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0233  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  65.17 
 
 		 669 aa  736    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3418  ABC transporter related  59.28 
 
 		 595 aa  674    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  normal  0.0149825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6186  multidrug ABC transporter ATPase/permease  59.66 
 
 		 605 aa  700    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159052  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0953  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  65.51 
 
 		 669 aa  739    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0198  ABC transporter  64.31 
 
 		 572 aa  756    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0270  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  65.17 
 
 		 669 aa  736    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2299  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  66.61 
 
 		 620 aa  805    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3233  ABC transporter related  58.38 
 
 		 599 aa  696    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2930  ABC transporter related  59.2 
 
 		 581 aa  672    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0515  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  64.84 
 
 		 663 aa  745    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4941  ABC transporter related  66 
 
 		 604 aa  805    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.690923  normal  0.361162 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5449  ABC transporter related  65.72 
 
 		 622 aa  749    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89957  normal  0.0448259 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2182  ABC transporter related  60.72 
 
 		 600 aa  720    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7111  ABC transporter related  90.94 
 
 		 596 aa  1068    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483113  normal  0.228237 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1248  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  69.78 
 
 		 625 aa  842    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1612  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  65.17 
 
 		 669 aa  736    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.658136  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4939  ABC transporter related  67.58 
 
 		 626 aa  797    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.777528 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3727  ABC transporter related  66.78 
 
 		 620 aa  812    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal  0.56235 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3404  ABC transporter related  59.42 
 
 		 600 aa  722    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00337035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6143  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  64.36 
 
 		 603 aa  772    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1416  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  65.17 
 
 		 669 aa  736    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4566  ABC transporter related  66.78 
 
 		 620 aa  812    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2875  ABC transporter related  69.45 
 
 		 625 aa  842    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216771  normal  0.111784 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2524  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  65.34 
 
 		 669 aa  738    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265455  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3039  ABC transporter related  60.65 
 
 		 595 aa  693    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0276  ABC transporter related  67.62 
 
 		 601 aa  810    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3687  ABC transporter related  67.11 
 
 		 620 aa  811    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2811  ABC transporter related  59.97 
 
 		 595 aa  701    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.882155 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4845  ABC transporter related  61.16 
 
 		 599 aa  733    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3797  ABC transporter related  66.78 
 
 		 620 aa  812    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  normal  0.145878 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5523  ABC transporter related  67.11 
 
 		 620 aa  810    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1637  ABC transporter related  54.49 
 
 		 630 aa  619  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135005  normal  0.475393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0553  ABC transporter related  48.98 
 
 		 598 aa  554  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4093  ABC transporter related  49.57 
 
 		 585 aa  531  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0356  ABC transporter related  48.62 
 
 		 596 aa  522  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0591  ABC transporter related  46 
 
 		 593 aa  503  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179629 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5858  ABC transporter related  41.51 
 
 		 591 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2203  ABC transporter related  37.9 
 
 		 567 aa  354  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.77 
 
 		 595 aa  337  2.9999999999999997e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.54 
 
 		 598 aa  327  3e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0126222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.14 
 
 		 621 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  35.57 
 
 		 603 aa  324  3e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  39.12 
 
 		 643 aa  323  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0054  hypothetical protein  33.01 
 
 		 597 aa  322  9.000000000000001e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2753  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.73 
 
 		 621 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2813  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.73 
 
 		 621 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0567  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38 
 
 		 589 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2871  ABC transporter ATP binding protein  37.73 
 
 		 621 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2840  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.73 
 
 		 621 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1764  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.73 
 
 		 621 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2441  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.73 
 
 		 621 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4271  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  35.06 
 
 		 637 aa  319  7e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  36.11 
 
 		 623 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  35.22 
 
 		 603 aa  317  6e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  35.94 
 
 		 587 aa  316  7e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2146  ABC transporter related  35.07 
 
 		 609 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31543  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1463  ABC transporter related  36.9 
 
 		 597 aa  313  3.9999999999999997e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1159  ABC transporter related  34.3 
 
 		 637 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1135  ABC transporter related  34.3 
 
 		 637 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  34.47 
 
 		 663 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  34.75 
 
 		 633 aa  312  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  37.75 
 
 		 630 aa  312  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  37.71 
 
 		 636 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0680  ABC transporter related  34.13 
 
 		 637 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  35.99 
 
 		 612 aa  309  9e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  35.99 
 
 		 612 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2343  ABC transporter related  35.29 
 
 		 591 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  0.0107518 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0067  hypothetical protein  40.81 
 
 		 599 aa  308  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1273  ABC-type transport system ATPase  35.86 
 
 		 622 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.788537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7080  ABC transporter related  41.78 
 
 		 621 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.161763  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1585  hypothetical protein  40.37 
 
 		 593 aa  306  5.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6140  ABC transporter related  34.68 
 
 		 617 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5775  ABC transporter related  34.68 
 
 		 617 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.832359  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1408  hypothetical protein  39.2 
 
 		 594 aa  306  8.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6620  ABC transporter related  35.02 
 
 		 617 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.349027  normal  0.153247 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2163  hypothetical protein  33.44 
 
 		 610 aa  305  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6225  ABC transporter related  40.53 
 
 		 624 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2194  ABC transporter related  35.34 
 
 		 624 aa  303  5.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.290194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1768  ABC transporter related  34.4 
 
 		 622 aa  303  6.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7674  ABC efflux pump, ATPase subunit  35.27 
 
 		 617 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22456  normal  0.131905 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  35.43 
 
 		 612 aa  302  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1542  ABC transporter related  39.96 
 
 		 621 aa  302  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264596  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2190  hypothetical protein  33.22 
 
 		 610 aa  300  7e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  35.92 
 
 		 612 aa  300  7e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1260  hypothetical protein  33.33 
 
 		 582 aa  299  1e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.678722 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1912  ABC transporter related  34.97 
 
 		 604 aa  298  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  35.53 
 
 		 617 aa  298  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3490  ATPase  35.6 
 
 		 614 aa  298  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2714  ABC transporter related  36.87 
 
 		 623 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2102  ABC transporter related  36.87 
 
 		 623 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0975  ABC transporter related  36.02 
 
 		 626 aa  298  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0616  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  34.56 
 
 		 591 aa  297  3e-79  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.146496  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0957  hypothetical protein  38.75 
 
 		 593 aa  298  3e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0391  ABC transporter-related protein  34.63 
 
 		 630 aa  297  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00324467 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2741  ABC transporter related  36.87 
 
 		 623 aa  297  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1765  putative multidrug export ATP-binding/permease protein  38.3 
 
 		 611 aa  296  5e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.193785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1622  ABC transporter related  35.86 
 
 		 621 aa  296  6e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327918  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0939  ABC transporter-related protein  34.39 
 
 		 590 aa  296  6e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>